Maia labb

Vi strävar efter nya sätt att utforska den underbart komplexa världen av strukturell dynamik på nanoskala. Vi är inriktade på utveckling av linsfria avbildningsmetoder med röntgenstrålar, med användning av röntgenfri-elektronlaser som en kraftfull koherent ljuskälla.Ett vanligt tema för många moderna bildtekniker är den ökande komplexiteten i experimentella inställningar. liksom dataanalysen. Vårt laboratorium fokuserar både på att bygga ny instrumentering, till exempel leverans av provfri provtagning för röntgenundersökningar av enstaka partikelavbildning, liksom att skapa algoritmer för att analysera de resulterande data. Denna samdesign av alla delar av experimentet är avgörande för framgång och kräver ett brett spektrum av expertis, från biologi till fysiker och datavetenskap, vilket resulterar i en mycket samarbetsvillig och tvärvetenskaplig miljö.
Populärvetenskaplig presentation
Proteiner är de grundläggande maskinerna i biologiska system, men att observera dem i arbete är otroligt svårt eftersom de är extremt små och ständigt i rörelse. I vårt laboratorium strävar vi efter att lösa detta genom att använda världens mest kraftfulla röntgenfria elektronlasrar (XFEL) för att ta ultrasnabba ögonblicksbilder av enskilda proteiner. Genom att träffa dessa molekyler med extremt korta och intensiva röntgenpulser kan vi fånga deras strukturer innan den intensiva strålningen hinner förstöra dem.
För att kringgå behovet av att artificiellt frysa eller kristallisera proverna banar vi väg för två olika metoder för att föra in proteinerna i röntgenstrålen:
- Aerosolbaserad avbildning: Här använder vi elektrospray-jonisering för att injicera isolerade, enskilda proteiner samtidigt som vi drastiskt reducerar bakgrundsbrus med hjälp av en kontrollerad heliummiljö.
- Lösningbaserad avbildning: Här använder vi en innovativ, ultratunn vätsjestråle på endast 50 nanometer i syfte att detektera diffraktion från enskilda proteiner direkt i deras nästan naturliga vätskemiljö.
Det ultimata målet med vår forskning är att spela in ”molekylära filmer” som avslöjar exakt hur proteiner ändrar form när de utför livsviktiga funktioner. Genom att fånga proteindynamik på sub-millisekundnivå, en molekyl i taget – oavsett om de flyger genom en gas eller är suspenderade i en naturlig vätskelösning – öppnar vårt arbete helt nya horisonter för att förstå grundläggande biologiska processer som enzymkatalys, signaltransduktion och proteinveckning.
Forskning
Vi utnyttjar banbrytande teknisk utveckling, såsom röntgenfria elektronlasrar (XFEL), fjärde generationens synkrotroner och den enorma beräkningskraft som GPU:er möjliggör, för att driva utvecklingen av linslösa avbildningsmetoder med röntgenstrålning. Våra projekt omfattar koherent diffraktionsavbildning av enskilda partiklar (SPI), fluktuationsspridning och ptykografi. För mer information, vänligen se https://lmb.icm.uu.se.
Gruppmedlemmar
Publikationer
-
High-throughput in situ single particle X-ray imaging of dehydrating viral capsids
Ingår i Light, 2026
- DOI för High-throughput in situ single particle X-ray imaging of dehydrating viral capsids
- Ladda ner fulltext (pdf) av High-throughput in situ single particle X-ray imaging of dehydrating viral capsids
-
Aerosol size determination via light scattering of viruses and protein complexes
Ingår i Communications Physics, 2025
- DOI för Aerosol size determination via light scattering of viruses and protein complexes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Aerosol size determination via light scattering of viruses and protein complexes
-
Ingår i Crystals, 2025
- DOI för Coarse-Graining and Classifying Massive High-Throughput XFEL Datasets of Crystallization in Supercooled Water
- Ladda ner fulltext (pdf) av Coarse-Graining and Classifying Massive High-Throughput XFEL Datasets of Crystallization in Supercooled Water
-
Impact of gas background on XFEL single-particle imaging
Ingår i Scientific Reports, 2025
- DOI för Impact of gas background on XFEL single-particle imaging
- Ladda ner fulltext (pdf) av Impact of gas background on XFEL single-particle imaging
-
Ingår i Structure, s. 829-835, 2025
-
Ptychographic reconstructions performed in real time and offline have equivalent quality
Ingår i Scientific Reports, 2025
- DOI för Ptychographic reconstructions performed in real time and offline have equivalent quality
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ptychographic reconstructions performed in real time and offline have equivalent quality
-
Ingår i npj Computational Materials, 2025
- DOI för SPRING, an effective and reliable framework for image reconstruction in single-particle Coherent Diffraction Imaging
- Ladda ner fulltext (pdf) av SPRING, an effective and reliable framework for image reconstruction in single-particle Coherent Diffraction Imaging
-
Ingår i Journal of the American Chemical Society, s. 19555-19565, 2024
- DOI för Controlling Drug Partitioning in Individual Protein Condensates through Laser-Induced Microscale Phase Transitions
