SpatioOmics: The next-generation spatial omics technology

Tidsperiod:

1 november 2023 – 8 oktober 2024

Projektledare:

Ammar Zaghlool

Finansiär:

Vinnova

Bidragstyp:

Projektbidrag

Budget:

998 000 SEK

Syfte och mål:

Framsteg inom det spatial omics fältet lovar att utöka vår förståelse av molekylära mekanismer som ligger bakom sjukdom och tillhandahålla molekylära kartor över sjukdomens mikromiljö i vävnader där den patologiska aktiviteten inträffar, avgörande för korrekt diagnos och precisionsbehandling. Tillgängliga spatial omics lider av begränsningar vad gäller känslighet, upplösning och höga kostnader. Syftet med detta projekt är att utveckla SpatioOmics: en nästa-generations spatial omics teknologi som löser begränsningar förknippade med nuvarande metoder.

Förväntade effekter och resultat:

SpatioOmics är en ny teknik för detektion och lokalisering av RNA och andra molekyler i celler och vävnader med syfte att ge djupare och mer omfattande insikter om cellers normala funktion och hur sjukdomar utvecklas. Metoden kombinerar avläsning och lokalisering av genuttryck i och andra viktiga cellulära markörer i enskilda celler utan kostnadskrävande reagenser eller utrustning, och förhoppningen är därför att denna typ av studier blir tillgängliga för fler forskningslabb och på längre sikt banar väg för implementering av nya vetenskapliga framsteg i vården.

Upplägg och genomförande:

Utvecklingen av SpatioOmics-teknologin kommer att genomföras vid Institutionen för immunologi, genetik och patologi (IGP), SciLifeLab vid Uppsala universitet. Utvecklingsplanen är uppdelad i två sektioner 1) Wetlabet, där Dr Ammar Zaghlool kommer att leda projektets design och experimentella arbete med stöd av en postdoktor som kommer att allokeras till projektet, 2) Programvaruutvecklingen kommer att ledas av National Bioinformatic Infrastructure vid SciLifeLab (NBIS). Både postdoktor och NBIS verksamhet ska finansieras av Vinnova.