Kursplan för Protein engineering

Protein Engineering

Kursplan

  • 15 högskolepoäng
  • Kurskod: 1BG301
  • Utbildningsnivå: Avancerad nivå
  • Huvudområde(n) och successiv fördjupning: Biologi A1F, Teknik A1F, Tillämpad bioteknik A1F, Kemi A1F

    Förklaring av koder

    Koden visar kursens utbildningsnivå och fördjupning i förhållande till andra kurser inom huvudområdet och examensfordringarna för generella examina:

    Grundnivå
    G1N: har endast gymnasiala förkunskapskrav
    G1F: har mindre än 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    G1E: innehåller särskilt utformat examensarbete för högskoleexamen
    G2F: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    G2E: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav, innehåller examensarbete för kandidatexamen
    GXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras.

    Avancerad nivå
    A1N: har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    A1F: har kurs/er på avancerad nivå som förkunskapskrav
    A1E: innehåller examensarbete för magisterexamen
    A2E: innehåller examensarbete för masterexamen
    AXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras.

  • Betygsskala: Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
  • Inrättad: 2007-03-15
  • Inrättad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Reviderad: 2019-10-25
  • Reviderad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Gäller från: vecka 27, 2020
  • Behörighet: 150 hp inklusive (1) Molekylär cellbiologi eller Genomfunktion eller Molekylärmedicinsk infektionsbiologi eller Genombiologi, eller (2) 30 hp inom Masterprogram i tillämpad bioteknik, Masterprogram i molekylär bioteknik eller Masterprogram i kemi med inriktning mot biokemi.
    Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)
  • Ansvarig institution: Institutionen för biologisk grundutbildning

Mål

Studenterna får under kursen möta ett aktuellt molekylärbiologiskt och genteknologiskt problem. Målet är att ge dem fördjupade kunskaper och färdigheter som gör det möjligt att självständigt finna lösningar och i praktiken genomföra dessa lösningar.
Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

  • analysera proteiners struktur och uppbyggnad med datorbaserade metoder
  • redogöra för proteiners uppbyggnad och klassificering
  • analysera och jämföra proteiners aminosyresekvens och struktur samt relatera denna information till proteiners funktion
  • redogöra för enskilda aminosyrors egenskaper och inverkan på proteiners löslighetsegenskaper, struktur och funktion
  • redogöra för faktorer av betydelse för proteinveckningsprocesser och stabilitet
  • redogöra för hur proteiner kan användas för olika industriella och akademiska ändamål, såsom strukturbestämning, organisk syntes och läkemedelsdesign
  • analysera proteiners renhet och stabilitet och redogöra för hur de kan förvaras på bästa sätt
  • redovisa hur man med biotekniska metoder kan konstruera plasmider för expression av naturliga och modifierade gener
  • planera mutagenesexperiment för att testa proteinstabilitet och/eller funktion
  • konstruera primers för att introducera mutationer med hjälp av PCR
  • genomföra ett PCR-baserat mutagenesexperiment
  • med biokemiska metoder isolera proteiner
  • planera och genomföra aktivitetsmätningar av isolerat protein, samt karaktärisera renhet och stabilitet av proteinet
  • föra en fullständig och informativ laboratoriejournal, som uppvisar förståelse för  GLP-kraven
  • utforma en enkel forskningsplan för en bioteknologisk uppfinning

Innehåll

Föreläsningar och datorbaserade övningar om bioteknologiska metoder och proteiners uppbyggnad, struktur och funktion. Föreläsningar om industriella och andra tillämpningar. Projektbaserade bioteknologiska experimentsom inkluderar produktion och analys av modifierade proteiner.
Studenterna ska genomföra dokumentation av den laborativa delen som motsvarar de krav som de kommer att möta i ett kommande yrkesliv.  Studenten ska även presentera nya lösningar på ett utvalt bioteknologiskt problem.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, gästföreläsningar, seminarier, grupp- och datorövningar samt laborationer. Deltagande i seminarier, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning, gruppövningar, duggor och datorövningar är obligatorisk.

Examination

Delkurser: Teori (7 hp); Praktik (8 hp) 
Teoridelen examineras genom skriftliga prov, samt muntliga och skriftliga uppgifter (7 hp).

Praktikdelen fordrar  en korrekt utförd laboratoriejournal (enligt GLP) och muntliga redovisningar av laborativa experiment (5 hp) samt muntlig redovisning av ett originalforskningsprojekt (3 hp). 
 
Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t ex vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.

Litteratur

Litteraturlista

Gäller från: vecka 27, 2020

  • Walsh, Gary Proteins : biochemistry and biotechnology

    Second edition: Chichester, West Sussex: Wiley Blackwell, 2014

    Rekommenderas

    Se bibliotekets söktjänst

  • Williamson, Michael P. How proteins work

    New York: Garland Science, c2012

    Rekommenderas

    Se bibliotekets söktjänst

Lecture hand-outs and reference literature

Lecture notes