Mikrobiell och kemisk genetik
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG330
Kursen är avvecklad.
- Kod
- 1BG330
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1N, Teknik A1N
- Betygsskala
- Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 15 mars 2007
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
Kandidatexamen. Alt. 1) 40 p/60 hp biologi och 20 p/30 hp kemi alt. 2) kemi 40 p/60 hp inkl. Biokemi 10 p/15 hp och biologi 20 p/30 hp inklusive molekylärgenetik 10 p/15 hp.
Mål
Genom kursen i mikrobiell och kemisk genetik skall studenten uppnå fördjupad kunskap om hur processer i celler regleras av RNA och proteiner, och hur regleringen kan påverkas såväl med vanliga genetiska metoder som genom kemisk förändring av reglerande molekyler. Efter genomgången kurs skall studenten kunna
- skilja mellan klassiskt genetiska och kemiskt genetiska tillvägagångssätt, och mellan genotypbaserade och fenotypbaserade genetiska metoder.
- jämföra och värdera möjligheter och begränsningar med olika mikrobiella system för genetiska studier av komplexa fenotyper
- utvärdera praktiska tillämpningar av klassisk och kemisk genetik vid identifiering av nya mål för läkemedel och nya modellföreningar (drug leads) samt för att utveckla nya modellföreningar
- förklara och kontrastera hur genuttrycket kontrolleras av såväl proteiner som små molekyler inklusive reglerande RNA-molekyler
- förstå och förklara hur man kan lösa biologiska problem med metoder från såväl klassisk som kemisk genetik
- tillämpa ett vetenskapligt arbetssätt i planering, utförande, redovisning och tolkning av avancerade kemisk-genetiska experiment som adresserar en för forskning aktuell problemställning, kritisk granska resultaten och generera testbara hypoteser utifrån dessa
- kritiskt analysera vetenskaplig litteratur i området
- presentera och försvara sammanfattningar baserade på originallitteratur i området
Innehåll
Kemisk genetik utnyttjar små molekyler för att förändra genprodukters (proteiner och RNA) sätt att arbeta, direkt i realtid i stället för indirekt genom påverkan på kodande gener, till skillnad från klassisk genetik där mutationer i gener utnyttjas som ett redskap för att förstå sambandet mellan genotyp och fenotyp. Kemisk genetik används för att identifiera vilka proteiner eller RNA som reglerar olika biologiska processer, för att förstå molekylära detaljer i hur proteiner och RNA utför sina biologiska funktioner och för att identifiera små molekyler som kan ha medicinskt intresse. Kursen inkluderar såväl små RNA-molekyler som andra molekyler vilka interagerar med RNA eller proteiner, och omfattar tillämpningar av både klassisk och kemisk genetik med utgångspunkt i fenotyper (vad är de underliggande genetiska förändringarna?) såväl som genotyper (vilken fenotyp orsakas av denna DNA-sekvens?).
Studenten uppnår målen genom att tillägna sig kunskap om
- klassisk och kemisk genetik tillämpad vid analys av olika mikrobiella systemmekanismer för reglering av genaktivitet, särskilt med hjälp av små RNA-molekyler
- användning av klassisk och kemisk genetik vid utveckling av nya läkemedel
- små RNA-molekylers struktur och aktivitet
och genom
- aktivt deltagande i seminarier där vetenskapliga originalpublikationer analyseras
- en muntlig presentation inom ett för kursen relevant område
- aktivt deltagande i laborationer där metoder i kemisk genetik kommer till användning
- noggranna laborationsrapporter
Såväl teoretiskt som praktiskt innehåll förbereder för fördjupade studier i ämnet liksom för yrkesverksamhet t.ex. i bioteknisk produktion och utveckling av läkemedel.
Delkurser: Laborationer 3 hp; Seminarier 4 hp; Teori 8 hp.
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, gruppövningar, webbaserade uppgifter, seminarier och laborationer. Deltagande i seminarier, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning är obligatorisk. Kursen ges eventuellt på engelska.
Examination
Examinationen omfattar delmomenten Laborationer (3 hp), Seminarier (4 hp) och teoritentamen (8 hp) För godkänt slutbetyg krävs godkända laborationer redovisade enligt riktlinjerna, godkänd seminariepresentation och aktivt deltagande i seminarier samt godkänt resultat på skriftlig tentamen