Behörighetskrav

120 hp inklusive Genomik – experimentella metoder och Bioinformatisk metodik.

Mål

Kursen behandlargenomets organisation, variation, evolution och funktion hos olika organismgrupper.

Efter godkänd kurs skall studenten kunna

• beskriva genomets arkitektur i olika organismgrupper
• förklara hur olika reproduktiva system påverkar genomstorlek och sammansättning
• skissera en förklaringsmodell för skillnaden i arkitektur och geninnehåll mellan genom
• förklara hur genetiska och transkriptionella nätverk regleras på olika nivåer
• förklara hur komplexa egenskaper styrs genetiskt och hur bakomliggande gener identifieras
• diskutera de praktiska konsekvenserna av genomets biologi för bioinformatiska tillämpningar

Innehåll

Genomets innehåll och arkitektur hos olika organismgrupper, variation i genomet och dess betydelse för organismen, mekanismer som styr genernas uttryck. Krafter och mekanismer som styr genomets arkitektur; gen och genomduplicering, organeller och plasmider, spridning av repetitiva och själviska element, horisontell genöverföring. Jämförande genomik, sexuell reproduktion och andra rekombinatoriska processer, kön och könsbestämmandets genetik, genomiska aspekter på artbildning. Genetiska och transkriptionella nätverk och deras reglering, epigenetik, genetiken bakom komplexa egenskaper, identifiering av gener för viktiga egenskaper med QTL-analys och genome-wide association mapping. Interaktioner mellan metaboliska nätverk i naturliga miljöer; symbios och metagenomik.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier och datorövningar.

Examination

Skriftligt prov (3 hp), datorövningar (2 hp).