Kursplan för Mikrobiella reglermekanismer

Mål

Kursen fokuserar på de regulatoriska mekanismer som mikrober - främst bakterier - använder

sig av för att möta förändringar i fysiologi eller miljö.

Efter godkänd kurs skall studenten kunna:

• beskriva de speciella livsbetingelser som gäller för bakterier
• redovisa generellt och i mekanistisk detalj hur mikrobers anpassningar till förändrad

  intern och extern miljö åstadkoms genom adaptiva responser

• förklara i detalj hur regleringsmekanismer fungerar på transkriptions- och

  post-transkriptionell nivå

• redovisa för kopplingen mellan omvärldssignalering, molekylära genregleringsvägar

  och fysiologiska responser på cell- eller populationsnivå

• beskriva de extrakromosomala elementens betydelse för genspridning och förvärvande

  av nya egenskaper

• redovisa för plasmiders speciella egenskaper med avseende på stabil nedärvning och

  replikationskontroll

• redovisa den växande betydelsen av RNA-medierad kontroll av genuttryck och

  dess verkningsmekanismer

• sammanfatta, diskutera, värdera och kritiskt analysera deras innehåll och slutsatser i primärartiklar
• kritiskt analysera, tolka och värdera, samt sammanställa erhållna experimentella

  resultat

Innehåll

Bakteriella genregleringsmekanismer som ligger till grund för adaptiva responser. Översikt och fördjupning i den speciella värld som bakterier lever i. Fokus på svältsituationer, bakteriell stress, differentieringsprocesser samt virulens. Krav som den interna och externa miljön ställer på ändrad fenotyp. Sambandet mellan de signaler som mottas av bakterier samt den genreglering som krävs för att möta fysiologiska krav och iscensätta responser. Genregleringsnivåer: transkriptionell reglering (DNA-nivå) med hjälp av aktivator- och repressorproteiner, post-transkriptionell reglering på mRNAnivå, i synnerhet genom regulatoriska RNA och RNA-element in cis (riborelä). Differentiering av bakterier - sporbildning. Bakteriell kommunikation - kvorumreglering. Genöverföring mellan bakterier, den horisontella genpoolen, plasmider och andra extrakromosomala element. RNA-baserad förvärvad immunitet mot invaderande DNA i bakterier och arkéer (CRISPR/cas). Laborationer anknyter till aktuell forskning i fältet.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier, laborationer och studiebesök. Deltagande i seminarier, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning är obligatorisk.

Examination

Skriftligt prov 3 hp, seminarier 1 hp, laborationer 1 hp.

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.