Sundborger-Lunna labb

Vi använder en kombination av molekylärbiologi, biokemiska och biofysiska tekniker, inklusive kryo-elektronmikroskopi, för att studera hur membran-ombyggande proteiner reglerar kritiska celldödsprocesser. Vårt mål är att förstå samspelet mellan membranrenoveringsproteiner och membranlipider för att reglera cellens öde.
Populärvetenskaplig presentation
Mitokondrier är cellens energifabriker och har ett avancerat system för kvalitetskontroll. När mitokondrier skadas måste cellen snabbt avgöra om de ska repareras eller brytas ned (mitofagi), eller om skadan är så allvarlig att cellen ska gå in i programmerad celldöd (apoptos). Denna avgörande balans styrs till stor del av förändringar i mitokondriens yttre membran. När dessa processer fungerar fel bidrar det till sjukdomar som cancer och neurodegeneration.
Vår forskning undersöker hur proteiner och lipider tillsammans organiserar dessa membranförändringar. Vi fokuserar särskilt på proteinet endophilin B1, som kan bilda olika strukturer på mitokondriens membran. Beroende på hur dessa strukturer organiseras kan de antingen hjälpa cellen att rensa bort skadade mitokondrier eller i stället bidra till att starta apoptos.
Vi studerar också hur dessa membranförändringar samverkar med apoptosproteinet Bax, som bildar porer i mitokondriens membran under celldöd. Dessutom undersöker vi hur felveckade proteiner kopplade till neurodegenerativa sjukdomar, som Huntingtons sjukdom, kan störa dessa mekanismer.
Genom att kombinera biokemiska experiment, cellbiologi och avancerad strukturbiologi, inklusive kryo-elektronmikroskopi, vill vi förstå de molekylära principerna bakom hur mitokondrier reglerar cellens överlevnad eller död. På längre sikt kan denna kunskap bidra till nya strategier för behandling av sjukdomar där mitokondriernas funktion är störd.
Forskning
Mitokondriell funktion och kvalitetskontroll är beroende av dynamisk omformning av det yttre mitokondriemembranet (OMM). Dessa omformningsprocesser avgör om skadade mitokondrier elimineras genom mitofagi eller om permeabilisering av mitokondriemembranet utlöser apoptos. Dysreglering av dessa processer är ett kännetecken för flera sjukdomar, inklusive cancer och neurodegenerativa sjukdomar. Vår forskning fokuserar på att förstå hur proteinassembléer och lipidorganisation samverkar för att koordinera omformning av mitokondriemembranet och därigenom kontrollera cellens ödesbeslut. Ett centralt tema i vårt arbete är att membranomformning styrs av högre ordningens protein–lipid-assembléer som organiserar mitokondriella membran. Vi undersöker hur dessa strukturer integrerar membrankurvatur, lipidsammansättning och proteinoligomerisering för att reglera mitokondriell kvalitetskontroll och apoptotisk signalering. Vår nuvarande forskning behandlar tre nära relaterade frågor:

1. Hur organiseras mitokondriella membranomformningshubbar för att kontrollera beslutet mellan mitofagi och apoptos?
Kardiolipin (CL), en mitokondriespecifik fosfolipid, omfördelas till det yttre mitokondriemembranet under cellulär stress och främjar membrankurvatur samt packningsdefekter i membranet. Vi undersöker hur det mitokondriella BAR-domänproteinet endophilin B1 (EnB1) känner igen och omformar CL-innehållande membran. Våra resultat tyder på att EnB1 kan bilda distinkta högre ordningens strukturer på mitokondriella membran och även bilda biomolekylära kondensat som organiserar lipid–protein-baserade omformningshubbar. Dessa strukturer verkar generera olika membranutfall: scaffold-liknande assembléer främjar membrantubulering kopplad till mitokondriella kvalitetskontrollprocesser, medan alternativa assembléer destabiliserar membranet och underlättar apoptotisk membranomformning. Att förstå hur dessa assembléer bildas och regleras är centralt för att förklara hur mitokondriell membranomformning styr cellens öde.
2. Hur samarbetar mitokondriella membranomformningsproteiner med apoptotisk maskineri för att reglera mitokondriell permeabilisering?
Aktivering av Bcl-2-familjeproteinet Bax är ett centralt steg i mitokondriell apoptos. Våra studier indikerar att EnB1 direkt interagerar med Bax och främjar dess rekrytering och assembliering på kardiolipin-innehållande membran. Vi undersöker hur denna interaktion påverkar Bax-oligomerisering och porbildning i det yttre mitokondriemembranet, samt hur lipidsammansättning och membrankurvatur modulerar denna process. Dessa studier syftar till att klargöra hur mitokondriella membranomformningsproteiner fungerar uppströms apoptotisk porbildning och hur dysreglering av dessa mekanismer bidrar till sjukdomar såsom aggressiva cancerformer.
3. Hur påverkar amyloidrelaterad png, 146 kB. proteinfelveckning mitokondriell membranomformning och celldödsvägar vid neurodegeneration?
Mutant Huntingtin (mtHtt), det sjukdomsorsakande proteinet vid Huntingtons sjukdom, är känt för att interagera med membranomformande proteiner såsom dynamin och endofiliner. Htt uppvisar också anti-apoptotiska egenskaper och har kopplats till mitokondriell dysfunktion som observeras vid Huntingtons sjukdom. Vi undersöker om felveckat eller aggregerat Htt stör de mitokondriella omformningsmekanismer som beskrivs i frågor 1 och 2. Specifikt testar vi om Htt förändrar assembliering eller aktivitet hos EnB1 vid mitokondriella membran, påverkar kardiolipinorganisation eller modulerar Bax-rekrytering och aktivering. Genom att koppla amyloidrelaterad proteinfelveckning till mitokondriell membranomformning syftar dessa studier till att förklara hur proteinaggregation kan störa mitokondriell kvalitetskontroll och utlösa neuronal celldöd.
För att besvara dessa frågor kombinerar vi biokemisk rekonstitution, analyser av protein–lipidinteraktioner, cellbiologi samt avancerade strukturella metoder inklusive kryo-elektronmikroskopi och kryo-elektrontomografi. Vårt mål är att identifiera de molekylära principer genom vilka proteinassembléer och lipidorganisation samordnar mitokondriell membranomformning och därigenom reglerar grundläggande beslut mellan cellöverlevnad och celldöd. På längre sikt syftar arbetet till att identifiera mekanistiska mål för terapeutiska strategier som kan återställa mitokondriell homeostas vid sjukdomar såsom cancer och neurodegeneration.
Utvalda publikationer
Peripheral membrane protein endophilin B1 probes, perturbs and permeabilizes lipid bilayers, Thorlacius et al., 2025, Communications Biology
Amphipathic Motifs Regulate N-BAR Protein Endophilin B1 Auto-inhibition and Drive Membrane Remodeling, Bhatt et al., 2021, Structure
Finansiering

Gruppmedlemmar
Publikationer
-
Peripheral membrane protein endophilin B1 probes, perturbs and permeabilizes lipid bilayers
Ingår i Communications Biology, 2025
- DOI för Peripheral membrane protein endophilin B1 probes, perturbs and permeabilizes lipid bilayers
- Ladda ner fulltext (pdf) av Peripheral membrane protein endophilin B1 probes, perturbs and permeabilizes lipid bilayers