Bioinformatik på nätet

5 hp

Kursplan, Grundnivå, 1BG425

Det finns en senare version av kursplanen.
Kod
1BG425
Utbildningsnivå
Grundnivå
Huvudområde(n) med fördjupning
Biologi G2F
Betygsskala
Underkänd (U), godkänd (G)
Fastställd av
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 11 november 2010
Ansvarig institution
Institutionen för biologisk grundutbildning

Behörighetskrav

60 hp biologi alternativt 45 hp biologi och 15 hp kemi eller geovetenskap.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

  • Söka efter biologisk information på webben.
  • Använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer.
  • Lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg.
  • Tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.

Innehåll

Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner.

Undervisning

Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.

Examination

Problembaserade datorövningar (3 hp). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 hp).

FÖLJ UPPSALA UNIVERSITET PÅ

facebook
instagram
twitter
youtube
linkedin