Topputrustning ska förbättra identifieringen av sjukdomsgener

SNP-plattformen vid Uppsala universitet har beviljats ett anslag på 5,5 miljoner kronor till ny teknologi för analys av genetiska sekvensvariationer. Tekniken ska bland annat användas för att identifiera gener som förorsakar hjärt- och kärlsjukdomar, i ett projekt som blir det största någonsin inom sjukdomsgenetiken i Sverige. Anslaget kommer från Knut och Alice Wallenbergs stiftelse. För ungefär ett år sedan blev det möjligt att utföra analyser av hundratusentals SNP-markörer, dvs variationer av enskilda DNA-baser över hela människans genom. SNP-plattformen i Uppsala hör till de ledande genotypningslaboratorierna i Europa, och nu ska tekniken bli ännu bättre. Anslaget kommer att användas dels till att automatisera SNP-analyserna av hela genomet, dels till helt ny utrustning för mycket effektiv DNA-sekvensanalys. Ett nytt datalagringssystem kommer även att etableras för lokal hantering av de stora mängder data som produceras i analyserna. Forskargruppen, som leds av professor Ann-Christine Syvänen, kommer att använda SNP-analyserna av hela genomet för att kartlägga de gener eller genomregioner som innehåller sjukdomsgener. Med hjälp av den nya utrustningen för DNA-sekvensanalys kommer forskarna sedan att kunna analysera de identifierade genomregionerna i detalj i hundratals patienter, för att hitta de genvarianter som utgör riskfaktorer för sjukdomar. Den nya tekniken gör det möjligt att analysera DNA från hundratals patienter i ett enda experiment till en överkomlig kostnad. - Den nya teknologin för DNA-sekvensning kommer att bli ett genombrott för identifiering av generna bakom våra folksjukdomar. Inom en överskådlig framtid kommer vi sannolikt att kunna utföra sekvensanalys av hela genomet hos många individer, berättar Ann-Christine Syvänen. Det första projektet som den nya utrustningen vid SNP-plattformen kommer att utnyttjas i ska identifiera gener som förorsakar hjärt- och kärlsjukdomar. Projektet, som kommer att bli det största inom sjukdomsgenetiken någonsin i Sverige, är ett samarbetsprojekt mellan Ann-Christine Syvänens forskargrupp i molekylär medicin vid institutionen för medicinska vetenskaper och en grupp vid Karolinska Institutet. - Vi tror att det kommer att finnas ett mycket stort intresse bland forskarna i Sverige och de andra nordiska länderna för de nya servicemöjligheter som SNP-teknologiplattformen nu kan erbjuda. Den nya tekniken för sekvensanalys kan tillämpas på alla organismer och även användas för flera andra ändamål än identifiering av sjukdomsgener, säger Ann-Christine Syvänen. Läs mer om SNP-plattformen på http://www.genotyping.se För mer information, kontakta professor Ann-Christine Syvänen, 018-611 29 59, e-post: Ann-Christine.Syvanen@medsci.uu.se Länk till pressmeddelande med eventuella bilder: http://info.uu.se/press.nsf/pm/topputrustning.ska.id63C.html Pressinformatör Johanna Blomqvist E-post johanna.blomqvist@uadm.uu.se Telefon: 018-471 19 32 Mobil: 070-425 08 64 Fax: 018-471 15 20 Adress: Box 256, 751 15 Uppsala