CARAMBA - Clinical Analysis & Research Applying Mass spectrometry & Bioinformatics at Akademiska
Vår masspektrometri- och SIMOA-plattform syftar till att möjliggöra klinikfokuserad forskning och utveckling, vilket gynnar flera forskargrupper och olika patientkategorier.
Beskrivning av vår forskningsinfrastruktur
Med hjälp av masspektrometri utvecklar vi analytiska metoder och genomför riktade analyser av lågmolekylära föreningar exempelvis gallsyror, korta- och medellånga fettsyror (SCFA och MCFA) samt miljöföroreningar. Dessutom utför vi icke-riktade (untarget) analyser, sk. metabolomik, lipidomik och exposomik. Vi mäter även proteinkoncentrationer i kroppsvätskor med ultra-känslig SIMOA-teknologi.
Vi har etablerat ett toppmodernt högupplöst masspektrometrilaboratorium i nära samarbete mellan institutionen för medicinska vetenskaper och Region Uppsala (Klinisk kemi och farmakologi; KKF). Sedan 2020 har vi utökat verksamheten och installerat en SIMOA-plattform för ultra-känsliga kvantitativa proteinanalyser. Verksamheten är förlagd i KKFs lokaler, som delas med Uppsala universitet och använder samma specialiserade infrastruktur. Både rutinmässig diagnostisk analys och FoU bedrivs på de fyra befintliga högupplösta masspektrometrarna och SIMOA-plattformen.
Vår tvärvetenskapliga och organisationsövergripande plattform främjar synergier och erbjuder unika, kostnadseffektiva möjligheter, särskilt inom translationell och klinisk forskning. Vårt team av experter inom masspektrometri, avancerad dataanalys – inklusive artificiell intelligens (AI) – och medicin är avgörande för att maximera potentialen hos denna infrastruktur.
Laboratoriet verkar inom ramen för Akademiska laboratoriets ackreditering SWEDAC (SS-EN ISO 15189) och delar viktig IT-struktur, vilket gör det möjligt för oss att leverera resultat på patientprover som beslutsstöd i ex. kliniska prövningar. Vi deltar också i det internationella externa kvalitetsprogrammet, German External Quality Assessment Scheme (G-EQUAS), för att säkerställa noggrannhet och jämförbarhet vid bedömning av mänsklig exponering för kemikalier.
Vi kan stödja dig med följande analyser:
- Metabolomik - opolära metaboliter
- Metabolomik - polära metaboliter
- Lipidomik
- Korta- och medellånga fettsyror (SCFA och MCFA)
- Gallsyror - konjugerade och okonjugerade former
- Miljöexponeringar (PFAS och PCB) och exposom
- Terapeutisk läkemedelsövervakning (TDM)
- SIMOA - ultra-känsliga kvantitativa proteinanalyser
Tillgängliga analyser
Ansvariga för forskningsinfrastrukturen och kontaktpersoner
Uppsala universitet: kim.kultima(at)medsci.uu.se
Region Uppsala: torbjorn.akerfeldt(at)akademiska.se
Besöksadress
Klinisk kemi och farmakologi, ingång 61, 3 tr
Akademiska sjukhuset
751 85 Uppsala
Leveranser
Akademiska sjukhuset Klinisk kemi och farmakologi, ingång 61, 3 tr
Dag Hammarskjöldsväg 18, via Godsmott
Attn: Asma Al-Grety
751 85 Uppsala Sverige
Kontaktperson för leveranser av prover: asma.al-grety(at)akademiska.se