Ansökan: Intelligent evolution av en ny generation sonderingstekniker via massiv parallell DNA-syntes och sekvensering

Tidsperiod:

1 januari 2014 – 31 december 2016

Projektledare:

Rachel Yuan Nong

Finansiär:

Vetenskapsrådet

Bidragstyp:

Projektbidrag

Budget:

3 150 000 SEK

Framtida medicinska analyser kommer att kräva omfattande och snabba analyser av vitt skilda molekylära enheter för att bättre kunna definiera celltillstånd, t.ex. stemness, eller sjukdomstillstånd, t.ex. cancersignaturer. Det föreslagna projektet kommer kombinera maskininlärning, massivt parallell DNA-syntes och sekvenseringstekniker för att 1) bygga en ny klass sonder och analyser för simultan detektering eller avbildning av ett brett spektrum molekylära händelser på encellsnivå eller i mycket små prov med förbättrad kinetik, specificitet och sensitivitet, 2) med hjälp av "intelligent evolution" ta fram en systematisk och ekonomisk metod för att utveckla bättre molekyler och metoder för tillämpning inom höggenomströmningsbiologisk forskning och diagnostik 3) utforska de ovanstående metoderna för att förbättra chanserna för affinitetsbindarsyntes att möjliggöra en produktionslinje för höggenomströmningsbiologi.

De nyutvecklade verktygen kommer utöka de tekniska möjligheterna att 1) inhämta flerdimensionell biologisk information från enstaka celler eller begränsade, värdefulla prover, 2) öka känsligheten i detektionen för att så småningom tillåta undersökningar av enskilda molekyler i komplexa biologiska system och 3) få en snabb och ekonomisk tillverkning av affinitetsreagenser för upptäckt och tillämpning av nya kandidatmarkörer för individuell diagnostik och behandling.