Selmer labb
Vi använder strukturbiologi, biokemi och biofysik för att förstå hur proteiner och RNA samverkar i olika cellulära processer. Vi är framför allt intresserade av det prokaryota translationsmaskineriet, olika mekanismer för antibiotikaresistens samt evolution av nya funktioner hos proteiner, bland annat hos bakteriofager.
Populärvetenskaplig presentation
Proteiner och nukleinsyror är stora molekyler som bygger upp en levande cell och dess funktioner. I vår forskning använder vi bland annat metoder såsom röntgenkristallografi och elektronmikroskopi för att i minsta detalj ta reda på hur proteiner och nukleinsyror ser ut i tre dimensioner för att på så sätt kunna förstå hur de fungerar och bidrar till cellens funktion.
Vi studerar framför allt bakteriers maskineri för att översätta den genetiska koden till protein, ribosomen. Ribosomen består av RNA och proteiner, och vi söker ny kunskap om hur ribosomer bildas, fungerar och blockeras av antibiotika. Vi studerar också hur bakterier på olika sätt blir resistanta mot antibiotika, kunskap som kan komma till nytta vid utvecklig av nästa generation av antibakteriella läkemedel.
Vi söker också svar på generella frågor om hur evolutionen verkar på atomnivå. Hur utvecklas nya funktioner hos proteiner och hur anpassas proteiner till ändrade förhållanden? Hur utvecklar bakteriofager, virus som infekterar bakterier, metoder att motverka bakteriers försvar? Är proteiner som vid första anblick verkar näst intill obesläktade med andra kända proteiner "unga", eller har de evolverat så snabbt att vi inte med vanliga metoder kan känna igen i vilken familj de hör hemma?
I samband med invigningen av MAXIV berättade jag i vetenskapsradion om hur synkrotronstrålning kan användas för att förstå antibiotikaresistens. Lyssna här: Vetenskapsradion 21 juni 2016
Under en vistelse på University of Otago, Nya Zeeland, medverkade jag i vetenskapsprogrammet Our changing world. Lyssna här: Our changing world 18 maj 2017
Forskning
...
Gruppmedlemmar
Publikationer
Ingår i Cell Reports, 2023
Structural Consequences of Deproteinating the 50S Ribosome
Ingår i Biomolecules, 2022
Structure and mechanism of a phage-encoded SAM lyase revises catalytic function of enzyme family
Ingår i eLIFE, 2021
Ingår i Journal of Biological Chemistry, 2021
- DOI för Structures and kinetics of Thermotoga maritima MetY reveal new insights into the predominant sulfurylation enzyme of bacterial methionine biosynthesis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structures and kinetics of Thermotoga maritima MetY reveal new insights into the predominant sulfurylation enzyme of bacterial methionine biosynthesis
Oligomerization and characteristics of phosphoenolpyruvate carboxylase in Synechococcus PCC 7002
Ingår i Scientific Reports, 2020
Structural Recognition of Spectinomycin by Resistance Enzyme ANT(9) from Enterococcus faecalis
Ingår i Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2020
Ingår i Biomolecules, 2020
- DOI för Structure and Characterization of Phosphoglucomutase 5 from Atlantic and Baltic Herring: An Inactive Enzyme with Intact Substrate Binding
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and Characterization of Phosphoglucomutase 5 from Atlantic and Baltic Herring: An Inactive Enzyme with Intact Substrate Binding
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 15948-15956, 2020
- DOI för Structure and kinetics of indole-3-glycerol phosphate synthase from Pseudomonas aeruginosa: Decarboxylation is not essential for indole formation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and kinetics of indole-3-glycerol phosphate synthase from Pseudomonas aeruginosa: Decarboxylation is not essential for indole formation
Crystal structure of ErmE-23S rRNA methyltransferase in macrolide resistance
Ingår i Scientific Reports, 2019
Ingår i Nature Ecology & Evolution, s. 1321-1330, 2018
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 11481-11490, 2018
Structural and functional innovations in the real-time evolution of new (βα)8 barrel enzymes
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 4727-4732, 2017
Two proofreading steps amplify the accuracy of genetic code translation
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 13744-13749, 2016
Structure of AadA from Salmonella enterica: a monomeric aminoglycoside (3'')(9) adenyltransferase
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 2267-2277, 2015
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 24657-24668, 2015
Investigating Ribosome Conformations with Multi-Resolution Modeling
Ingår i Biophysical Journal, 2014
Ingår i PLOS ONE, 2014
- DOI för Resistance to beta-Lactam Antibiotics Conferred by Point Mutations in Penicillin-Binding Proteins PBP3, PBP4 and PBP6 in Salmonella enterica
- Ladda ner fulltext (pdf) av Resistance to beta-Lactam Antibiotics Conferred by Point Mutations in Penicillin-Binding Proteins PBP3, PBP4 and PBP6 in Salmonella enterica
Energetic pathway sampling in a protein interaction domain
Ingår i Structure, s. 1193-1202, 2013
Ingår i Acta Crystallographica. Section F, s. 1001-1003, 2013
- DOI för Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the 23S rRNA methyltransferase RlmJ from Escherichia coli
- Ladda ner fulltext (pdf) av Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the 23S rRNA methyltransferase RlmJ from Escherichia coli
Structural and functional insights into the molecular mechanism of rRNA m6A methyltransferase RlmJ
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 9537-9548, 2013
Crystal structure of RlmM, the 2'O-ribose methyltransferase for C2498 of Escherichia coli 23S rRNA
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 10507-20, 2012
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 30257-30267, 2012
Ribosome engineering to promote new crystal forms
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 578-583, 2012
Ingår i Open Biology, s. 120016, 2012
Tolerance of Protein Folding to a Circular Permutation in a PDZ Domain
Ingår i PLOS ONE, 2012
Staphylococcus aureus elongation factor G - structure and analysis of a target for fusidic acid
Ingår i The FEBS Journal, s. 3789-3803, 2010
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 18051-18059, 2010
The structure of the ribosome with elongation factor G trapped in the posttranslocational state
Ingår i Science, s. 694-699, 2009
Crystal structure of the ribosome recycling factor bound to the ribosome
Ingår i Nature Structural & Molecular Biology, s. 733-737, 2007
Ingår i RNA, s. 817-823, 2007
Medarbetare
...