Dataset för forskning
Ett av kraven för att beviljas tillgång till prov från U-CANs provsamling är att forskaren godkänner att dela data från genomförda provanalyser med U-CAN efter att en studie har publicerats. Andra forskare kan genom U-CAN söka tillgång till dessa dataset med potentiell möjlighet att koppla ytterligare kliniska data till varje individ. Godkänt etiktillstånd som beskriver den forskning som ska genomföras krävs för alla studier som rör data från U-CAN.
Kontakta U-CAN för detaljerad information innan ansökan om tillgång till dataset lämnas in, det kan finnas restriktioner gällande hur olika data kan delas.
Idag finns dataset från följande publicerade forskningsstudier tillgängliga hos U-CAN för ansökan om uttag.
Genomik
Nunes L, et al. Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers. Nature. 633(8028):137-146 (2024).
- Sekvenseringsdata, helgenom. Tumörvävnad och matchad normal från vävnad/helblod från 1063 patienter med kolorektalcancer. Se även European Nucleotide Archive, Project: PRJEB61514 (Short somatic variant call, CNV and SV data)
- Transkriptomsekvensdata från RNA-sekvensering av total-RNA från tumörvävnad från 1063 patienter med kolorektalcancer, samt intilliggande normalvävnad från 120 patienter. Se även ArrayExpress, Accession E-MTAB-12862
Proteomik
Álvez MB, et al. A human pan-disease blood atlas of the circulating proteome. Science. 390, eadx2678 (2025).
- Proteomikdata från PEA-analys (Olink Explore HT) av EDTA-plasmaprover från 1 992 personer med cancer (bröstcancer n=483; ovariecancer, n=199; prostatacancer, n=343; kolorektalcancer, n=479; lungcancer, n=488).
Álvez MB, et al. Next generation pan-cancer blood proteome profiling using proximity extension assay. Nat Commun. 14(1):4308 (2023).
- Proteomikdata från PEA-analys (Olink Explore 1536) av EDTA-plasmaprover från 1 477 personer med cancer (AML, n=50; CLL, n=48; DLBCL, n=55; myelom, n=38; kolorektalcancer, n=221; lungcancer, n=268; gliom, n=145; bröstcancer, n=152; cervixcancer, n=102; endometriecancer, n=101; ovariecancer, n=134; prostatacancer, n=163). Se även BioStudies Accession S-BSST935 (NPX values)