Röntgenkristallografi
Kursplan, D-nivå, 1MB351
Kursen är avvecklad.
- Kod
- 1MB351
- Nivå
- D
- Ämne(n)
- Biologi
- Betygsskala
- Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 19 maj 2005
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
Molekylär och statistisk mekanik. Genfunktion. Makromolekylära maskiner. Biokemisk metodik.
Syfte
För att förstå makromolekylers funktion krävs kunskap om den molekylära strukturen. Röntgenkristallografi är den mest kraftfulla teknik som idag är tillgänglig för att få detaljerad information om makromolekylers struktur. Denna kurs är en introduktion till makromolekylär röntgenkristallografi i allmänhet och med särskild inriktning mot kristallografi av proteiner.
Innehåll
Kursen ger en praktisk orientering i röntgenkristallografiska metoder och en introduktion till teorin för kristallografi. Denna omfattar Fouriertransformationer, kristallografi, bestämning av rymdkoordinater, datainsamling och experimentell bestämning av faser (inkluderande metoderna isomorf ersättning, molekylär ersättning och MAD- fasning).
Tolkning av elektrontäthetskartor som tredimensionella strukturer diskuteras liksom metoder att förfina makromolekylära strukturer.
Laborationer: Högupplösande datorgrafik för arbete med makromolekyler och kristallografi. Preparation av proteinkristaller. Uppsamling av diffraktionsdata med tvådimensionella ytdetektorer. Lösning av praktiska kristallografiska problem utgående från diffraktionsdata samlade av kursdeltagarna och forskare vid institutionen för molekylärbiologi.
Undervisning
Föreläsningar och laborationer
Examination
Skriftligt prov vid slutet av kursen. I kursen ingående övningar och laborationer är poängsatta med 1 poäng.
Litteraturlista
Litteraturlista saknas.