Mowbray labb

Vi studerar hur proteiner ser ut på molekylär nivå, och försöker förstå hur det möjliggör deras många olika funktioner inom biologin. Det övergripande målet är att tillämpa denna information för att göra nyttiga och intressanta saker. Till exempel, i många projekt, vi leta efter små molekyler som binder till och blockerar funktionen av enzymer som är viktiga för vissa patogener, och som kan utvecklas till läkemedel som dödar dessa patogener. I andra projekt, vi tittar på detaljerna för hur enzymer binder till sina substrat, och utföra kemin de gör, i hopp om att använda denna information för att skapa nya och bättre enzymer. Det finns så många möjligheter!
Populärvetenskaplig presentation
Sjukdomsalstrande mikroorganismer innebär en stor börda för världens befolkning. Ett exempel är Plasmodium falciparum som orsakar malaria. Världshälsoorganisationen (WHO) räknar med att nästan 1 miljon människor, mestadels afrikanska barn, dör pga malaria varje år; halva världens befolkning bor i riskområden. Mycobacterium tuberculosis orsakar sjukdomen tuberkulos, och man räknar med att var tredje människa på jorden är smittad av tuberkulosbakterien och att 1,4 miljoner människor dör varje år. Dessa sjukdomar ger upphov till stor fattigdom och mycket lidande i tredje världen, och genom uppkomsten av läkemedelsresistenta stammar, förväntas situationen bli mycket värre. Eftersom vacciner ännu inte finns att tillgå, har utvecklandet av nya läkemedel hög prioritet. Viljan hos de flesta läkemedelsföretag att investera i den grundforskning som behövs för att utveckla nya läkemedel som kan förebygga och bota sjukdomar är direkt kopplad till den eventuella vinst de kan göra. Sjukdomar som drabbar världens fattigare delar är inte tillräckligt vinstgivande för de flesta företag att satsa på. Det är därför viktigt att akademiska laboratorier och företag arbetar tillsammans och hjälps åt i detta arbete.
Kanske mer intressant för de stora läkemedelsföretagen, och samtidigt mera skrämmande för medborgarna i industriländerna, är den grupp av bakterier som kallas för ESKAPE patogener. Dessa läkemedelsresistenta bakterier orsakar majoriteten av de infektioner som förvärvas i sjukhusmiljö. Sådana infektioner är speciellt lömska, eftersom en patient som besöker ett sjukhus för en lättare åkomma, kan på grund av besöket erhålla en infektion som är betydligt allvarligare.
I vårt labb, vi fokusera på enzymer (katalytiska proteiner) som patogenerna behöver, men som inte finns hos människor. Vi klonar, uttrycker och renar tillräckligt stora kvantiteter av de studerade enzymerna för att sedan undersöka deras struktur med hjälp av en metod som kallas röntgenkristallografi. Parallellt försöker vi hitta små molekyler (inhibitorer) som blockera patogenernas enzymer selektivt, utan att påverka våra egna enzymer. Vi designar också nya inhibitorer baserat på proteinets 3D struktur, och hittar helt nya typer av inhibitorer genom högkapacitetsscreening.
Forskning
...
Gruppmedlemmar
Publikationer
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024
- DOI för Antibiotic class with potent in vivo activity targeting lipopolysaccharide synthesis in Gram-negative bacteria
- Ladda ner fulltext (pdf) av Antibiotic class with potent in vivo activity targeting lipopolysaccharide synthesis in Gram-negative bacteria
Ingår i European Journal of Medicinal Chemistry, 2024
- DOI för Design, synthesis, and in vitro biological evaluation of meta-sulfonamidobenzamide-based antibacterial LpxH inhibitors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Design, synthesis, and in vitro biological evaluation of meta-sulfonamidobenzamide-based antibacterial LpxH inhibitors
Ingår i Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2024
Bacterial type I signal peptidase inhibitors-Optimized hits from nature
Ingår i European Journal of Medicinal Chemistry, 2022
Ingår i ACS - Infectious Diseases, s. 482-498, 2022
- DOI för Synthesis and in vitro biological evaluation of quinolinyl pyrimidines targeting type II NADH-dehydrogenase (NDH-2)
- Ladda ner fulltext (pdf) av Synthesis and in vitro biological evaluation of quinolinyl pyrimidines targeting type II NADH-dehydrogenase (NDH-2)
Ingår i European Journal of Medicinal Chemistry, 2021
- DOI för Antibacterial sulfonimidamide-based oligopeptides as type I signal peptidase inhibitors: Synthesis and biological evaluation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Antibacterial sulfonimidamide-based oligopeptides as type I signal peptidase inhibitors: Synthesis and biological evaluation
Ingår i European Journal of Medicinal Chemistry, s. 1346-1360, 2018
Ingår i Bioorganic & Medicinal Chemistry, s. 897-911, 2017
- DOI för Design, synthesis and in vitro biological evaluation of oligopeptides targeting E. coli type I signal peptidase (LepB)
- Ladda ner fulltext (pdf) av Design, synthesis and in vitro biological evaluation of oligopeptides targeting E. coli type I signal peptidase (LepB)
Ingår i Molecular Microbiology, s. 13-25, 2017
Ingår i ChemMedChem, s. 2024-2036, 2016
