Carolina Wählby har öga för bilder
Efter 2,5 år på Broad Institute i USA är forskaren Carolina Wählby åter i Uppsala. Hon har just nu fullt upp med att nyanställa personal och bygga upp en ny egen forskningsgrupp inom ramen för SciLifeLab.
Hennes forskningsområde är avancerad digital bildanalys.
– Det är fascinerande med bilder, mikroskopibilder erbjuder en helt ny värld när det gäller form och mönster och bilder är lätta att kommunicera. Målet med digital bildanalys är att få datorn att tolka bilder objektivt och kvantitativt – att få ut information som människans egna ögon och hjärna inte alltid kan mäta på ett kvantitativt sätt, berättar Carolina.
I sin forskning utvecklar hon metoder för analys av mikroskopibilder av bland annat celler och vävnad.
– Det är allt från att mäta hur celler reagerar på olika former av stimulans till att bestämma sekvensen på RNA-molekyler i cancervävnad.
I ett av projekten använder hon masken C. elegans som modellsystem för infektionssjukdomar hos människan. Masken är bara 1 millimeter lång och har många organsystem som liknar människans.
– Vi infekterar maskarna med samma bakterier som gör människor sjuka, behandlar dem med tusentals olika möjliga läkemedel, och använder sedan automatiserad bildanalys för att avgöra vilka ämnen som gör att maskarna återhämtar sig från infektionen.
Hon berättar att det finns en oerhörd potential med den tekniken de använder, till exempel för att leta efter nya läkemedel mot bakterier som utvecklat antibiokitaresistens. I en screen av 37 000 potentialla läkemedel hittade de sex helt nya substanser.
Susanna Eriksson