Bioinformatiker i genomik

Publicerad: 2021-02-18

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 45 000 studenter, mer än 7 000 anställda och en omsättning på cirka 7 miljarder kronor.

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Institutionens forskning bedrivs inom tre samverkande och delvis interagerade sektioner; cancer, infektioner och immunitet samt genetik och genomik. En närmare beskrivning finns på http://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/.

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; http://nbis.se) främjar svensk livsvetenskaplig forskning genom att tillhandahålla bioinformatisk expertis och programmeringskompetens till forskare. Organisationen är nationell, med över 100 bioinformatiker, systemutvecklare och data stewards anställda på ett flertal svenska universitet.  NBIS utgör också bioinformatikplattformen på SciLifeLab (http://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna. Genom nära samarbete med de dataproducerande faciliteterna och med ledande forskargrupper har NBIS enastående möjligheter att erbjuda bioinformatiska analyser av högsta klass.

NBIS söker nu en ny medarbetare (placerad på IMBIM) som ska stödja svenska forskare med genombaserad bioinformatik (genomik). Personen kommer att jobba i vårt assembly och annoteringsteam och ha möjlighet att delta även i stora internationella satsningar som ”Earth Biogenome Project”. Positionen är placerad vid Uppsala Universitet i Navet, SciLifeLabs Uppsala-nod. I denna kreativa miljö finns över 40 bioinformatiker, flera core-faciliteter och många olika forskargrupper representerade.

När du jobbar för NBIS är du en del av ett team, du kommer inte vara ensam. Med många kunniga kollegor att bolla med, ett brett utbud av interna kurser och möjlighet att lära sig från alla spännande supportprojekt, ger en anställning hos NBIS mycket goda möjligheter att utvecklas som bioinformatiker. Vi välkomnar ansökningar från alla erfarna bioinformatiker, även från de som saknar erfarenhet av genomannotering. Det kommer att finnas möjligheter och stöd för att lära sig.

Arbetsbeskrivning: Arbetet kommer att fokusera på betald bioinformatisk support till svenska forskare. Arbetsuppgifter kommer att inkludera annotering av eukaryota genom, men kan också beroende på sökandes kompetens inkludera annan sekvensbaserad bioinformatik, eller programmering. Ansvarsområden inkluderar analyser av data, kundkommunikation, eget lärande om nya metoder, rapportskrivande och undervisning.

Kvalifikationskrav: En doktorstitel i bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande. Gedigen och dokumenterad erfarenhet av sekvens-baserad bioinformatik (DNA eller RNA) och god förmåga att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö. Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare med mycket olika bakgrund. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet såsom flexibilitet, förmåga att lösa problem och öppenhet för att lära sig nya metoder.

Meriterande: Arbetsuppgifterna kan potentiellt innebära underhåll och utveckling av skript som används i stora annoteringsprojekt, så erfarenhet av ett eller flera skriptspråk (python/perl) och även systemadministration ses som positivt. Erfarenhet av genombaserad bioinformatik på icke modell-organismer, t.ex. genomannotering, populationsgenomik, komparativ genomik, eller genom-assembly är meriterande.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidare. 6 månader provanställning tillämpas.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar: För allmänna frågor om NBIS, kontakta Professor Bengt Persson, bengt.persson@nbis.se. För mer specifika frågor om arbetsuppgifter kontakta Avdelningschef Dr. Henrik Lantz, henrik.lantz@nbis.se.

Välkommen med din ansökan senast den 22 mars 2021, UFV-PA 2021/568.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.