Evolutionära mönster

15 hp

Kursplan, Avancerad nivå, 1BG306

Det finns en senare version av kursplanen.
Kod
1BG306
Utbildningsnivå
Avancerad nivå
Huvudområde(n) med fördjupning
Biologi A1F
Betygsskala
Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
Fastställd av
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 16 december 2008
Ansvarig institution
Institutionen för biologisk grundutbildning

Behörighetskrav

120 hp, inklusive alt. 1) 60 hp biologi samt 30 hp kemi eller 30 hp geovetenskap alt. 2) 90 hp biologi. I båda fallen dessutom Evolutionära processer.

Mål

Kursen fokuserar på hur de evolutionära processerna och den evolutionära historien manifesteras i form av olika mönster som kan observeras i och bland organismer, hur dessa mönster kan detekteras och analyseras för att dra slutsatser om deras orsaker.

Efter kursen ska studenten kunna

  • förklara principerna kring, och tillämpa metoder för, detektion och rekonstruktion av evolutionära mönster;
  • diskutera, problematisera och relatera evolutionära mönster på olika hierarkiska nivåer till evolutionära processer:
  • tillämpa hypoteser om evolutionära mönster för att förklara, diskutera och analysera evolutionära orsakssamband:
  • diskutera och kommunicera principer, problem och forskningsresultat i frågor som rör evolutionära mönster samt förklara och använda sig av evolutionsbiologiska begrepp;
  • skissera och tillämpa valda (kombinationer av) evolutionsbiologiska tekniker och metoder.

Innehåll

Kursen omfattar studier av evolutionära mönster manifesterade på olika hierarkiska nivåer. Kursen omfattar följande moment

  • De biologiska hierarkierna och den evolutionära scenen o Evolutionära enheter, centrala koncept; variation och uppdykande egenskaper, mutation, rekombination; homologi, homoplasi, komplexa system.
  • Utvecklingsbiologiska mönster o Genotyp, fenotyp och anpassning på molekylär nivå; ontogeni och morfogenes, genomisk prägling, modularitet, homeobox gener; utvecklingsmässiga begränsningar
  • Anagenetiska mönster o Populationer och metapopulationer, funktionsgenomik; kvantitativa egenskaper, form och homologi; kopplingsojämnvikter, allelfrekvenser, koalescens. o Metodik: mikrosatelliter, SNP, QTL kartläggning, morfometri
  • Fylogenetiska mönster o Arter och artbegrepp, taxa -ontologi och epistemologi; fylogenier och fylogenetisk analys, substitutionsmodeller, biologisk mångfald, komparativa metoder. o Metodik: DNA sekvensering, fylogenianalys
  • Introgressiva mönster o Haploida, diploida och polyploida genom, genominnehåll, genomorganisation; horisontell genöverföring, genduplikationer, hybridisering; metagenomik. o Metodik: mikromatriser och jämförande genomhybridisering.
  • Spatiella och temporala mönster o Biogeografi, värd-parasit associationer; fossil och paleontologiska modeller, stratigrafi, diversifiering och utdöenden, datering av fylogenier

Dessutom ingår ett projektarbete i anslutning till forskningsprogrammen på EBC. En seminarieserie vilken brett belyser evolutionsbiologi och evolutionsbiologiska metoder och applikationer löper under kursens gång.

Delkurser: Teori 7 hp; Laborationer 4 hp; Projekt 4 hp

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer, seminarier, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten. Deltagande i laborationer, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten är obligatoriskt.

Examination

Teoridelen omfattar ett skriftligt prov motsvarande 7 hp och en seminarieserie som har obligatorisk närvaro och följs upp i diskussionsform. Laborationerna motsvarande 4 hp har obligatorisk närvaro och redovisas muntligen eller skriftligen. Projektarbetet redovisas muntligt och i en skriftlig rapport motsvarande 4 hp.

FÖLJ UPPSALA UNIVERSITET PÅ

facebook
instagram
youtube
linkedin