Behörighetskrav

Alt. 1) biologi 50 p motsv. basblocket i biologi och kemi 20 p; alt. 2) kemi 40 p inkl. Biokemi MN1 och biologi 30 p motsv. Organismernas evolution och mångfald NV1, 10 p, Genetik och genteknik NV1, 10 p, samt Fysiologi NV1, 10 p; alt. 3) kemi 40 p inkl. Biokemi MN1 och Biokemi MN2 och biologi 20 p motsv. Organismernas evolution och mångfald NV1, 10 p samt Fysiologi NV1, 10 p. För samtliga alternativ krävs genomgången kurs i Evolutionär genetik MN1, 10 poäng eller annan genetikkurs 10 p på C-nivå.

Syfte

För att förstå hur variation på DNA-nivå översätts till adaptiv variation på individnivå, krävs en kombination av populationsgenetik och funktionsgenomik.

Studeten skall kunna redogöra för populationsgenetiska frågeställningar samt jämföra, diskutera och använda principer och arbetsmetoder inom funktionsgenomik. Tyngdpunkten ligger på applikationer inom organism- och genomevolution, naturvårdsbiologi och biodiversitetsforskning. Efter kursen skall studenten självständigt kunna planera, genomföra, utvärdera och redovisa problembaserade projektarbeten, där studenterna genomför ett verkligt forskningprojekt från början (planering) till slut (presentation av resultat.

Innehåll

Evolutionär genetik: teorin utveckling, de grundläggande evolutionära faktorerna (mutation, drift, selektion, rekombination).

Genetisk diversitet: genetisk variation inom och mellan populationer, gene-genealogier (drift och coalescent), spridning och genflöde, populationstruktur, "linkage disequilibrium", inavel och inavelsdepression, bevarandegenetik, analys av DNA-sekvenser, jämförande metoder.

Kvantitativ genetik: kvantitativ genetik i naturliga och experimentella populationer, molekylär bakgrund till kvantitativ variation (QTL).

Jämförande genomik: genomevolution, överföring av information från modellorganismer.

Functionsgenomik: Identifiering av gener som påverkar adaptiva egenskaper (QTL kartering, associations-kartering, SNPs, genuttryck, "forward" och "reverse genetics"), genreglering i fenotypisk variation och evolution.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer, seminarier, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten. Deltagande i laborationer, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten är obligatoriskt. Kursen ges eventuellt på engelska.

Examination

Kursen innefattar två skriftliga prov. För att kursen skall bedömas med betyget godkänd eller väl godkänd fordras att laborationer, projektarbeten och litteraturuppgifter bedömts godkända.