Behörighetskrav

Genomgången Biokemi, 15 hp eller motsv.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenterna kunna

• beskriva olika strategier för att producera och isolera proteiner
• experimentellt bestämma proteiners fysiko-kemiska och funktionella egenskaper
• analysera och tolka proteinsekvenser och strukturer och använda sådan information för att förutsäga deras funktioner
• beskriva hur proteiners egenskaper och studier av proteiner kan användas för framtagning av läkemedel, för bioteknologi och för andra industriella och vetenskapliga ändamål
• skriva en rapport utformad som en vetenskaplig artikel

Innehåll

- Proteinsyntes: Biologisk och rekombinant proteinsyntes. Peptidsyntes. Post-translationella modifieringar.

- Proteinkemi: peptidsekvensering och kemisk modifiering av proteiner.

- Biologisk proteinnedbrytning.

- Proteininformatik: Databaser för proteinsekvenser, struktur och funktion. Proteinbioinformatiska metoder.

- Proteinstruktur: Proteinveckning. Bestämning av proteiners tredimensionella struktur: Röntgenkristallografi, NMR-spektroskopi, mikroskopi. Modellering och analys av proteinstruktur med hjälp av molekylgrafik. Strukturfunktionssamband hos proteiner.

- Funktionell genomik och proteomik: Riktad evolution av proteiner

- Proteininteraktioner: Proteinligand, protein-DNA och protein-protein interaktioner. Kinetisk och termodynamisk karaktärisering av interaktioner. Metoder och tolkningar.

- Exempel på proteinfunktion och applikationer:

a. Enzymer

b. Membranproteiner, receptorer

c. Protein-proteininteraktioner, cellsignalering

d. Multiproteinkomplex, virus.

- Individuellt laborativt projekt: Resultaten från ett experimentellt projekt ska presenteras i en rapport utformad som en vetenskaplig publikation.

Undervisning

Undervisningen sker i form av föreläsningar samt i form av laborativa och teoretiska övningar och projekt. Övningar och projekt är obligatoriska och utföres individuellt eller i grupp.

Examination

Experimentella och teoretiska övningar och projekt (5 hp) examineras under kursens gång. En av rapporterna ska ha en metodbeskrivning på engelska som motsvarar kravet som ställs vid publicering i internationella tidskrifter inom biokemi. En övergripande examination (5 hp) ges vid slutet av kursen. Slutbetyg för kursen ges som ett viktat medelbetyg för samtliga examinerade moment.