- DOI för Targeting an Aromatic Hotspot in Plasmodium falciparum 1-Deoxy-d-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase with -Arylpropyl Analogues of Fosmidomycin
- Ladda ner fulltext (pdf) av Targeting an Aromatic Hotspot in Plasmodium falciparum 1-Deoxy-d-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase with -Arylpropyl Analogues of Fosmidomycin
Expanding the catalytic triad in epoxide hydrolases and related enzymes
Ingår i ACS Catalysis, s. 5702-5713, 2015
- DOI för Expanding the catalytic triad in epoxide hydrolases and related enzymes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Expanding the catalytic triad in epoxide hydrolases and related enzymes
Ingår i ChemistryOpen, s. 342-362, 2015
- DOI för Optimization and Evaluation of 5-Styryl-Oxathiazol-2-one Mycobacterium tuberculosis Proteasome Inhibitors as Potential Antitubercular Agents
- Ladda ner fulltext (pdf) av Optimization and Evaluation of 5-Styryl-Oxathiazol-2-one Mycobacterium tuberculosis Proteasome Inhibitors as Potential Antitubercular Agents
Ingår i Journal of Medicinal Chemistry, s. 2988-3001, 2015
- DOI för Synthesis and Bioactivity of beta-Substituted Fosmidomycin Analogues Targeting 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase
- Ladda ner fulltext (pdf) av Synthesis and Bioactivity of beta-Substituted Fosmidomycin Analogues Targeting 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase
Ingår i Bioscience Reports, s. 865-877, 2014
- DOI för Arabidopsis cytosolic acyl-CoA-binding proteins ACBP4, ACBP5 and ACBP6 have overlapping but distinct roles in seed development
- Ladda ner fulltext (pdf) av Arabidopsis cytosolic acyl-CoA-binding proteins ACBP4, ACBP5 and ACBP6 have overlapping but distinct roles in seed development
DXR Inhibition by Potent Mono- and Disubstituted Fosmidomycin Analogues
Ingår i Journal of Medicinal Chemistry, s. 6190-6199, 2013
- DOI för DXR Inhibition by Potent Mono- and Disubstituted Fosmidomycin Analogues
- Ladda ner fulltext (pdf) av DXR Inhibition by Potent Mono- and Disubstituted Fosmidomycin Analogues
Structural studies on Mycobacterium tuberculosis DXR in complex with the antibiotic FR-900098
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 134-143, 2012
- DOI för Structural studies on Mycobacterium tuberculosis DXR in complex with the antibiotic FR-900098
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural studies on Mycobacterium tuberculosis DXR in complex with the antibiotic FR-900098
Ingår i MedChemComm, s. 620-626, 2012
Trisubstituted Imidazoles as Mycobacterium tuberculosis Glutamine Synthetase Inhibitors
Ingår i Journal of Medicinal Chemistry, s. 2894-2898, 2012
- DOI för Trisubstituted Imidazoles as Mycobacterium tuberculosis Glutamine Synthetase Inhibitors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Trisubstituted Imidazoles as Mycobacterium tuberculosis Glutamine Synthetase Inhibitors
Ingår i Journal of Medicinal Chemistry, s. 4964-4976, 2011
- DOI för Design, Synthesis, and X-ray Crystallographic Studies of alpha-Aryl Substituted Fosmidomycin Analogues as Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis 1-Deoxy-D-xylulose 5-Phosphate Reductoisomerase
- Ladda ner fulltext (pdf) av Design, Synthesis, and X-ray Crystallographic Studies of alpha-Aryl Substituted Fosmidomycin Analogues as Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis 1-Deoxy-D-xylulose 5-Phosphate Reductoisomerase
Ingår i Plant Molecular Biology, s. 33-45, 2011
- DOI för Expression and beta-glucan binding properties of Scots pine (Pinus sylvestris L.) antimicrobial protein (Sp-AMP)
- Ladda ner fulltext (pdf) av Expression and beta-glucan binding properties of Scots pine (Pinus sylvestris L.) antimicrobial protein (Sp-AMP)
Structural and functional studies of mycobacterial IspD enzymes
Ingår i Acta Crystallographica Section D, s. 403-414, 2011
- DOI för Structural and functional studies of mycobacterial IspD enzymes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural and functional studies of mycobacterial IspD enzymes
Ingår i The FEBS Journal, s. 793-808, 2011
- DOI för Structures of type B ribose 5-phosphate isomerase from Trypanosoma cruzi shed light on the determinants of sugar specificity in the structural family
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structures of type B ribose 5-phosphate isomerase from Trypanosoma cruzi shed light on the determinants of sugar specificity in the structural family
Ingår i Journal of Organic Chemistry, s. 8986-8998, 2011
- DOI för Synthesis of Functionalized Cinnamaldehyde Derivatives by an Oxidative Heck Reaction and Their Use as Starting Materials for Preparation of Mycobacterium tuberculosis 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase Inhibitors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Synthesis of Functionalized Cinnamaldehyde Derivatives by an Oxidative Heck Reaction and Their Use as Starting Materials for Preparation of Mycobacterium tuberculosis 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate Reductoisomerase Inhibitors
