Behörighetskrav

120 hp, inklusive alt. 1) 60 hp biologi samt 30 hp kemi eller 30 hp geovetenskap. alt. 2) 90 hp biologi dessutom kursen Evolutionära mönster 12 hp. I båda fallen dessutom Ekologi MN1 och Evolutionär genetik MN1.

Mål

Kursen fokuserar på hur de evolutionära processerna och den evolutionära historien manifesteras i form av olika mönster som kan observeras i och bland organismer, hur dessa mönster kan detekteras och analyseras för att dra slutsatser om deras orsaker.

Efter kursen ska studenten kunna

• förklara principerna kring, och tillämpa metoder för, detektion och rekonstruktion av evolutionära mönster;
• diskutera, problematisera och relatera evolutionära mönster på olika hierarkiska nivåer till evolutionära processer:
• tillämpa hypoteser om evolutionära mönster för att förklara, diskutera och analysera evolutionära orsakssamband:
• diskutera och kommunicera principer, problem och forskningsresultat i frågor som rör evolutionära mönster samt förklara och använda sig av evolutionsbiologiska begrepp;
• skissera och tillämpa valda (kombinationer av) evolutionsbiologiska tekniker och metoder.

Innehåll

Kursen omfattar studier av evolutionära mönster manifesterade på olika hierarkiska nivåer. Kursen omfattar följande moment

• De biologiska hierarkierna och den evolutionära scenen o Evolutionära enheter, centrala koncept; variation och uppdykande egenskaper, mutation, rekombination; homologi, homoplasi, komplexa system.
• Utvecklingsbiologiska mönster o Genotyp, fenotyp och anpassning på molekylär nivå; ontogeni och morfogenes, genomisk prägling, modularitet, homeobox gener; utvecklingsmässiga begränsningar
• Anagenetiska mönster o Populationer och metapopulationer, funktionsgenomik; kvantitativa egenskaper, form och homologi; kopplingsojämnvikter, allelfrekvenser, koalescens. o Metodik: mikrosatelliter, SNP, QTL kartläggning, morfometri
• Fylogenetiska mönster o Arter och artbegrepp, taxa -ontologi och epistemologi; fylogenier och fylogenetisk analys, substitutionsmodeller, biologisk mångfald, komparativa metoder. o Metodik: DNA sekvensering, fylogenianalys
• Introgressiva mönster o Haploida, diploida och polyploida genom, genominnehåll, genomorganisation; horisontell genöverföring, genduplikationer, hybridisering; metagenomik. o Metodik: mikromatriser och jämförande genomhybridisering.
• Spatiella och temporala mönster o Biogeografi, värd-parasit associationer; fossil och paleontologiska modeller, stratigrafi, diversifiering och utdöenden, datering av fylogenier

Dessutom ingår ett projektarbete i anslutning till forskningsprogrammen på EBC. En seminarieserie vilken brett belyser evolutionsbiologi och evolutionsbiologiska metoder och applikationer löper under kursens gång.

Delkurser: Teori 7 hp; Laborationer 4 hp; Projekt 4 hp

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer, seminarier, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten. Deltagande i laborationer, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten är obligatoriskt.

Examination

Teoridelen omfattar ett skriftligt prov motsvarande 7 hp och en seminarieserie som har obligatorisk närvaro och följs upp i diskussionsform. Laborationerna motsvarande 4 hp har obligatorisk närvaro och redovisas muntligen eller skriftligen. Projektarbetet redovisas muntligt och i en skriftlig rapport motsvarande 4 hp.