Behörighetskrav

Kandidatexamen och genomgången kurs Spektroskopi, 10 hp eller motsv.

Mål

Student som genomgått kursen skall kunna

- analysera samband mellan proteiners struktur och funktion.

- göra förutsägelser om tänkbara funktioner för ett givet protein.

- sätta upp strategier för analys av proteiners funktion och egenskaper

- ge exempel på användning av proteiner för industriella och andra ändamål.

Innehåll

- Proteinkemi: Kvantitativ aminosyreanalys. Peptidsekvensning. Kemisk modifiering av proteiner.

- Proteinsyntes och degradation: Biologisk och kemisk proteinsyntes och degradation. Rekombinant proteinsyntes. Intracellulär proteinnedbrytning. Proteinveckning.

- Proteinstruktur: Bestämning av proteiners tredimensionella struktur: Röntgendiffraktion av proteinkristaller, NMR, mikroskopi. Datorgrafisk modellering av proteiner. Proteindatabaser och bioinformatik.

- Funktionell genomik och proteomik: In vitro evolution (med phage display av DNA-bindande proteiner).

- Proteininteraktioner: Proteinligand, protein-DNA och protein-proteininteraktioner. Metoder för interaktionsstudier. Termodynamik i interaktioner.

- Proteinfunktioner: Betydelsen av proteiners olika strukturnivåer för deras funktionella egenskaper. Karaktärisering av struktur-funktionssamband.

- Exempel på proteinfunktion och tillämpningar:

a. Proteinveckningssjukdomar

b. Receptorer och receptor-baserade läkemedel

c. Protein-proteininteraktioner, cellsignallering

d. Multiproteinkomplex, virus.

Undervisning

Undervisningen sker i form av föreläsningar samt i form av laborativa och teoretiska övningar och projekt.

Övningar och projekt är obligatoriska och utföres individuellt.

Examination

Skriftliga prov anordnas vid slutet av kursen och motsvarar 9 hp. Laborationer och projekt motsvarar 6 hp. För godkänt slutbetyg krävs att alla delmoment bedömts godkända. Slutbetyget motsvarar en sammanvägning av resultatet av det skriftliga provet och laborationer.