Gruppmedlemmar
Okamoto labb

Virus har anpassat sig till alla eukaryota värdar för deras spridning under en lång evolutionär historia. Dessa anpassningar visar sig som förvärvade funktionella strukturer hos virionerna. Enligt teorin är vår strategi att avslöja nya funktionella strukturella egenskaper hos problematiska virus genom att utföra intensiva strukturella jämförelser mellan olika virus inom samma utvecklingslinje. För att kunna göra dessa jämförelser bestämmer vi regelbundet strukturerna av ”saknade” virus med hjälp av kryoelektronmikroskopi.
Vår grupp fokuserar också på strukturen av jättevirus som är involverade i djupa biologiska frågor och på COVID-19 på grund av akutbehovet.
Vänligen kontakta kenta.okamoto@icm.uu.se om du är intresserad av att studera strukturella / molekylära funktioner hos virus i ditt master/kandidatprojekt eller praktik.
Populärvetenskaplig presentation
finns inte
Forskning
finns inte på svenska
People
Kenta Okamoto, PhD (Docent) | |
Han Wang, PhD student
|
Mohammad Maruf Hassan | Master Project Student |
Gabriela García Hernández | Master Project Student |
Dags Macs | Master Project Student |
Alumini
Postdoc/Researchers
- Victoria Goddio (2020-2021)
PhD students
- Anna Munke (2014-2020) - currently, VR postdoc in Molecular Biphysics Program, Uppsala Unviersity
Master Project Students
- Miranda Åström (2023), Björn Ancker Persson (2023)
- Diogo de Matos Filipe (2022)
- Diyar Ayranci (2021), Shradha Mohanty (2021)
- Dylan Valli (2020), Sahar Abdul Wahed Shammakhi (2020)
Research Training Students (Master Students)
- Claudia Gonzalez Valdivia (2022)
- Christina Chalkiadaki (2021), Sibel Ismetova Ahmedova (2021), Siqi Li (2021)
- Nora Euler (2020), Maike Lüftner (2020), Shruti Ravi (2020)
Research Training Students (Bachelor Students)
- Emy Vu (2016), Miranda Berg (2016)
Publikationer
Ingår i PLoS Pathogens, 2024
Ingår i Nature Methods, s. 1608-1611, 2024
- DOI för Microsecond time-resolved X-ray scattering by utilizing MHz repetition rate at second-generation XFELs
- Ladda ner fulltext (pdf) av Microsecond time-resolved X-ray scattering by utilizing MHz repetition rate at second-generation XFELs
Ingår i PLoS Pathogens, 2023
- DOI för Capsid structure of a fungal dsRNA megabirnavirus reveals its previously unidentified surface architecture
- Ladda ner fulltext (pdf) av Capsid structure of a fungal dsRNA megabirnavirus reveals its previously unidentified surface architecture
Structure and its transformation of elliptical nege- like virus Tanay virus
Ingår i Journal of General Virology, 2023
- DOI för Structure and its transformation of elliptical nege- like virus Tanay virus
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structure and its transformation of elliptical nege- like virus Tanay virus
A full-length infectious cDNA clone of a dsRNA totivirus-like virus
Ingår i Virology, s. 127-133, 2022
- DOI för A full-length infectious cDNA clone of a dsRNA totivirus-like virus
- Ladda ner fulltext (pdf) av A full-length infectious cDNA clone of a dsRNA totivirus-like virus
Ingår i Scientific Reports, 2022
- DOI för A novel capsid protein network allows the characteristic internal membrane structure of Marseilleviridae giant viruses
- Ladda ner fulltext (pdf) av A novel capsid protein network allows the characteristic internal membrane structure of Marseilleviridae giant viruses
Primordial Capsid and Spooled ssDNA Genome Structures Unravel Ancestral Events of Eukaryotic Viruses
Ingår i mBio, 2022
- DOI för Primordial Capsid and Spooled ssDNA Genome Structures Unravel Ancestral Events of Eukaryotic Viruses
- Ladda ner fulltext (pdf) av Primordial Capsid and Spooled ssDNA Genome Structures Unravel Ancestral Events of Eukaryotic Viruses
Ingår i Viruses, 2022
- DOI för Structural Insights into Common and Host-Specific Receptor-Binding Mechanisms in Algal Picorna-like Viruses
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural Insights into Common and Host-Specific Receptor-Binding Mechanisms in Algal Picorna-like Viruses
Precise Triggering and Chemical Control of Single-Virus Fusion within Endosomes
Ingår i Journal of Virology, 2021
Acquired Functional Capsid Structures in Metazoan Totivirus-like dsRNA Virus
Ingår i Structure, s. 888-+, 2020
Capsid structure of a marine algal virus of the order Picornavirales
Ingår i Journal of Virology, 2020
- DOI för Capsid structure of a marine algal virus of the order Picornavirales
- Ladda ner fulltext (pdf) av Capsid structure of a marine algal virus of the order Picornavirales
Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
Ingår i Communications Physics, 2020
- DOI för Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
- Ladda ner fulltext (pdf) av Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
3D analysis of human islet amyloid polypeptide crystalline structures in Drosophila melanogaster
Ingår i PLOS ONE, 2019
- DOI för 3D analysis of human islet amyloid polypeptide crystalline structures in Drosophila melanogaster
- Ladda ner fulltext (pdf) av 3D analysis of human islet amyloid polypeptide crystalline structures in Drosophila melanogaster
Electrospray sample injection for single-particle imaging with x-ray lasers
Ingår i Science Advances, 2019
Ingår i Nature Scientific Data, 2018
Ingår i IUCrJ, s. 531-541, 2018
Cryo-EM structure of a Marseilleviridae virus particle reveals a large internal microassembly
Ingår i Virology, s. 239-245, 2018
Femtosecond X-ray Fourier holography imaging of free-flying nanoparticles
Ingår i Nature Photonics, s. 150-153, 2018
Ingår i Journal of Molecular Biology, s. 594-601, 2018
Crystal structure of human proteasome assembly chaperone PAC4 involved in proteasome formation
Ingår i Protein Science, s. 1080-1085, 2017
Experimental strategies for imaging bioparticles with femtosecond hard X-ray pulses
Ingår i IUCrJ, s. 251-262, 2017
Ingår i Scientific Reports, 2017
- DOI för Structural variability and complexity of the giant Pithovirus sibericum particle revealed by high-voltage electron cryo-tomography and energy-filtered electron cryo-microscopy
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural variability and complexity of the giant Pithovirus sibericum particle revealed by high-voltage electron cryo-tomography and energy-filtered electron cryo-microscopy
Ingår i Scientific Data, 2016
Ingår i Scientific Reports, 2016
- DOI för The infectious particle of insect-borne totivirus-like Omono River virus has raised ridges and lacks fibre complexes
- Ladda ner fulltext (pdf) av The infectious particle of insect-borne totivirus-like Omono River virus has raised ridges and lacks fibre complexes