Behörighetskrav

Grundläggande bioteknik och bioinformatik. Grundläggande biologi. Cellbiologi. Matematisk statistik.

Syfte

Målet med kursen är att ge kunskap om de typer av biologiska frågeställningar där bioinformatik används som en del av problemlösningen. Kursen skall också ge kunskap om bioinformatisk metodologi och förmåga att analysera och relatera informationen i de stora globala databaserna med biologiska system för att förstå livets processer. Kursen skall ge färdigheter i att applicera och kombinera existerande program och verktyg på frågeställningar givet komplexa biologiska data.

Innehåll

Databaser, deras utformning och sökverktyg. Datorprogram för analyser av DNA-sekvenser och kompletta genom. Jämförelser av annoteringssystem och genprediktionsprogram. Statistiska analyser av sekvens(o)likheter. Fylogenetisk inferens. Microarray-konstruktion, statistiska analyser och progamvaror för visualisering av data från genexpressionsanalyser. Introduktion till proteomik och massspektrometri. Metaboliska databaser och nätverk. Systembiologi.

Undervisning

Föreläsningar, seminarier och datorövningar.

Examination

Skriftligt prov vid kursens slut. För att kursen skall bedömas med

betyget godkänd krävs att litteraturuppgifter och

datorövningar bedömts godkända.