Behörighetskrav

Kandidatexamen inklusive 15 hp matematik och statistik samt 45 hp biologi varav 30 hp i molekylärbiologi, cellbiologi, evolution och/eller genetik.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna

• redogöra för och utföra uppgifter som kräver kännedom om nyckelbegrepp inom beräkningsvetenskap och statistik;
• beskriva och använda de algoritmer och metoder som ingår i kursen;
• undersöka egenskaper hos beräkningsalgoritmer, matematiska och statistiska modeller med hjälp av de analysförfaranden som ingår i kursen;
• tillämpa grundläggande försöksplaneringsteknik;
• lösa mindre beräkningsproblem på ett strukturerat sätt (lösa problemet stegvis genom att dela upp i delproblem) och implementera i Matlab;
• grundläggande användning av Linux och shellskript.

Innehåll

Kursen består av tre delar: beräkningsvetenskap och grundläggande programmering, statistik och multivariat analys samt användning av Linux.

Del 1 ( 5 hp): Matriser, vektorer och lösning av linjära ekvationsstem, introduktion till ordinära differentialekvationer, numerisk lösning av ordinära differentialekvationer , introduktion till Monte Carlometoder. Användning av Matlab och grunderna i programmering, t ex programmeringsstrukturer (if, for, while) och funktioner.

Del 2 (4 hp): Statistik och multivarat analys: Grunderna i statistik (fördelningar, väntevärde, varians, standardavvikelse etc.). Principalkomponentanalys. Grunderna för vanligt förekommande univariata analyser (t-test, anova, korrelation och regression). Prediktiv multivariat analys.

Del 3 ( 1 hp):

Användning av Linux via bash (t ex pipelines och kommandon som grep, awk etc) och Shellskript.

Undervisning

Föreläsningar och lektioner, laborationer, inlämningsuppgifter.

Examination

Skriftliga prov (del 1 och del 2). Inlämningsuppgifter (del 1, del 2 och del 3).

If there are special reasons for doing so, an examiner may make an exception from the method of assessment indicated and allow a student to be assessed by another method. An example of special reasons might be a certificate regarding special pedagogical support from the disability coordinator of the university.