- Ladda ner fulltext (pdf) av Controlling Drug Partitioning in Individual Protein Condensates through Laser-Induced Microscale Phase Transitions
-
Ingår i Journal of Synchrotron Radiation, s. 222-232, 2024
- DOI för Enhancing electrospray ionization efficiency for particle transmission through an aerodynamic lens stack
- Ladda ner fulltext (pdf) av Enhancing electrospray ionization efficiency for particle transmission through an aerodynamic lens stack
-
Helium-electrospray improves sample delivery in X-ray single-particle imaging experiments
Ingår i Scientific Reports, 2024
- DOI för Helium-electrospray improves sample delivery in X-ray single-particle imaging experiments
- Ladda ner fulltext (pdf) av Helium-electrospray improves sample delivery in X-ray single-particle imaging experiments
-
Ingår i Nature Methods, s. 1608-1611, 2024
- DOI för Microsecond time-resolved X-ray scattering by utilizing MHz repetition rate at second-generation XFELs
- Ladda ner fulltext (pdf) av Microsecond time-resolved X-ray scattering by utilizing MHz repetition rate at second-generation XFELs
-
Observation of a single protein by ultrafast X-ray diffraction
Ingår i Light, 2024
- DOI för Observation of a single protein by ultrafast X-ray diffraction
- Ladda ner fulltext (pdf) av Observation of a single protein by ultrafast X-ray diffraction
-
Resolving Nonequilibrium Shape Variations among Millions of Gold Nanoparticles
Ingår i ACS Nano, s. 15576-15589, 2024
- DOI för Resolving Nonequilibrium Shape Variations among Millions of Gold Nanoparticles
- Ladda ner fulltext (pdf) av Resolving Nonequilibrium Shape Variations among Millions of Gold Nanoparticles
-
3D-printed sheet jet for stable megahertz liquid sample delivery at X-ray free-electron lasers
Ingår i IUCrJ, s. 662-670, 2023
- DOI för 3D-printed sheet jet for stable megahertz liquid sample delivery at X-ray free-electron lasers
- Ladda ner fulltext (pdf) av 3D-printed sheet jet for stable megahertz liquid sample delivery at X-ray free-electron lasers
-
Noise reduction and mask removal neural network for X-ray single-particle imaging
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 122-132, 2022
- DOI för Noise reduction and mask removal neural network for X-ray single-particle imaging
- Ladda ner fulltext (pdf) av Noise reduction and mask removal neural network for X-ray single-particle imaging
-
Ingår i IUCrJ, s. 204-214, 2022
- DOI för Unsupervised learning approaches to characterizing heterogeneous samples using X-ray single-particle imaging
- Ladda ner fulltext (pdf) av Unsupervised learning approaches to characterizing heterogeneous samples using X-ray single-particle imaging
-
3D diffractive imaging of nanoparticle ensembles using an x-ray laser
Ingår i Optica, s. 15-23, 2021
- DOI för 3D diffractive imaging of nanoparticle ensembles using an x-ray laser
- Ladda ner fulltext (pdf) av 3D diffractive imaging of nanoparticle ensembles using an x-ray laser
-
Introduction to the special issue on Ptychography: software and technical developments
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 384-385, 2021
-
Ptychographic wavefront characterization for single-particle imaging at x-ray lasers
Ingår i Optica, s. 551-562, 2021
- DOI för Ptychographic wavefront characterization for single-particle imaging at x-ray lasers
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ptychographic wavefront characterization for single-particle imaging at x-ray lasers
-
Acquired Functional Capsid Structures in Metazoan Totivirus-like dsRNA Virus
Ingår i Structure, s. 888-+, 2020
-
Ingår i Scientific Data, 2020
- DOI för Diffraction data from aerosolized Coliphage PR772 virus particles imaged with the Linac Coherent Light Source
- Ladda ner fulltext (pdf) av Diffraction data from aerosolized Coliphage PR772 virus particles imaged with the Linac Coherent Light Source
-
Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
Ingår i Communications Physics, 2020
- DOI för Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
- Ladda ner fulltext (pdf) av Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
-
Ingår i Structural Dynamics, 2020
- DOI för Perspectives on single particle imaging with x rays at the advent of high repetition rate x-ray free electron laser sources
- Ladda ner fulltext (pdf) av Perspectives on single particle imaging with x rays at the advent of high repetition rate x-ray free electron laser sources
-
Pulse-to-pulse wavefront sensing at free-electron lasers using ptychography
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 949-956, 2020
- DOI för Pulse-to-pulse wavefront sensing at free-electron lasers using ptychography
- Ladda ner fulltext (pdf) av Pulse-to-pulse wavefront sensing at free-electron lasers using ptychography
-
The role of transient resonances for ultra-fast imaging of single sucrose nanoclusters
Ingår i Nature Communications, 2020
- DOI för The role of transient resonances for ultra-fast imaging of single sucrose nanoclusters
- Ladda ner fulltext (pdf) av The role of transient resonances for ultra-fast imaging of single sucrose nanoclusters
-
Three-Dimensional Coherent Bragg Imaging of Rotating Nanoparticles