Conformational Changes and Ligand Recognition of Escherichia coli d-Xylose Binding Protein Revealed
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 657-668, 2010
- DOI för Conformational Changes and Ligand Recognition of Escherichia coli d-Xylose Binding Protein Revealed
- Ladda ner fulltext (pdf) av Conformational Changes and Ligand Recognition of Escherichia coli d-Xylose Binding Protein Revealed
Zinc ions bind to and inhibit activated protein C
Ingår i Thrombosis and Haemostasis, s. 544-553, 2010
- DOI för Zinc ions bind to and inhibit activated protein C
- Ladda ner fulltext (pdf) av Zinc ions bind to and inhibit activated protein C
Ingår i Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, s. 6649-6654, 2009
Ingår i Carbohydrate Research, s. 869-880, 2009
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 504-513, 2009
- DOI för Structural basis for the inhibition of Mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase by novel ATP-competitive inhibitors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural basis for the inhibition of Mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase by novel ATP-competitive inhibitors
The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce
Ingår i Plant Molecular Biology, s. 277-289, 2009
- DOI för The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce
- Ladda ner fulltext (pdf) av The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce
Ingår i The FEBS Journal, s. 2116-2124, 2009
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 217-228, 2008
- DOI för Crystal Structures of Mammalian Glutamine Synthetases Illustrate Substrate-Induced Conformational Changes and Provide Opportunities for Drug and Herbicide Design
- Ladda ner fulltext (pdf) av Crystal Structures of Mammalian Glutamine Synthetases Illustrate Substrate-Induced Conformational Changes and Provide Opportunities for Drug and Herbicide Design
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 667-679, 2008
- DOI för D-ribose-5-phosphate isomerase B from Escherichia coli is also a functional D-allose-6-phosphate isomerase, while the Mycobacterium tuberculosis enzyme is not
- Ladda ner fulltext (pdf) av D-ribose-5-phosphate isomerase B from Escherichia coli is also a functional D-allose-6-phosphate isomerase, while the Mycobacterium tuberculosis enzyme is not
Ingår i Bioorganic & Medicinal Chemistry, s. 5501-5513, 2008
- DOI för Evaluation of the amino acid binding site of Mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase for drug discovery
- Ladda ner fulltext (pdf) av Evaluation of the amino acid binding site of Mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase for drug discovery
Ingår i Protein Science, s. 1275-1284, 2008
- DOI för Removal of distal protein-water hydrogen bonds in a plant epoxide hydrolase increases catalytic turnover but decreases thermostability
- Ladda ner fulltext (pdf) av Removal of distal protein-water hydrogen bonds in a plant epoxide hydrolase increases catalytic turnover but decreases thermostability
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 622-633, 2008
- DOI för Structural, biochemical and in vivo investigations of the threonine synthase from Mycobacterium tuberculosis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural, biochemical and in vivo investigations of the threonine synthase from Mycobacterium tuberculosis
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 109-119, 2008
- DOI för X-ray structure of Candida antarctica lipase A shows a novel lid structure and a likely mode of interfacial activation
- Ladda ner fulltext (pdf) av X-ray structure of Candida antarctica lipase A shows a novel lid structure and a likely mode of interfacial activation
Ingår i The FEBS Journal, s. 3695-3703, 2007
Ingår i Combinatorial chemistry & high throughput screening, s. 783-789, 2007
Ingår i Journal of Biological Chemistry, s. 19905-19916, 2007
Ingår i Acta Crystallogr D Biol Crystallogr, s. 807-13, 2006
Ingår i Acta Crystallogr. Section D Biol. Crystallogr., s. 807-813, 2006
X-ray structure of potato epoxide hydrolase sheds light on its substrate specificity
Ingår i Protein Science, s. 1628-1637, 2006
Competitive inhibitors of Mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase
Ingår i J Biol Chem, s. 6416-22, 2005
Structure and function of carbonic anhydrases from Mycobacterium tuberculosis.
Ingår i J Biol Chem, s. 18782-9, 2005
Structure of an atypical epoxide hydrolase from Mycobacterium tuberculosis
Ingår i J Mol Biol, s. 1048-56, 2005
Ingår i Proc. Natl. Acad. Sci. USA, s. 10499-10504, 2005
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 10499-10504, 2005
Ingår i Tetrahedron letters, s. 3691-3694, 2005
Mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase has a known fold, but a novel active site
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 799-809, 2004
Mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase has a known fold, but a novel active site.
Ingår i J Mol Biol, s. 799-809, 2004
Medarbetare
...