Avbildande masspektrometri

Beskrivning
Vår forskargrupp som leds av Prof. Per Andrén använder avbildande masspektrometri (MSI) för att studera spatial lokalisering av endogena molekyler, t.ex. neurotransmittorer, metaboliter, lipider, peptider, proteiner, samt läkemedel och deras metaboliter i biologiska vävnadssnitt. Vi studerar neurokemiska processer vid Parkinsons sjukdom (PD), specifikt L-Dopa-inducerad dyskinesier (LID), och Lewy body demens (LBD) och PD demens. Vi är också en del av SciLifeLab-plattformen Spatial Biology där vi samarbetar med både akademiska forskare och industri. Erik Jansson (bitr. universitetslektor) leder ett arbetslag som fokuserar på metodutveckling för proteomikstudier. Särskilt fokus ligger på studier av proteinstruktur med väte–deuteriumutbyte och identifiering av biokemiska reaktionsvägar med termisk proteomprofilering.
Läs mer
MSI är en ny teknik som används för att kartlägga den rumsliga fördelningen av neurotransmittorer, peptider, små proteiner, läkemedel och metaboliter in situ direkt i biologiska vävnadssnitt. Tekniken är specifik och möjliggör visualisering och kvantifiering av ett stort antal molekyler samtidigt. Vi använder olika avbildande masspektrometriska tekniker (MALDI och DESI). Vårt laboratorium är utrustat med den absolut senaste tekniken för MSI.
Neurokemiska förändringar associerade med L-DOPA-inducerad dyskinesier vid Parkinsons sjukdom. L-DOPA utgör den mest effektiva behandlingen för Parkinsons sjukdom (PS). Efter långvarig behandling med L-DOPA uppstår dock motoriska fluktuationer (L-DOPA-inducerade dyskinesier) som kan bli invalidiserande. Syftet med projektet är att belysa de bakomliggande patofysiologiska mekanismerna genom att studera olika djurmodeller av PS, samt humana postmortem hjärnor och cerebrospinalvätska med MSI.
Spatial omics patofysiologi-baserad diagnos av parkinsondemens och Lewy body demens. Parkinsondemens och Lewy body demens (LBD) är liknande sjukdomar och överlappar med både Alzheimers sjukdom och PS. Det saknas kliniska diagnostiska test och prognostiska biomarkörer för att differentiera de olika demenssjukdomarna vilket är viktigt för att kunna ge patienterna rätt behandling och för kunna inkludera dem i läkemedelsstudier som avser att bromsa sjukdomsförloppet. Vi använder olika 'spatial omics' tekniker som möjliggör storskalig avbildande analys av molekyler, dvs de ger detaljerad kunskap om exakt vilka celler som finns i ett vävnadsprov, var de är lokaliserade i relation till varandra och dess tillstånd. Vi studerar de bakomliggande sjukdomsmekanismerna vid demens vid PS och LBD och projektet avser att bidra till ökad kunskap om biomarkörer för sjukdomarna.
Avbildande masspektrometri öppnar nya möjligheter för läkemedelsforskning. Vi visualiserar och kvantifierierar läkemedel och dess metaboliter i olika organ in situ. Vi studerar även farmakokinetiska och farmakodynamiska (PK/PD) effekter av läkemedel på funktionella biomolekyler med tekniken och undersöker läkemedels toxiska effekter och hur läkemedel passerar över blod-hjärnbarriärer.
Publikationer
Ingår i Plants, 2025
- DOI för Interpopulational Variation in Cyclotide Production in Heavy-Metal-Treated Pseudometallophyte (Viola tricolor L.)
- Ladda ner fulltext (pdf) av Interpopulational Variation in Cyclotide Production in Heavy-Metal-Treated Pseudometallophyte (Viola tricolor L.)
Ingår i Journal of Chromatography A, 2025
- DOI för Predicting retention on immobilized artificial membrane chromatography: Lipophilicity-based versus lipophilicity-independent models
- Ladda ner fulltext (pdf) av Predicting retention on immobilized artificial membrane chromatography: Lipophilicity-based versus lipophilicity-independent models
Ingår i Analytical Chemistry, s. 1338-1346, 2025
- DOI för Comprehensive Approach for Sequential MALDI-MSI Analysis of Lipids, N-Glycans, and Peptides in Fresh-Frozen Rodent Brain Tissues
- Ladda ner fulltext (pdf) av Comprehensive Approach for Sequential MALDI-MSI Analysis of Lipids, N-Glycans, and Peptides in Fresh-Frozen Rodent Brain Tissues
Identification of New Ketamine Metabolites and Their Detailed Distribution in the Mammalian Brain
Ingår i ACS Chemical Neuroscience, s. 1335-1341, 2024
- DOI för Identification of New Ketamine Metabolites and Their Detailed Distribution in the Mammalian Brain
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification of New Ketamine Metabolites and Their Detailed Distribution in the Mammalian Brain
Regional Changes in Brain Biomolecular Markers in a Collagen-Induced Arthritis Rat Model
Ingår i Biology, 2024
- DOI för Regional Changes in Brain Biomolecular Markers in a Collagen-Induced Arthritis Rat Model
- Ladda ner fulltext (pdf) av Regional Changes in Brain Biomolecular Markers in a Collagen-Induced Arthritis Rat Model
The involvement of cyclotides in the heavy metal tolerance of Viola spp.
