Bioinformatik på nätet
5 hp
Kursplan, Grundnivå, 1BG425
Det finns en senare version av kursplanen.
- Kod
- 1BG425
- Utbildningsnivå
- Grundnivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi G2F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (G)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 11 november 2010
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
60 hp biologi alternativt 45 hp biologi och 15 hp kemi eller geovetenskap.
Mål
Efter godkänd kurs ska studenten kunna:
- Söka efter biologisk information på webben.
- Använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer.
- Lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg.
- Tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.
Innehåll
Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner.
Undervisning
Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.
Examination
Problembaserade datorövningar (3 hp). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 hp).