Karakterisering av proteiner involverade i stresstolerans hos cyanobakterier
Vi undersöker rollen av ferritinliknande proteiner i cyanobakterien Nostoc.
I detta projekt använder vi olika genetiska och biokemiska strategier för att undersöka rollen av ferritinliknande proteiner i redoxkontroll, järnhomeostas och reglering av ROS-nivåer. De ferritinliknande proteinerna i Nostoc inkluderar ett förmodat bakterioferritin och fyra Dps-proteiner. Dps är starkt kopplade till DNA-skydd, järnlagring samt avgiftning av H2O2 i bakterieceller som bekämpar oxidativ stress.


Figur 1 och 2. En modell av proteinets ryggradsstruktur hos ett Dps-protein.
Det första syftet med denna del av projektet kommer att vara att studera svaret hos N. punctiforme på oxidativ stress genom att använda en proteomik metod. Mer exakt kommer den proteomiska profilen för deletions- och överuttrycksstammar att studeras med hjälp av kvantitativ gelbaserad (LC-MS) metodik i celler odlade under "normala" tillväxtförhållanden såväl som i närvaro av reaktiva syrearter (ROS) och under hög ljus. Detta arbete kommer att ge en förståelse för det övergripande cellulära svaret på stresstillstånd och mer specifikt rollen för de ferritinliknande proteinerna såsom Dps-proteiner och bakterioferritiner i denna process. Resultaten kommer att vara av betydelse för framtida systemmetabolisk ingenjörsarbete för att designa robusta stammar av cyanobakterier för storskalig odling för produktion av biobränslen.

Figur 2.

Figur 3.
Figur 2. Ett fylogenetiskt träd av de fem olika Dps-liknande proteinerna i Nostoc punctiforme Ett fylogenetiskt träd av de fem olika Dps-liknande proteinerna i Nostoc punctiforme.
Figur 3. Tvådimensionell gelelektrofores för att identifiera proteiner involverade i stresstolerans.
Samarbetsparter
Mer information kommer.