Mekanismer för proteinsyntes i bakterier och protozoer med struktur och funktion

Tidsperiod:

1 januari 2024 – 31 december 2027

Projektledare:

Suparna Sanyal

Finansiär:

Vetenskapsrådet

Bidragstyp:

Projektbidrag

Budget:

3 800 000 SEK

Ribosomer är cellens proteinfabriker som översätter den genetiska koden från mRNA till proteiner. Denna process kallas "translation". Proteinsyntes är en viktig hushållning aktiviteten hos alla levande celler och ofta inriktat på läkemedel mot bakterier och patogena protozoer. Därför att studera proteinsyntes processen i molekylär nivå är så viktigt. Vi kan lära oss om skillnaderna i proteinsyntesprocess mellan bakterier, protozoer och oss människor med sådan forskning.Biokemi och strukturell biologi är två viktiga verktyg för att studera mekanismerna för proteinsyntesen. För det har vi samlat proteinsyntessystem i provröret. Dessa är ganska komplexa system som innehåller ribosomer, tRNA, mRNA, alla translationsfaktorer och enzymer som laddar tRNA med aminosyror. Snabb kinetik med `Quench-Flow’ och `Stopped-flow’ ger information om hastigheterna för olika steg av proteinsyntes. Parallellt ger kryo-elektronmikroskopi högupplösta strukturer; de gör processerna synliga. Dessa kompletterar varandra och är därför lika viktiga.I detta projekt vill vi att karakterisera mekanismerna för utvalda aminoglykosidantibiotika. Särskilt intresse är att testa fluorerade aminoglykosider på aminoglykosidresistenta bakteriella ribosomer såväl som på Giardia-ribosomer. Kombination av två olika antibiotiket kommer också att testas. Vi kommer också att studera hur proteinsyntesen startar i Giardia och hur den stängs av under cystbildning.Våra resultat kommer att berika grundläggande kunskap om proteinsyntes och kan hjälpa till att utveckla behandling för bakteriella och protozoala infektioner. Detta kan ha stor inverkan på global hälsa.