Allmänt

Internetbaserad version av 3FF508 Farmaceutisk bioinformatik.

Kursen kan ingå som valbar kurs inom apotekarprogrammet.

Ersätter och motsvarar 3FF575.

Behörighetskrav

Inom apotekarprogrammet gäller att den studerande har minst 150 hp varav 60 hp inom biovetenskap, farmaceutisk vetenskap, farmaci eller farmaceutisk kemi, eller motsvarande kunskaper från farmaceutisk, medicinsk, veterinärmedicinsk, odontologisk eller naturvetenskaplig utbildning. För civilingenjörsprogrammen kemiteknik, molekylär bioteknik och bioinformatik gäller minst 120 hp varav 30 hp biovetenskap.

Antagen till masterprogrammet i läkemedelsutveckling.

För fristående kurs gäller att den studerande har 150 hp, varav minst 60 hp inom biovetenskap, farmaci, farmaceutisk vetenskap, eller farmaceutisk kemi, eller motsvarande kunskaper från farmaceutisk, medicinsk, veterinärmedicinsk, odontologisk eller naturvetenskaplig utbildning.

Mål

Kursen syftar till att ge grundläggande kunskaper om hur bioinformatiska verktyg kan användas för att lösa problem inom farmakologi, farmaci och läkemedelskemi/farmaceutisk kemi. Målet är att studenten efter genomgången kurs skall kunna:

* förstå och beskriva hur bioinformatiska verktyg kan användas inom läkemedelsforskning

* använda bio- och kemoinformatiska programvaror, t.ex. för sekvens-alignment, 3D-visualisering och struktur-aktivitetsbaserade metoder såsom proteokemometri

* söka relevant information i biologiska och kemiska databaser

* beräkna potentiella läkemedels egenskaper (deskriptorer), korrelera dessa till målproteinsinteraktioner genom bioinformatisk modellering

* tolka och validera resultat från ovannämnda metoder

Innehåll

Kursen omfattar grunderna till hur bioinformatik kan användas inom farmaci, t.ex. vid utveckling av nya läkemedel. Fokus ligger på förståelse och användande av programvaror snarare än de underliggande matematiska teorierna. Kursen innehåller introduktion och historik till farmaceutisk bioinformatik, biologiska och kemiska databaser, teori och metoder för analys av experimentella data, design av experiment, beräkning av läkemedelskandidaters egenskaper, proteokemometri, dockning, mikroarrayer och virtuell läkemedelsscreening.

Undervisning

Kursen är Internetbaserad och sker på halvfart. Undervisningen bedrivs i form av handledda självstudier främst via webbaserad undervisningsplattform, som också utnyttjas för gruppövningar, diskussioner och inlämningsuppgifter. Kommunikation mellan deltagare och lärare sker via webbplatsen samt via e-post. Obligatoriska moment är inlämningsuppgifter, vilket sker via webbplatsen.

Examination

Skriftlig tentamen (provkod) vid kursens slut samt godkända obligatoriska moment (provkod). Möjlighet att komplettera icke godkända obligatoriska moment kan beredas tidigast vid nästa kurstillfälle och endast i mån av plats. Varje student har rätt till sammanlagt sex provtillfällen, dvs. ett prov och fem omprov.