Kursplan för Populationsgenetisk analys

Population Genetic Analysis

Kursplan

  • 5 högskolepoäng
  • Kurskod: 1MB514
  • Utbildningsnivå: Avancerad nivå
  • Huvudområde(n) och successiv fördjupning: Teknik A1F, Biologi A1F, Bioinformatik A1F

    Förklaring av koder

    Koden visar kursens utbildningsnivå och fördjupning i förhållande till andra kurser inom huvudområdet och examensfordringarna för generella examina:

    Grundnivå
    G1N: har endast gymnasiala förkunskapskrav
    G1F: har mindre än 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    G1E: innehåller särskilt utformat examensarbete för högskoleexamen
    G2F: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    G2E: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav, innehåller examensarbete för kandidatexamen
    GXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras.

    Avancerad nivå
    A1N: har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    A1F: har kurs/er på avancerad nivå som förkunskapskrav
    A1E: innehåller examensarbete för magisterexamen
    A2E: innehåller examensarbete för masterexamen
    AXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras.

  • Betygsskala: Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
  • Inrättad: 2011-03-07
  • Inrättad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Reviderad: 2019-02-12
  • Reviderad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Gäller från: vecka 30, 2019
  • Behörighet: 120 hp samt Molekylär evolution eller Evolutionära processer eller Genetisk och molekylär växtbiologi
  • Ansvarig institution: Institutionen för biologisk grundutbildning

Mål

Kursen syftar till att ge kunskap om teori och analysmetoder inom populationsgenetiken.
Efter godkänd kurs skall studenten kunna:

  • lösa biologiska problem med hjälp av populationsgenetiska principer.
  • förklara principerna för populationsgenetiken.
  • identifiera relevanta populationsgenetiska problemställningar och formulera strategier för att lösa problemen.
  • utnyttja tidigare kvantitativa kunskaper (matematik, statistik, programmering) för att lösa genetiska problem.

Innehåll

Kursen börjar med en introduktion där baskunskaper repeteras (nedärvning och mendelsk genetik), därefter följer kursens två huvudblock:

  • Populationsgenetikens principer: allelfrekvenser, allelefrekvensspektrum, kopplingsojämvikt, genetisk diversitet och mått på diversitet, Wright-Fisher-modellen, koalescensteori, inavel, populationsstruktur och selektion.
  • Populationsgenetisk analys: koalescensteori och simuleringar, skattning av parametrar (mutationstakt, rekombinationstakt) och neutralitetstest. Exempel på komplexa modeller.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, räkneövningar och datorövningar.

Examination

Skriftligt prov 4 hp; redovisade analysuppgifter 1 hp..

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t ex vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.

Litteratur

Litteraturlista

Gäller från: vecka 30, 2019

  • Nielsen, Rasmus; Slatkin, Montgomery. An introduction to population genetics : theory and applications

    Sunderland, Mass.: Sinauer Associates, c2013

    Se bibliotekets söktjänst