Makromolekylers struktur och funktion
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG349
- Kod
- 1BG349
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1N, Tillämpad bioteknik A1N
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 15 april 2010
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
150 hp avklarade kurser inklusive 60 hp biologi och 30 hp kemi.
Mål
Det övergripande målet med denna kurs är att ge studenten avancerade kunskaper om relationen mellan makromolekylers struktur och funktion. Efter godkänd kurs ska studenten kunna
- redogöra för grunderna för biologiska makromolekylers uppbyggnad och egenskaper
- förklara grunderna i biologisk katalys
- förklara mekanismer för hur viktiga biologiska processer sker och kontrolleras: t.ex. cellsignalering, transkription, och translation
- förklara uppbyggnad av komplex som ribosomer och virus och av aggregat som filament och tubuli
- redogöra för principerna för de viktigaste metoderna för strukturanalys: röntgenkristallografi, NMR och elektronmikroskopi och analysera kvaliteten i de modeller som metoderna leder till
- använda databaser med information om struktur och funktion
- använda och analysera resultat av metoder för förutsägelse av sekundär- och tertiärstruktur av makromolekyler. För studenter som läser kursen som startkurs på masterprogrammet i biologi ingår en introduktion till masterstudier. Efter godkänd delkurs ska studenten kunna
- visa medvetenhet om etiska aspekter på forsknings- och utvecklingsarbete, inklusive plagieringsfrågor
- visa insikt om biologins möjligheter, begränsningar och roll i samhället
- ta ansvar för sitt kunskapsbehov.
Innehåll
Grundläggande makromolekylär struktur, DNA, RNA, proteiner, lipider och kolhydrater. Veckningsprocessen. Strukturell bakgrund till makromolekylers dynamik. Bindningsspecificitet, katalys och kooperativitet.
Makromolekylers funktion belyst av ett antal exempel. Kristallisation av proteiner. Biologiska stukturdatabaser.
Strukturanalys och klassificering av proteiner i strukturfamiljer. Relation mellan sekvens, struktur och funktion.
Datormodellering av sekundärstruktur och tredimensionell struktur av proteiner och nukleinsyra baserad på sekvensdata. Föreläsningar och seminarier kring aktuella biologiska problem.
Undervisning
Undervisningen sker i form av föreläsningar, datorövningar och seminarier. Introduktionen till masterstudier löper som en seminarieserie under hela kursen. För de studenter som inte deltar i denna delkurs ingår ett litteraturprojekt av motsvarande omfattning. Deltagande i datorövningar, seminarier och litteraturprojekt är obligatoriskt.
Examination
Delkurser: Teori 10 hp; Datorövningar och laborationer 3 hp; Masterintroduktion 2 hp alternativt Litteraturprojekt 2 hp
Teorin examineras genom ett skriftligt prov. Datorövningar och laborationer fordrar aktivt deltagande. För introduktionen till masterstudier fordras aktivt deltagande i seminarier, skriftlig rapport, och genomförd studieplanering. För de studenter som istället genomför ett litteraturprojekt redovisas detta skriftligt.
Litteraturlista
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023, version 2
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023, version 1
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2022
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2020
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2019
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2016
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2015
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2013
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2012
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2011
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2010
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2008