Ingår i Scientific Reports, 2024
- DOI för The involvement of cyclotides in the heavy metal tolerance of Viola spp.
- Ladda ner fulltext (pdf) av The involvement of cyclotides in the heavy metal tolerance of Viola spp.
Ingår i Chemical Communications, s. 9238-9241, 2024
Hydrogen production by a fully de novo enzyme
Ingår i Dalton Transactions, s. 12905-12916, 2024
- DOI för Hydrogen production by a fully de novo enzyme
- Ladda ner fulltext (pdf) av Hydrogen production by a fully de novo enzyme
Applying Spatial Metabolomics To Investigate Age- and Drug-Induced Neurochemical Changes
Ingår i ACS Chemical Neuroscience, s. 2822-2829, 2024
- DOI för Applying Spatial Metabolomics To Investigate Age- and Drug-Induced Neurochemical Changes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Applying Spatial Metabolomics To Investigate Age- and Drug-Induced Neurochemical Changes
2024
- DOI för Untargeted metabolomics and quantitative analysis of tryptophan metabolites in myalgic encephalomyelitis patients and healthy volunteers: a comparative study using high resolution mass spectrometry
- Ladda ner fulltext (pdf) av Untargeted metabolomics and quantitative analysis of tryptophan metabolites in myalgic encephalomyelitis patients and healthy volunteers: a comparative study using high resolution mass spectrometry
Ingår i ACS Chemical Neuroscience, s. 2811-2821, 2024
- DOI för Hypoxic-Ischemic Insult Alters Polyamine and Neurotransmitter Abundance in the Specific Neonatal Rat Brain Subregions
- Ladda ner fulltext (pdf) av Hypoxic-Ischemic Insult Alters Polyamine and Neurotransmitter Abundance in the Specific Neonatal Rat Brain Subregions
Spatial multiomic insights into acute cocaine exposure
Ingår i PNAS Nexus, 2024
- DOI för Spatial multiomic insights into acute cocaine exposure
- Ladda ner fulltext (pdf) av Spatial multiomic insights into acute cocaine exposure
Inquiry-based Learning of Proteomics and Metabolomics
Ingår i Journal of Chemical Education, s. 521-529, 2024
- DOI för Inquiry-based Learning of Proteomics and Metabolomics
- Ladda ner fulltext (pdf) av Inquiry-based Learning of Proteomics and Metabolomics
Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
Ingår i Nature Biotechnology, s. 1046-1050, 2024
- DOI för Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
- Ladda ner fulltext (pdf) av Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
Ingår i Journal of the American Society for Mass Spectrometry, s. 836-846, 2023
- DOI för On-Tissue Chemical Derivatization for Comprehensive Mapping of Brain Carboxyl and Aldehyde Metabolites by MALDI-MS Imaging
- Ladda ner fulltext (pdf) av On-Tissue Chemical Derivatization for Comprehensive Mapping of Brain Carboxyl and Aldehyde Metabolites by MALDI-MS Imaging
RNA interactome capture in Escherichia coli globally identifies RNA-binding proteins
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 4572-4587, 2023
- DOI för RNA interactome capture in Escherichia coli globally identifies RNA-binding proteins
- Ladda ner fulltext (pdf) av RNA interactome capture in Escherichia coli globally identifies RNA-binding proteins
Enantioselective CE–MS analysis of ketamine metabolites in urine
Ingår i Electrophoresis, s. 125-134, 2023
- DOI för Enantioselective CE–MS analysis of ketamine metabolites in urine
- Ladda ner fulltext (pdf) av Enantioselective CE–MS analysis of ketamine metabolites in urine
Ingår i Journal of Proteome Research, s. 1377-1380, 2023
- DOI för Electrochemically Etched Tapered-Tip Stainless-Steel Electrospray-Ionization Emitters for Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry
- Ladda ner fulltext (pdf) av Electrochemically Etched Tapered-Tip Stainless-Steel Electrospray-Ionization Emitters for Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry
Ingår i Analytical Chemistry, s. 1149-1158, 2023
Ingår i Nature Communications, 2023
- DOI för Prosaposin maintains lipid homeostasis in dopamine neurons and counteracts experimental parkinsonism in rodents
- Ladda ner fulltext (pdf) av Prosaposin maintains lipid homeostasis in dopamine neurons and counteracts experimental parkinsonism in rodents
Ingår i Analytical Chemistry, s. 18352-18360, 2023
- DOI för Rapid Metabolic Profiling of 1 ÎŒL Crude Cerebrospinal Fluid by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging Can Differentiate De Novo Parkinson's Disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Rapid Metabolic Profiling of 1 ÎŒL Crude Cerebrospinal Fluid by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging Can Differentiate De Novo Parkinson's Disease
