Ylva Ivarsson

Professor i biokemi vid Institutionen för kemi inom livsvetenskaperna; Biokemi; Ivarsson grupp

Telefon:: 018-471 40 38
E-post:: Ylva.Ivarsson@kemi.uu.se
Besöksadress:: Husargatan 3
752 37 Uppsala
Postadress:: Box 576
75123 Uppsala

Ladda ned kontaktuppgifter för Ylva Ivarsson vid Institutionen för kemi inom livsvetenskaperna; Biokemi; Ivarsson grupp

Akademiska meriter:: FD, docent i biokemi

Kort presentation

Ylva Ivarsson är professor i biokemi och leder en forskargrupp som finansieras av Vetenskapsrådet, EU Marie Curie ETN-program och andra finansiärer. Gruppens forskning är tvärvetenskaplig och kombinerar biokemiska och biofysikaliska metoder med bioinformatik och cellbaserade analyser för att studera motivbaserade protein–proteininteraktioner.

Biografi

Ylva Ivarsson disputerade i biokemi vid Uppsala universitet 2006, under handledning av Bengt Mannervik. Därefter anslöt hon sig till Maurizio Brunoris forskargrupp vid universitetet i Rom ”La Sapienza”, där hon studerade proteinveckning och felveckning. Efter två och ett halvt år i Italien flyttade hon till Katolska universitetet i Leuven i Belgien för att arbeta med Pascale Zimmermann kring protein–fosfolipidinteraktioner, med stöd av ett EMBO Long-Term Fellowship.

År 2012 anslöt sig Ylva till Donnelly Centre vid University of Toronto genom en delad tjänst mellan Sachdev Sidhus och Philip M. Kims forskargrupper. Där var hon banbrytande inom proteomisk peptidfagdisplay, ProP-PD, en kraftfull metod för storskalig upptäckt av protein–peptidinteraktioner. Metoden öppnade nya möjligheter att systematiskt kartlägga de korta linjära motivinteraktioner som formar cellulär signalering.

År 2013 tilldelades Ylva ett Young Investigator-bidrag från Vetenskapsrådet och etablerade sin självständiga forskargrupp vid Institutionen för kemi, Uppsala universitet. Sedan dess har hennes grupp erhållit flera prestigefyllda anslag, hon blev befordrad till universitetslektor med tillsvidareanställning 2017 och till professor 2020. För närvarande leder hon även forskningsprogrammet i biokemi.

Forskning

Ivarsson-gruppen utforskar de molekylära interaktionsnätverk som styr cellulär signaltransduktion, med särskilt fokus på proteomets intrinsikalt oordnade regioner. Dessa flexibla, motivrika regioner har länge varit svåra att utforska, men de kodar för många av de interaktionsbrytare som reglerar cellers beteende. Genom att kombinera ProP-PD med kompletterande experimentella och beräkningsbaserade metoder, och genom nära samarbete med dr Norman Davey, tillhandahåller gruppen funktionell information om intrinsikalt oordnade regioner i både det humana och det virala proteomet. Detta arbete bidrar till att visa hur korta linjära motiv (SLiM) kopplar samman proteiner i signaleringsnätverk, hur virus kapar värdcellens maskineri och hur tidigare okarakteriserade oordnade regioner bidrar till biologi och sjukdom. Data görs tillgängliga via ProP-PD-portalen: https://slim-tools.org/proppd/

Den senaste nyheten från gruppen är lanseringen av ASHI: An Atlas of Short Linear Motif-Mediated Human Protein-Protein Interactions, ett omfattande samarbetsprojekt som kraftigt utökar den mänskliga SLiM-baserade interaktomen: https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.03.735260v1

Ylva koordinerar för närvarande också IDPro, ”Intrinsically disordered proteins in health and disease”. IDPro är ett doktorandnätverk inom Horizon Europe Marie Skłodowska-Curie Actions och syftar till att fördjupa förståelsen av de molekylära principer som styr interaktioner och regulatoriska mekanismer i cellulära nätverk. Mer information finns på https://idpro.elte.hu/network

Publikationer

Senaste publikationer

Alla publikationer

Artiklar i tidskrift

Artiklar, forskningsöversikt

Kapitel i böcker, delar av antologi

Identification of PDZ Interactions by Proteomic Peptide Phage Display

Lüchow, Susanne; Sundell, Gustav; Ivarsson, Ylva

Ingår i PDZ Mediated Interactions, s. 41-60, Springer Nature, 2021
- DOI för Identification of PDZ Interactions by Proteomic Peptide Phage Display
Identification of Cellular Protein-Protein Interactions

Benz, Caroline; Kassa, Eszter; Tjärnhage, Elias; Bergström Lind, Sara et al.

Ingår i INHIBITORS OF PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS, s. 1-39, Royal Society of Chemistry, 2021
- DOI för Identification of Cellular Protein-Protein Interactions
Combinatorial protein chemistry in three dimensions: a paradigm for the evolution of glutathione transferases with novel activities

Ivarsson, Ylva; Mannervik, Bengt

Ingår i Toxicology of Glutathione Transferases, s. 47-69, CRC Taylor & Francis, Boca Raton, 2006

Manuskript (preprint)

Evaluation of affinity-purification coupled to mass spectrometry approaches for capture of short linear motif-based interactions

Kassa, Eszter; Jamshidi, Sara; Mihalič, Filip; Simonetti, Leandro et al.
- DOI för Evaluation of affinity-purification coupled to mass spectrometry approaches for capture of short linear motif-based interactions
Tick-borne flaviviruses recruits the pro viral factor NUP153 to the replication site

Akpiroro Peters, Marie Berit; Kassa, Eszter; Yau, Wai-Lok; Lindqvist, Richard et al.
Systematic discovery of short linear motif binding across human E3 ubiquitin ligases

Vieler, Maximilian; Varga, Julia K.; Gomez-Lucas, Lidia; Simonetti, Leandro et al.
Proteome-scale identification of short linear binding motifs for the BTB-KELCH E3 ligase family

Chen, Xiangrong; Vieler, Maximilian; Chen, Zhuoyao; Benz, Caroline et al.
An Atlas of Short Linear Motif Mediated Human Protein-Protein Interactions

Madhu, Priyanka; Benz, Caroline; Simonetti, Leandro; Winters, Matthew J. et al.