Behörighetskrav

Biokemi, 15 hp eller motsv.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenterna kunna

• beskriva olika strategier för att producera proteiner experimentellt bestämma proteiners fysiko-kemiska och funktionella egenskaper
• analysera och tolka proteinsekvenser och strukturer och använda sådan information för att förutsäga deras funktioner
• beskriva hur proteiners egenskaper och studier av proteiner kan användas för framtagning av läkemedel, för bioteknologi och för andra industriella och vetenskapliga ändamål
• skriva en rapport utformad som en vetenskaplig artikel

Innehåll

- Proteinsyntes: Biologisk och rekombinant proteinsyntes. Peptidsyntes. Post-translationella modifieringar, glycoproteiner.

- Proteinkemi: Kvantitativ aminosyreanalys (MS och kemiska metoder). Peptidsekvensning. Kemisk modifiering av proteiner.

- Proteinnedbrytning: Biologisk (intra- och extracellulär) och kemisk proteinnedbrytning.

- Proteininformatik: Databaser för proteinsekvenser, struktur och funktion. Proteininformatiska tekniker.

- Proteinstruktur: Proteinveckning. Bestämning av proteiners tredimensionella struktur: Röntgendiffraktion av proteinkristaller, NMR-spektroskopi, mikroskopi. Datorgrafisk modellering av proteiner. Samband mellan proteiners olika strukturnivåer och deras funktionella egenskaper.

- Funktionell genomik och proteomik: Riktad evolution av proteiner

- Proteininteraktioner: Proteinligand, protein-DNA och protein-protein interaktioner. Kinetisk och termodynamisk karaktärisering av interaktioner, metoder och tolkningar.

- Exempel på proteinfunktion och applikationer:

a. Enzymer

b. Receptorer

c. Protein-proteininteraktioner, cellsignalering

d. Multiproteinkomplex, virus.

- Individuellt laborativt projekt: Resultaten från ett experimentellt projekt ska presenteras i form av en vetenskaplig publikation.

Undervisning

Undervisningen sker i form av föreläsningar samt i stor utsträckning i form av laborativa och teoretiska övningar och projekt. Övningar och projekt är obligatoriska och utföres individuellt.

Examination

Experimentella och teoretiska övningar och projekt (5 hp) examineras under kursens gång. En övergripande examination (5 hp) ges vid slutet av kursen. Slutbetyg för kursen ges som ett viktat medelbetyg för samtliga obligatoriska moment.