Mikrobiell och kemisk genetik

15 hp

Kursplan, Avancerad nivå, 1BG330

Det finns en senare version av kursplanen.
Kod
1BG330
Utbildningsnivå
Avancerad nivå
Huvudområde(n) med fördjupning
Biologi A1N, Teknik A1N
Betygsskala
Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
Fastställd av
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 6 maj 2009
Ansvarig institution
Institutionen för biologisk grundutbildning

Behörighetskrav

120 hp. Alt. 1) 60 hp biologi och 30 hp kemi alt. 2) kemi 60 hp inkl. Biokemi 15 hp och biologi 30 hp inklusive molekylärgenetik 15 hp.

Mål

Genom kursen i mikrobiell och kemisk genetik skall studenten uppnå fördjupad kunskap om hur processer i celler regleras av RNA och proteiner, och hur regleringen kan påverkas såväl med vanliga genetiska metoder som genom kemisk förändring av reglerande molekyler.

Efter godkänd kurs skall studenten kunna:

  • skilja mellan klassiskt genetiska och kemiskt genetiska tillvägagångssätt, och mellan genotypbaserade och fenotypbaserade genetiska metoder.
  • jämföra och värdera möjligheter och begränsningar med olika mikrobiella system för genetiska studier av komplexa fenotyper
  • utvärdera praktiska tillämpningar av klassisk och kemisk genetik vid identifiering av nya mål för läkemedel och nya modellföreningar (drug leads) samt för att utveckla nya modellföreningar
  • förklara och kontrastera hur genuttrycket kontrolleras av såväl proteiner som små molekyler inklusive reglerande RNA-molekyler
  • förklara hur man kan lösa biologiska problem med metoder från såväl klassisk som kemisk genetik
  • tillämpa ett vetenskapligt arbetssätt i planering, utförande, redovisning och tolkning av avancerade kemisk-genetiska experiment som adresserar en för forskning aktuell problemställning, kritiskt granska resultaten och generera testbara hypoteser utifrån dessa
  • redogöra för RNA-molekylernas biologi och kemi
  • kritiskt analysera vetenskaplig litteratur i området
  • presentera och försvara sammanfattningar baserade på originallitteratur i området

Innehåll

Kemisk genetik utnyttjar små molekyler för att förändra genprodukters (proteiner och RNA) sätt att arbeta, direkt i realtid i stället för indirekt genom påverkan på kodande gener, till skillnad från klassisk genetik där mutationer i gener utnyttjas som ett redskap för att förstå sambandet mellan genotyp och fenotyp. Kemisk genetik används för att identifiera vilka proteiner eller RNA som reglerar olika biologiska processer, för att förstå molekylära detaljer i hur proteiner och RNA utför sina biologiska funktioner och för att identifiera små molekyler som kan ha medicinskt intresse. Kursen inkluderar såväl små RNA-molekyler som andra molekyler vilka interagerar med RNA eller proteiner, och omfattar tillämpningar av både klassisk och kemisk genetik med utgångspunkt i fenotyper (vad är de underliggande genetiska förändringarna?) såväl som genotyper (vilken fenotyp orsakas av denna DNA-sekvens?).

Studenten uppnår målen genom att tillägna sig kunskap om

  • klassisk och kemisk genetik tillämpad vid analys av olika mikrobiella systemmekanismer för reglering av genaktivitet, särskilt med hjälp av små RNA-molekyler
  • RNA-molekylens biologi och kemi
  • användning av klassisk och kemisk genetik vid utveckling av nya läkemedel små RNA-molekylers struktur och aktivitet och genom
  • aktivt deltagande i seminarier där vetenskapliga originalpublikationer analyseras
  • en muntlig presentation inom ett för kursen relevant område
  • aktivt deltagande i laborationer där metoder i kemisk genetik kommer till användning
  • att föra laborationsjournal Såväl teoretiskt som praktiskt innehåll förbereder för fördjupade studier i ämnet liksom för yrkesverksamhet t.ex. i bioteknisk produktion och utveckling av läkemedel. Delkurser: Laborationer 2 hp; Seminarier /Symposium 3 hp; Teori 10 hp.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, gruppövningar, webbaserade uppgifter, seminarier, ett litteratursymposium och laborationer. Deltagande i seminarier, symposium, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning är obligatorisk. Kursen ges eventuellt på engelska.

Examination

Examinationen omfattar delmomenten laborationer (2 hp), seminarier och symposium (3 hp) och teoritentamen (10 hp). För godkänt slutbetyg krävs godkända laborationer redovisade enligt riktlinjerna, godkänd seminarie- och symposiepresentation och aktivt deltagande i seminarier och symposium samt godkänt resultat på skriftlig tentamen.

FÖLJ UPPSALA UNIVERSITET PÅ

Uppsala universitet på facebook
Uppsala universitet på Instagram
Uppsala universitet på Youtube
Uppsala universitet på Linkedin