Ingår i Physical Review Letters, 2020
- DOI för Three-Dimensional Coherent Bragg Imaging of Rotating Nanoparticles
- Ladda ner fulltext (pdf) av Three-Dimensional Coherent Bragg Imaging of Rotating Nanoparticles
-
Electrospray sample injection for single-particle imaging with x-ray lasers
Ingår i Science Advances, 2019
-
Evaluation of serial crystallographic structure determination within megahertz pulse trains
Ingår i Structural Dynamics, 2019
- DOI för Evaluation of serial crystallographic structure determination within megahertz pulse trains
- Ladda ner fulltext (pdf) av Evaluation of serial crystallographic structure determination within megahertz pulse trains
-
A statistical approach to detect protein complexes at X-ray free electron laser facilities
Ingår i Communications Physics, 2018
-
Ingår i IUCrJ, s. 531-541, 2018
-
Cryo-EM structure of a Marseilleviridae virus particle reveals a large internal microassembly
Ingår i Virology, s. 239-245, 2018
-
Femtosecond X-ray Fourier holography imaging of free-flying nanoparticles
Ingår i Nature Photonics, s. 150-153, 2018
-
Megahertz serial crystallography
Ingår i Nature Communications, 2018
- DOI för Megahertz serial crystallography
- Ladda ner fulltext (pdf) av Megahertz serial crystallography
-
Rayleigh-scattering microscopy for tracking and sizing nanoparticles in focused aerosol beams
Ingår i IUCrJ, s. 673-680, 2018
- DOI för Rayleigh-scattering microscopy for tracking and sizing nanoparticles in focused aerosol beams
- Ladda ner fulltext (pdf) av Rayleigh-scattering microscopy for tracking and sizing nanoparticles in focused aerosol beams
-
Single-particle imaging without symmetry constraints at an X-ray free-electron laser
Ingår i IUCrJ, s. 727-736, 2018
- DOI för Single-particle imaging without symmetry constraints at an X-ray free-electron laser
- Ladda ner fulltext (pdf) av Single-particle imaging without symmetry constraints at an X-ray free-electron laser
-
Three-dimensional localization of nanoscale battery reactions using soft X-ray tomography
Ingår i Nature Communications, 2018
- DOI för Three-dimensional localization of nanoscale battery reactions using soft X-ray tomography
- Ladda ner fulltext (pdf) av Three-dimensional localization of nanoscale battery reactions using soft X-ray tomography
-
Coherent soft X-ray diffraction imaging of Coliphage PR772 at the Linac coherent light source
Ingår i Scientific Data, 2017
-
Correlations in scattered X-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses
Ingår i Physical Review Letters, 2017
-
Experimental strategies for imaging bioparticles with femtosecond hard X-ray pulses
Ingår i IUCrJ, s. 251-262, 2017
-
Nanosurveyor: a framework for real-time data processing
Ingår i Advanced Structural and Chemical Imaging, 2017
- DOI för Nanosurveyor: a framework for real-time data processing
- Ladda ner fulltext (pdf) av Nanosurveyor: a framework for real-time data processing
-
Near-edge X-ray refraction fine structure microscopy
Ingår i Applied Physics Letters, 2017
-
Ingår i Scientific Reports, 2017
- DOI för Structural variability and complexity of the giant Pithovirus sibericum particle revealed by high-voltage electron cryo-tomography and energy-filtered electron cryo-microscopy
- Ladda ner fulltext (pdf) av Structural variability and complexity of the giant Pithovirus sibericum particle revealed by high-voltage electron cryo-tomography and energy-filtered electron cryo-microscopy
-
A data set from flash X-ray imaging of carboxysomes
Ingår i Scientific Data, 2016
- DOI för A data set from flash X-ray imaging of carboxysomes
- Ladda ner fulltext (pdf) av A data set from flash X-ray imaging of carboxysomes
-
CCP-FEL: a collection of computer programs for free-electron laser research
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 1117-1120, 2016
-
Ingår i Scientific Data, 2016
-
Data publication with the structural biology data grid supports live analysis
Ingår i Nature Communications, 2016
- DOI för Data publication with the structural biology data grid supports live analysis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Data publication with the structural biology data grid supports live analysis
-
Hummingbird: monitoring and analyzing flash X-ray imaging experiments in real time
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 1042-1047, 2016
-
Open data set of live cyanobacterial cells imaged using an X-ray laser
Ingår i Scientific Data, 2016
- DOI för Open data set of live cyanobacterial cells imaged using an X-ray laser
- Ladda ner fulltext (pdf) av Open data set of live cyanobacterial cells imaged using an X-ray laser
-
SHARP: a distributed GPU-based ptychographic solver
Ingår i Journal of applied crystallography, s. 1245-1252, 2016
-
Single-shot diffraction data from the Mimivirus particle using an X-ray free-electron laser
Ingår i Scientific Data, 2016
- DOI för Single-shot diffraction data from the Mimivirus particle using an X-ray free-electron laser
- Ladda ner fulltext (pdf) av Single-shot diffraction data from the Mimivirus particle using an X-ray free-electron laser