Selmer labb

Vi använder strukturbiologi, biokemi och biofysik för att förstå hur proteiner och RNA samverkar i olika cellulära processer. Vi är framför allt intresserade av det prokaryota translationsmaskineriet, olika mekanismer för antibiotikaresistens samt evolution av nya funktioner hos proteiner, bland annat hos bakteriofager.
Populärvetenskaplig presentation
Strukturbiologi från atom till organism
Som strukturbiologer visualiserar vi livets molekyler på en detaljnivå som ger förståelse för hur de fungerar. Vi vill förstå hur biologiskt viktiga makromolekyler och molekylära maskiner fungerar i levande celler. Vi fokuserar framför allt på bakteriers ribosomer, stora molekylära maskiner som översätter genetisk information till proteiner. Proteinsyntesen är en av livets mest grundläggande processer. Vi intresserar oss också för hur evolutionen formar proteiners struktur och funktion, från bakteriofager och bakterier till mer komplexa organismer.
För att besvara dessa frågor använder vi integrerad strukturbiologi. Vi kombinerar kryo-elektronmikroskopi, röntgenkristallografi, biokemi, biofysik och molekylärbiologi för att beskriva biologiska processer på atomnivå. Våra studier omfattar bland annat hur ribosomer bildas, hur och varför ribosomens RNA modifieras, mekanismer för hur antibiotika verkar och hur bakterier blir resistenta och hur proteiner utvecklar nya eller förändrade funktioner. Genom att kombinera strukturella och funktionella analyser kan vi koppla molekylär detaljkunskap till biologiska mekanismer.
Vårt övergripande mål är att skapa en förståelse av biologiska system från atom till organism. Genom att klarlägga hur makromolekyler fungerar, förändras och utvecklas vill vi bidra till grundläggande kunskap om livets processer och samtidigt skapa förutsättningar för framtida tillämpningar inom exempelvis antibiotikautveckling och bioteknik. Våra publikationer speglar denna bredd, med forskning som sträcker sig från proteinsyntes och antibiotikaresistens till hur bakterier försvarar sig mot virus och molekylära mekanismer för proteiners evolution och anpassning.
Forskning
...
Gruppmedlemmar
Publikationer
-
Origin and Evolution of Very Large Extracellular Proteins in Fructophilic Lactic Acid Bacteria
Ingår i Genome Biology and Evolution, 2026
- DOI för Origin and Evolution of Very Large Extracellular Proteins in Fructophilic Lactic Acid Bacteria
- Ladda ner fulltext (pdf) av Origin and Evolution of Very Large Extracellular Proteins in Fructophilic Lactic Acid Bacteria
-
Ingår i Nucleic Acids Research, 2026
- DOI för Structural characterization of ribosome recycling and fusidic acid inhibition in Staphylococcus aureus
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural characterization of ribosome recycling and fusidic acid inhibition in Staphylococcus aureus
-
Doublet decoding of tRNASer3 demonstrates plasticity of ribosomal decoding center
Ingår i Nature Communications, 2025
- DOI för Doublet decoding of tRNASer3 demonstrates plasticity of ribosomal decoding center
- Ladda ner fulltext (pdf) av Doublet decoding of tRNASer3 demonstrates plasticity of ribosomal decoding center
-
Mechanisms of fusidic acid resistance
Ingår i Biochemical Society Transactions, s. 1011-1022, 2025
-
Structural mechanism of FusB-mediated rescue from fusidic acid inhibition of protein synthesis
Ingår i Nature Communications, 2025
- DOI för Structural mechanism of FusB-mediated rescue from fusidic acid inhibition of protein synthesis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural mechanism of FusB-mediated rescue from fusidic acid inhibition of protein synthesis
-
Ingår i Scientific Reports, 2024
- DOI för Structures of the Staphylococcus aureus ribosome inhibited by fusidic acid and fusidic acid cyclopentane
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structures of the Staphylococcus aureus ribosome inhibited by fusidic acid and fusidic acid cyclopentane
-
Ingår i Cell Reports, 2023
- DOI för Phage T3 overcomes the BREX defense through SAM cleavage and inhibition of SAM synthesis by SAM lyase
- Ladda ner fulltext (pdf) av Phage T3 overcomes the BREX defense through SAM cleavage and inhibition of SAM synthesis by SAM lyase
-
Structural Consequences of Deproteinating the 50S Ribosome
Ingår i Biomolecules, 2022
- DOI för Structural Consequences of Deproteinating the 50S Ribosome
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural Consequences of Deproteinating the 50S Ribosome
-
Structure and mechanism of a phage-encoded SAM lyase revises catalytic function of enzyme family
Ingår i eLIFE, 2021
- DOI för Structure and mechanism of a phage-encoded SAM lyase revises catalytic function of enzyme family
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and mechanism of a phage-encoded SAM lyase revises catalytic function of enzyme family
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, 2021
- DOI för Structures and kinetics of Thermotoga maritima MetY reveal new insights into the predominant sulfurylation enzyme of bacterial methionine biosynthesis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structures and kinetics of Thermotoga maritima MetY reveal new insights into the predominant sulfurylation enzyme of bacterial methionine biosynthesis
-
Oligomerization and characteristics of phosphoenolpyruvate carboxylase in Synechococcus PCC 7002
Ingår i Scientific Reports, 2020
- DOI för Oligomerization and characteristics of phosphoenolpyruvate carboxylase in Synechococcus PCC 7002
