Kursplan för Bioinformatik - startkurs

Bioinformatics - Starting Course

Det finns en senare version av kursplanen.

Kursplan

  • 15 högskolepoäng
  • Kurskod: 1MB700
  • Utbildningsnivå: Avancerad nivå
  • Huvudområde(n) och successiv fördjupning: Bioinformatik A1N

    Förklaring av koder

    Koden visar kursens utbildningsnivå och fördjupning i förhållande till andra kurser inom huvudområdet och examensfordringarna för generella examina:

    Grundnivå

    • G1N: har endast gymnasiala förkunskapskrav
    • G1F: har mindre än 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    • G1E: innehåller särskilt utformat examensarbete för högskoleexamen
    • G2F: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    • G2E: har minst 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav, innehåller examensarbete för kandidatexamen
    • GXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras

    Avancerad nivå

    • A1N: har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
    • A1F: har kurs/er på avancerad nivå som förkunskapskrav
    • A1E: innehåller examensarbete för magisterexamen
    • A2E: innehåller examensarbete för masterexamen
    • AXX: kursens fördjupning kan inte klassificeras

  • Betygsskala: Underkänd (U), godkänd (G)
  • Inrättad: 2009-03-16
  • Inrättad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Reviderad: 2016-04-21
  • Reviderad av: Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
  • Gäller från: HT 2016
  • Behörighet:

    Antagen till masterprogrammet i Bioinformatik.

  • Ansvarig institution: Institutionen för biologisk grundutbildning

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna

  • redovisa grundläggande kunskaper inom cell- och molekylärbiologi
  • redovisa grundläggande kunskaper om evolution på cell- och organismnivå
  • uppvisa grundläggande kunskaper i bioinformatik
  • uppvisa grundläggande kunskaper om makromolekylers struktur, inklusive analys av struktur, dynamik och klassificering
  • analysera och diskutera forskningsämnen inom cell- och molekylärbiologi och bioinformatik.

I kursen ingår en introduktion till masterstudier. Efter godkänd delkurs ska studenten kunna

  • visa medvetenhet om etiska aspekter på forsknings- och utvecklingsarbete, inklusive plagieringsfrågor
  • visa insikt om bioinformatikens möjligheter, begränsningar och roll i samhället
  • göra en individuell studieplan.

Innehåll

Grundläggande kunskaper om DNA och kromosomer. Replikation, transkription och translation. Rekombination och reparation av DNA. Reglering av genuttryck. . Struktur och funktion hos proteiner, RNA och DNA. Cellens komponenter. Grundläggande sekvens- och strukturbioinformatik. Tillämpningar av bioinformatisk forskning. Datorlaborationer i bioinformatisk forskningsmiljö. Etiska aspekter inom utbildning och forskning. Bioinformatikens roll i samhället.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier och laborationer .

Examination

Följande krav gäller för godkänt på delkurserna:

För grundläggande cell- och molekylärbiologi ( 4 hp) fordras godkänt skriftligt prov och aktivt deltagande i seminarier.

För bioinformatik i forskningen ( 5 hp) fordras godkänt skriftligt prov, godkända labbrapporter och aktivt deltagande i seminarier.

För strukturell bioinformatik (4 hp) fordras godkänt skriftligt prov, godkända labbrapporter och aktivt deltagande i seminarier.

För introduktionen till masterstudier (2 hp) fordras aktivt deltagande i seminarier, skriftlig rapport och genomförd studieplanering.

Övriga föreskrifter

Kursen har studenter med olika bakgrund, och undervisningen har därför viss individuell uppläggning.

Litteratur

Litteraturlista

Gäller från: HT 2016

I bibliotekets söktjänst kan du se om en titel finns elektroniskt.

  • Liljas, Anders Textbook of structural biology

    New Jersey: World Scientific, cop. 2009

    Se bibliotekets söktjänst

  • Jones, Neil C. Pevzner, Pavel. An introduction to bioinformatics algorithms

    Cambridge, MA: MIT Press, 2004

    Se bibliotekets söktjänst

  • Reece, Jane B.; Campbell, Neil A. Campbell biology : Jane B. Reece ...

    9th ed.: Boston: Benjamin Cummings / Pearson, c2011

    Se bibliotekets söktjänst

    Obligatorisk