Behörighetskrav

För tillträde till kursen fordras kunskaper motsvarande Biologi 50 p och kemi 20 p alt. kemi 60 p varav biokemi 20 p och biologi 10 p.

Syfte

Studenten skall efter genomgången kurs kunna: 1. Söka efter biologisk information på webben. 2. Använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer. 3. Lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg. 4. Tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.

Innehåll

Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner. Jämförande analyser av kompletta genom.

Undervisning

Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.

Examination

För att kursen skall bedömas med betyget godkänd fordras att de problembaserade datorövningarna bedömts godkända (3 p). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 p). För studerande som ej godkänts i prov anordnas extra provtillfälle på begäran.