Bengt Sennblad
Avdelningschef vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi; Molekylär evolution
- E-post:
- bengt.sennblad@icm.uu.se
- Besöksadress:
- Husargatan 3
752 37 UPPSALA - Postadress:
- Box 596
751 24 UPPSALA
- Akademiska meriter:
- FD
Kort presentation
Jag är manager för NBIS team för Health and Clinical-support, vilket är en del av Scilifelabs Bioinformatikplattform. Vårt team tillhandahåller avancerad bioinformatiksupport och utbildning till svenska livsvetenskaper, med fokus på studier med medicinsk eller hälso-relateraad forskning.
Biografi
Jag är FD i biologi och Docent i datalogi. Min tidigare forskning spänner över växters molekylära evolution , probabilistiska modeller och algoritmer för studier av genfamiljsevolution i ett multipla-arterkontext, analys och metodutveckling för genomtäckade genetiska associationsstudier, specifikt i relation till kardiovaskulär sjukdom.
Forskning
Vi arbetar främst med humandata, inklusive genomik, proteomik, metabolomik och fenotypisk/klinisk information. Vårt arbete inkluderar konsultaitoner och praktisk support inom studiedesign, dataprocessning, genetiska associationsanalyser, identifiering av biomarkörer, cancergenomik, integrativ multi-omikanalys och maskininlärning. Vi är engagerade i Scilifelab/KAW natinoella program för Data-drivna livsvetenskaper (DDLS), och tillhandahåller bioinformatiksupport mot DDLS forskningsområde för precisionsmedicin och diagnostik.
För ytterligare information om NBIS aktiviteter och forsningsstödstjänster, se https://nbis.se.
Publikationer
Senaste publikationer
-
Ingår i Microbiology Resource Announcements, 2025
- DOI för Genome sequences of six clinical isolates of Candida parapsilosis exhibiting different degrees and temporal regulation of biofilm formation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genome sequences of six clinical isolates of Candida parapsilosis exhibiting different degrees and temporal regulation of biofilm formation
-
Ingår i PLOS ONE, 2024
- DOI för Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
- Ladda ner fulltext (pdf) av Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
-
Ingår i Rheumatology, s. 3461-3470, 2022
- DOI för Identification and Functional Characterization of a Novel Susceptibility Locus for Small Vessel Vasculitis with MPO-ANCA
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification and Functional Characterization of a Novel Susceptibility Locus for Small Vessel Vasculitis with MPO-ANCA
-
The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits
Ingår i Nature Genetics, s. 840-860, 2021
-
Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
Ingår i Human Molecular Genetics, s. 393-409, 2021
- DOI för Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
Alla publikationer
Artiklar i tidskrift
-
Ingår i Microbiology Resource Announcements, 2025
- DOI för Genome sequences of six clinical isolates of Candida parapsilosis exhibiting different degrees and temporal regulation of biofilm formation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genome sequences of six clinical isolates of Candida parapsilosis exhibiting different degrees and temporal regulation of biofilm formation
-
Ingår i PLOS ONE, 2024
- DOI för Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
- Ladda ner fulltext (pdf) av Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
-
Ingår i Rheumatology, s. 3461-3470, 2022
- DOI för Identification and Functional Characterization of a Novel Susceptibility Locus for Small Vessel Vasculitis with MPO-ANCA
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification and Functional Characterization of a Novel Susceptibility Locus for Small Vessel Vasculitis with MPO-ANCA
-
The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits
Ingår i Nature Genetics, s. 840-860, 2021
-
Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
Ingår i Human Molecular Genetics, s. 393-409, 2021
- DOI för Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genome-wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci
-
Ingår i Scientific Reports, 2021
- DOI för The overlap of genetic susceptibility to schizophrenia and cardiometabolic disease can be used to identify metabolically different groups of individuals
- Ladda ner fulltext (pdf) av The overlap of genetic susceptibility to schizophrenia and cardiometabolic disease can be used to identify metabolically different groups of individuals
-
Ingår i Genes and Immunity, s. 100-108, 2020
- DOI för Analysis of the genetic variants associated with circulating levels of sgp130: Results from the IMPROVE study
- Ladda ner fulltext (pdf) av Analysis of the genetic variants associated with circulating levels of sgp130: Results from the IMPROVE study
-
Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes
Ingår i Nature Communications, 2019
- DOI för Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes
-
Ingår i Genome Biology, 2019
- DOI för Conbase: a software for unsupervised discovery of clonal somatic mutations in single cells through read phasing
- Ladda ner fulltext (pdf) av Conbase: a software for unsupervised discovery of clonal somatic mutations in single cells through read phasing
-
Genetic variation in CADM2 as a link between psychological traits and obesity
Ingår i Scientific Reports, 2019
- DOI för Genetic variation in CADM2 as a link between psychological traits and obesity
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genetic variation in CADM2 as a link between psychological traits and obesity
-
Breast cancer quantitative proteome and proteogenomic landscape
Ingår i Nature Communications, 2019
- DOI för Breast cancer quantitative proteome and proteogenomic landscape
- Ladda ner fulltext (pdf) av Breast cancer quantitative proteome and proteogenomic landscape
-
H19 Induces Abdominal Aortic Aneurysm Development and Progression
Ingår i Circulation, s. 1551-1568, 2018
-
Ingår i Nature Communications, 2018
- DOI för GWAS and colocalization analyses implicate carotid intima-media thickness and carotid plaque loci in cardiovascular outcomes
- Ladda ner fulltext (pdf) av GWAS and colocalization analyses implicate carotid intima-media thickness and carotid plaque loci in cardiovascular outcomes
-
Ingår i Atherosclerosis, s. 196-204, 2017
- DOI för Identification of a novel proinsulin-associated SNP and demonstration that proinsulin is unlikely to be a causal factor in subclinical vascular remodelling using Mendelian randomisation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification of a novel proinsulin-associated SNP and demonstration that proinsulin is unlikely to be a causal factor in subclinical vascular remodelling using Mendelian randomisation