Ingår i Analytical Chemistry, s. 15400-15408, 2023
- DOI för Label-Free Quantitative Thermal Proteome Profiling Reveals Target Transcription Factors with Activities Modulated by MC3R Signaling
- Ladda ner fulltext (pdf) av Label-Free Quantitative Thermal Proteome Profiling Reveals Target Transcription Factors with Activities Modulated by MC3R Signaling
Ingår i npj Parkinson's Disease, 2023
- DOI för Spatial lipidomics reveals brain region-specific changes of sulfatides in an experimental MPTP Parkinson's disease primate model
- Ladda ner fulltext (pdf) av Spatial lipidomics reveals brain region-specific changes of sulfatides in an experimental MPTP Parkinson's disease primate model
Ingår i ACS Chemical Biology, s. 147-158, 2022
- DOI för Region-Specific and Age-Dependent Multitarget Effects of Acetylcholinesterase Inhibitor Tacrine on Comprehensive Neurotransmitter Systems
- Ladda ner fulltext (pdf) av Region-Specific and Age-Dependent Multitarget Effects of Acetylcholinesterase Inhibitor Tacrine on Comprehensive Neurotransmitter Systems
Ingår i Analytical Chemistry, s. 1795-1803, 2022
Basal ganglia neuropeptides show abnormal processing associated with L-DOPA-induced dyskinesia
Ingår i npj Parkinson's Disease, 2022
- DOI för Basal ganglia neuropeptides show abnormal processing associated with L-DOPA-induced dyskinesia
- Ladda ner fulltext (pdf) av Basal ganglia neuropeptides show abnormal processing associated with L-DOPA-induced dyskinesia
The involvement of cyclotides in mutual interactions of violets and the two-spotted spider mite
Ingår i Scientific Reports, 2022
- DOI för The involvement of cyclotides in mutual interactions of violets and the two-spotted spider mite
- Ladda ner fulltext (pdf) av The involvement of cyclotides in mutual interactions of violets and the two-spotted spider mite
Prediction Models for Brain Distribution of Drugs Based on Biomimetic Chromatographic Data
Ingår i Molecules, 2022
- DOI för Prediction Models for Brain Distribution of Drugs Based on Biomimetic Chromatographic Data
- Ladda ner fulltext (pdf) av Prediction Models for Brain Distribution of Drugs Based on Biomimetic Chromatographic Data
Ingår i PLANTS, 2022
- DOI för The Influence of Plant Stress Hormones and Biotic Elicitors on Cyclotide Production in Viola uliginosa Cell Suspension Cultures
- Ladda ner fulltext (pdf) av The Influence of Plant Stress Hormones and Biotic Elicitors on Cyclotide Production in Viola uliginosa Cell Suspension Cultures
Well-Plate muFASP for Proteomic Analysis of Single Pancreatic Islets
Ingår i Journal of Proteome Research, s. 1167-1174, 2022
- DOI för Well-Plate muFASP for Proteomic Analysis of Single Pancreatic Islets
- Ladda ner fulltext (pdf) av Well-Plate muFASP for Proteomic Analysis of Single Pancreatic Islets
Cyclotide host-defense tailored for species and environments in violets from the Canary Islands
Ingår i Scientific Reports, 2021
- DOI för Cyclotide host-defense tailored for species and environments in violets from the Canary Islands
- Ladda ner fulltext (pdf) av Cyclotide host-defense tailored for species and environments in violets from the Canary Islands
Ingår i Journal of the American Society for Mass Spectrometry, s. 2791-2802, 2021
Ingår i Science Advances, 2021
- DOI för Mass spectrometry imaging identifies abnormally elevated brain L-DOPA levels and extrastriatal monoaminergic dysregulation in L-DOPA-induced dyskinesia
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mass spectrometry imaging identifies abnormally elevated brain L-DOPA levels and extrastriatal monoaminergic dysregulation in L-DOPA-induced dyskinesia
Ingår i Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, s. 3324-3338, 2021
- DOI för Differential regulation of oxidative stress, microbiota-derived, and energy metabolites in the mouse brain during sleep
- Ladda ner fulltext (pdf) av Differential regulation of oxidative stress, microbiota-derived, and energy metabolites in the mouse brain during sleep
Ingår i ACS Chemical Neuroscience, s. 1811-1823, 2021
- DOI för Integration of Mass Spectrometry Imaging and Machine Learning Visualizes Region-Specific Age-Induced and Drug-Target Metabolic Perturbations in the Brain
