Hinas labb
Forskningen i vår grupp rör mekanismerna bakom RNA-interferens, epigenetik och RNA-transport mellan celler i djur. För att på ett relativt enkelt sätt kunna studera detta använder vi rundmasken Caenorhabditis elegans. Förutom vårt huvudsakliga forskningsspår vill vi även främja användandet av C. elegans som modellorganism i Uppsala och Sverige.
Populärvetenskaplig presentation
Alla celler som bygger upp en människas kropp innehåller samma DNA-sekvenser - ändå har de helt olika utseende och funktion, från tarmens små epitelceller till nervceller som kan bli upp till en meter långa. Hur går detta till? Svaret ligger i genreglering, alltså hur DNA-sekvensens gener avläses till budbärar-RNA och till slut översätts till proteiner. Ett sätt att reglera genuttryck är genom icke-kodande RNA, d.v.s. RNA som inte avläses till proteiner utan har egna funktioner. Detta kan till exempel ske genom att dessa RNA-molekyler binder till budbärar-RNA som då bryts ner, vilket gör att det produceras mindre av motsvarande protein.
Reglering av genuttryck räcker dock inte för att alla celler i kroppen skall kunna utvecklas på rätt sätt och sköta sina uppgifter. För detta krävs också att cellerna kan skicka signaler till och ta emot signaler från andra celler. På senare år har man upptäckt att celler verkar kunna kommunicera med varandra genom att skicka RNA-molekyler. Vi har RNA-molekyler i vårt blodomlopp, liksom i andra kroppsvätskor som urin och bröstmjölk. Dessa RNA-molekyler skulle kunna tas upp av andra celler och därigenom påverka genuttrycket i dessa celler. RNA-molekylerna skulle då alltså fungera som ett slags hormoner. Även om detta är ett mycket hett forskningsområde hämmas det av att de flesta studier inte utförs hela djur utan i celler som odlas i laboratoriet. Av förklarliga skäl är det svårt att få dessa celler att bete sig som om de befann sig i ett levande djur, vilket gör det svårt att studera cell-cellkommunikation. Att studera processen i levande däggdjur är däremot komplicerat av etiska, ekonomiska och praktiska skäl. I min grupp använder vi oss istället av rundmasken C. elegans. Denna mask är mycket väl lämpad för den här typen av heldjursstudier, eftersom den har flera, om än enkla, vävnader. Dessutom transporteras RNA effektivt mellan maskens celler och vävnader, och ärvs till avkomman, vilket gör processen relativt enkel att studera.
Vi är främst intresserade av hur RNA-medierad genreglering i en cell är kopplad till transport av RNA till andra celler och kommande generation(er). Genom att identifiera proteiner som behövs för RNA-reglering och för RNA-transport och därefter studera var dessa proteiner befinner sig och vilka andra proteiner de interagerar med kan vi skapa ett nätverk av proteiner som behövs för RNA-medierad genreglering och RNA-transport till andra celler. Genom vår forskning lär vi oss mer om mekanismerna och de biologiska funktionerna kring RNA-medierad genreglering och transport och nedärvning av RNA.
Forskning
...
Gruppmedlemmar
Publikationer
Ingår i PLOS ONE, 2024
Ingår i PLOS ONE, 2023
- DOI för Transcriptomics of ivermectin response in Caenorhabditis elegans: Integrating abamectin quantitative trait loci and comparison to the Ivermectin-exposed DA1316 strain
- Ladda ner fulltext (pdf) av Transcriptomics of ivermectin response in Caenorhabditis elegans: Integrating abamectin quantitative trait loci and comparison to the Ivermectin-exposed DA1316 strain
Ingår i Parasites & Vectors, 2022
- DOI för Ivermectin-induced gene expression changes in adult Parascaris univalens and Caenorhabditis elegans: a comparative approach to study anthelminthic metabolism and resistance in vitro
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ivermectin-induced gene expression changes in adult Parascaris univalens and Caenorhabditis elegans: a comparative approach to study anthelminthic metabolism and resistance in vitro
Ingår i Evolution Letters, s. 207-216, 2019
- DOI för Experimentally reduced insulin/IGF‐1 signaling in adulthood extends lifespan of parents and improves Darwinian fitness of their offspring
- Ladda ner fulltext (pdf) av Experimentally reduced insulin/IGF‐1 signaling in adulthood extends lifespan of parents and improves Darwinian fitness of their offspring
Ingår i Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences, 2017
Ingår i International journal of experimental pathology (Print), 2017
Ingår i RNA, s. 297-307, 2017
Ingår i Scientific Reports, 2016
- DOI för Nematodes join the family of chondroitin sulfate-synthesizing organisms: Identification of an active chondroitin sulfotransferase in Caenorhabditis elegans
- Ladda ner fulltext (pdf) av Nematodes join the family of chondroitin sulfate-synthesizing organisms: Identification of an active chondroitin sulfotransferase in Caenorhabditis elegans
SID-5 Is an Endosome-Associated Protein Required for Efficient Systemic RNAi in C. elegans
Ingår i Current Biology, s. 1938-1943, 2012
Ingår i Genome Research, s. 888-899, 2008
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 6714-6726, 2007
Treasure hunt in an amoeba: non-coding RNAs in Dictyostelium discoideum.
Ingår i Current Genetics, s. 141-159, 2007
Ingår i Nucleic Acids Research, s. 773-784, 2006
Ingår i Eukaryotic Cell, s. 924-934, 2006
Medarbetare
...