Behörighetskrav

Alt. 1) 120 hp med 60 hp kemi inklusive 20 hp biokemi Alt 2) 120 hp med 30 hp kemi och 30 hp biologi, inklusive 20 hp biokemi. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• beskriva och diskutera molekylär igenkänning utifrån olika biomakromolekylers interaktioner med andra biomolekyler och små syntetiska ligander.
• förklara grundläggande principer för molekylär igenkänning utifrån kinetiska och termodynamiska principer samt tredimensionella strukturer av biomakromolekylers komplex med andra molekyler
• använda molekylgrafik för att studera struktur hos biomakromolekyler och deras komplex
• jämföra vanligt förekommande biologiska, biokemiska och biofysikaliska metoder för studier av molekylära interaktioner utifrån hur de fungerar och den information de kan tillhandahålla
• exemplifiera användningsområden för kemiska föreningar som designats och syntetiserats för att känna igen proteiner och andra biomakromolekyler

Innehåll

Molekylära interaktionsmekanismer och krafter mellan molekyler: selektivitet, affinitet, kinetik och termodynamik. Interaktioners beroende på den omgivande miljön.

Struktur och dynamik hos biomakromolekyler och deras komplex: selektivitet, multivalens, aviditet. Olika typer av biomolekylära interaktioner: proteinligand, protein-protein , DNA- och RNA-protein. Inhibering av interaktioner.

Applikationer: design av ligander, modifiering av proteiner och nukleinsyror för förändring av deras interaktioner med andra makromolekyler eller ligander.

Biologiska, biokemiska och biofysikaliska metoder för identifiering och karaktärisering av molekylära interaktioner.

Modellering av interaktioner med molekylgrafik och strukturinformation

Exempel på hur biologiska system kan beskrivas utifrån ingående molekylära interaktioner. Tillämpningar av interaktionsanalyser inom livsvetenskaplig forskning, läkemedelsutveckling och diagnostik.

Undervisning

Undervisningen sker i form av föreläsningar samt laborativa och teoretiska övningar och projekt. Övningar och projekt är obligatoriska och utföres individuellt.

Examination

Ett skriftligt prov anordnas i slutet av kursen (10 hp). Laborationer, övningar och projekt examineras under kursens gång och motsvarar 5 hp. Slutbetyg ges som ett viktat medelbetyg av det skriftliga provet och övriga examinerade moment.

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.