- Ladda ner fulltext (pdf) av Integration of Mass Spectrometry Imaging and Machine Learning Visualizes Region-Specific Age-Induced and Drug-Target Metabolic Perturbations in the Brain
Ingår i Biological Psychiatry, s. 16-27, 2021
- DOI för TAAR1-Dependent and-Independent Actions of Tyramine in Interaction With Glutamate Underlie Central Effects of Monoamine Oxidase Inhibition
- Ladda ner fulltext (pdf) av TAAR1-Dependent and-Independent Actions of Tyramine in Interaction With Glutamate Underlie Central Effects of Monoamine Oxidase Inhibition
Ingår i EBioMedicine, 2021
- DOI för Antibacterial activity of apramycin at acidic pH warrants wide therapeutic window in the treatment of complicated urinary tract infections and acute pyelonephritis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Antibacterial activity of apramycin at acidic pH warrants wide therapeutic window in the treatment of complicated urinary tract infections and acute pyelonephritis
Efficacy of EBL-1003 (apramycin) against Acinetobacter baumannii lung infections in mice
Ingår i Clinical Microbiology and Infection, s. 1315-1321, 2021
- DOI för Efficacy of EBL-1003 (apramycin) against Acinetobacter baumannii lung infections in mice
- Ladda ner fulltext (pdf) av Efficacy of EBL-1003 (apramycin) against Acinetobacter baumannii lung infections in mice
Ingår i Nature Protocols, s. 3298-3321, 2021
Ingår i Molecular Psychiatry, s. 7732-7745, 2021
- DOI för Neuropharmacokinetic visualization of regional and subregional unbound antipsychotic drug transport across the blood-brain barrier.
- Ladda ner fulltext (pdf) av Neuropharmacokinetic visualization of regional and subregional unbound antipsychotic drug transport across the blood-brain barrier.
Ingår i ACS Chemical Neuroscience, s. 2529-2541, 2021
- DOI för Wide-Ranging Effects on the Brain Proteome in a Transgenic Mouse Model of Alzheimer's Disease Following Treatment with a Brain-Targeting Somatostatin Peptide
- Ladda ner fulltext (pdf) av Wide-Ranging Effects on the Brain Proteome in a Transgenic Mouse Model of Alzheimer's Disease Following Treatment with a Brain-Targeting Somatostatin Peptide
Ingår i Analytical Chemistry, s. 14676-14684, 2020
- DOI för Cross-validated Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging Quantitation Protocol for a Pharmaceutical Drug and Its Drug-Target Effects in the Brain Using Time-of-Flight and Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Analyzers
- Ladda ner fulltext (pdf) av Cross-validated Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging Quantitation Protocol for a Pharmaceutical Drug and Its Drug-Target Effects in the Brain Using Time-of-Flight and Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Analyzers
Ingår i Journal of the American Society for Mass Spectrometry, s. 2553-2557, 2020
Ingår i Neurobiology of Disease, 2020
- DOI för Simultaneous mass spectrometry imaging of multiple neuropeptides in the brain and alterations induced by experimental parkinsonism and L-DOPA therapy
- Ladda ner fulltext (pdf) av Simultaneous mass spectrometry imaging of multiple neuropeptides in the brain and alterations induced by experimental parkinsonism and L-DOPA therapy
Ingår i Journal of Aerosol Medicine, s. 43-53, 2020
mu Opioid Receptor Agonism for L-DOPA-Induced Dyskinesia in Parkinson's Disease
Ingår i Journal of Neuroscience, s. 6812-6819, 2020
Ingår i Frontiers in Pharmacology, 2020
- DOI för Non-dopaminergic Alterations in Depression-Like FSL Rats in Experimental Parkinsonism and L-DOPA Responses
- Ladda ner fulltext (pdf) av Non-dopaminergic Alterations in Depression-Like FSL Rats in Experimental Parkinsonism and L-DOPA Responses
Ingår i Frontiers in Aging Neuroscience, 2020
- DOI för Deficits in Motor Performance, Neurotransmitters and Synaptic Plasticity in Elderly and Experimental Parkinsonian Mice Lacking GPR37
- Ladda ner fulltext (pdf) av Deficits in Motor Performance, Neurotransmitters and Synaptic Plasticity in Elderly and Experimental Parkinsonian Mice Lacking GPR37
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 15226-15235, 2019
- DOI för alpha-synuclein-lipoprotein interactions and elevated ApoE level in cerebrospinal fluid from Parkinson's disease patients
- Ladda ner fulltext (pdf) av alpha-synuclein-lipoprotein interactions and elevated ApoE level in cerebrospinal fluid from Parkinson's disease patients
Advanced Mass Spectrometry Imaging in Neuropharmacology
2019