- Ladda ner fulltext (pdf) av Oligomerization and characteristics of phosphoenolpyruvate carboxylase in Synechococcus PCC 7002
-
Structural Recognition of Spectinomycin by Resistance Enzyme ANT(9) from Enterococcus faecalis
Ingår i Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2020
-
Ingår i Biomolecules, 2020
- DOI för Structure and Characterization of Phosphoglucomutase 5 from Atlantic and Baltic Herring: An Inactive Enzyme with Intact Substrate Binding
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and Characterization of Phosphoglucomutase 5 from Atlantic and Baltic Herring: An Inactive Enzyme with Intact Substrate Binding
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 15948-15956, 2020
- DOI för Structure and kinetics of indole-3-glycerol phosphate synthase from Pseudomonas aeruginosa: Decarboxylation is not essential for indole formation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and kinetics of indole-3-glycerol phosphate synthase from Pseudomonas aeruginosa: Decarboxylation is not essential for indole formation
-
Crystal structure of ErmE-23S rRNA methyltransferase in macrolide resistance
Ingår i Scientific Reports, 2019
- DOI för Crystal structure of ErmE-23S rRNA methyltransferase in macrolide resistance
- Ladda ner fulltext (pdf) av Crystal structure of ErmE-23S rRNA methyltransferase in macrolide resistance
-
Ingår i Nature Ecology & Evolution, s. 1321-1330, 2018
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 11481-11490, 2018
- DOI för Structural mechanism of AadA, a dual specificity aminoglycoside adenylyltransferase from Salmonella enterica
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural mechanism of AadA, a dual specificity aminoglycoside adenylyltransferase from Salmonella enterica
-
Structural and functional innovations in the real-time evolution of new (βα)8 barrel enzymes
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 4727-4732, 2017
- DOI för Structural and functional innovations in the real-time evolution of new (βα)8 barrel enzymes
-
Two proofreading steps amplify the accuracy of genetic code translation
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 13744-13749, 2016
-
Structure of AadA from Salmonella enterica: a monomeric aminoglycoside (3'')(9) adenyltransferase
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 2267-2277, 2015
- DOI för Structure of AadA from Salmonella enterica: a monomeric aminoglycoside (3'')(9) adenyltransferase
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure of AadA from Salmonella enterica: a monomeric aminoglycoside (3'')(9) adenyltransferase
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 24657-24668, 2015
-
Investigating Ribosome Conformations with Multi-Resolution Modeling
Ingår i Biophysical Journal, 2014
-
Ingår i PLOS ONE, 2014
- DOI för Resistance to beta-Lactam Antibiotics Conferred by Point Mutations in Penicillin-Binding Proteins PBP3, PBP4 and PBP6 in Salmonella enterica
- Ladda ner fulltext (pdf) av Resistance to beta-Lactam Antibiotics Conferred by Point Mutations in Penicillin-Binding Proteins PBP3, PBP4 and PBP6 in Salmonella enterica
-
Energetic pathway sampling in a protein interaction domain
Ingår i Structure, s. 1193-1202, 2013
- DOI för Energetic pathway sampling in a protein interaction domain
- Ladda ner fulltext (pdf) av Energetic pathway sampling in a protein interaction domain
-
Ingår i Acta Crystallographica. Section F, s. 1001-1003, 2013
- DOI för Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the 23S rRNA methyltransferase RlmJ from Escherichia coli
- Ladda ner fulltext (pdf) av Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the 23S rRNA methyltransferase RlmJ from Escherichia coli
-
Structural and functional insights into the molecular mechanism of rRNA m6A methyltransferase RlmJ
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 9537-9548, 2013
- DOI för Structural and functional insights into the molecular mechanism of rRNA m6A methyltransferase RlmJ
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural and functional insights into the molecular mechanism of rRNA m6A methyltransferase RlmJ
-
Crystal structure of RlmM, the 2'O-ribose methyltransferase for C2498 of Escherichia coli 23S rRNA
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 10507-20, 2012
- DOI för Crystal structure of RlmM, the 2'O-ribose methyltransferase for C2498 of Escherichia coli 23S rRNA
- Ladda ner fulltext (pdf) av Crystal structure of RlmM, the 2'O-ribose methyltransferase for C2498 of Escherichia coli 23S rRNA
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 30257-30267, 2012
-
Ribosome engineering to promote new crystal forms
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 578-583, 2012
-
Ingår i Open Biology, s. 120016, 2012
-
Tolerance of Protein Folding to a Circular Permutation in a PDZ Domain
Ingår i PLOS ONE, 2012
- DOI för Tolerance of Protein Folding to a Circular Permutation in a PDZ Domain
- Ladda ner fulltext (pdf) av Tolerance of Protein Folding to a Circular Permutation in a PDZ Domain
-
Staphylococcus aureus elongation factor G - structure and analysis of a target for fusidic acid
Ingår i The FEBS Journal, s. 3789-3803, 2010
-
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 18051-18059, 2010
-
The structure of the ribosome with elongation factor G trapped in the posttranslocational state
Ingår i Science, s. 694-699, 2009
-
Crystal structure of the ribosome recycling factor bound to the ribosome
Ingår i Nature Structural & Molecular Biology, s. 733-737, 2007
-
Ingår i RNA, s. 817-823, 2007