Behörighetskrav

120 hp inklusive Genomik – experimentella metoder och Bioinformatisk metodik.

Mål

Kursen syftar till att ge studenterna en djupare förståelse av genoms innehåll och arkitektur hos olika organismgrupper och hur faktorer såsom miljö och reproduktion kan påverka genomets evolution.

Efter godkänd kurs skall studenten kunna

• beskriva de grundläggande mekanismer som ger upphov till variation i genom och hur dessa påverkar genomets arkitektur, innehåll och bassammansättning
• förklara skillnader i arkitektur, innehåll och storlek mellan genom
• redogöra för hur jämförande genomik kan användas för att studera och dra slutsatser om organismers biologi och evolution
• diskutera samhälleliga, etiska och vetenskapliga aspekter av syntetisk genomik
• diskutera, sammanfatta och presentera vetenskapliga teorier i frågor som ligger inom ramen för kursen

Innehåll

Grundläggande mekanismer som genererar variation i genom och mönster som dessa ger upphov till i genomet; rekombination och mutationer, duplikation, horisontell genöverföring, mutationsskevhet. Faktorer som påverkar genomets storlek, innehåll och funktion, såsom livsmiljö, reproduktionssystem och populationsstorlek. Grundläggande koncept inom jämförande genomik. Syntetiska genom. Aktuella forskningsfält inom genomik, t.ex. evolution av sex och könskromosomer, ursprung och uppkomst av eukaryota celler och dess organeller, metagenomik och singel-cell genomik.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier, datorövningar och grupparbeten.

Examination

Skriftligt prov (3 hp), datorövningar (2 hp).