Populationsgenetisk analys
Kursplan, Avancerad nivå, 1MB514
Kursen är avvecklad.
- Kod
- 1MB514
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Bioinformatik A1F, Biologi A1F, Teknik A1F
- Betygsskala
- Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 15 februari 2018
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp samt Molekylär evolution eller Evolutionära processer eller Genetisk och molekylär växtbiologi
Mål
Kursen syftar till att ge kunskap om teori och analysmetoder inom populationsgenetiken.
Efter godkänd kurs skall studenten kunna:
- lösa biologiska problem med hjälp av populationsgenetiska principer.
- förklara principerna för populationsgenetiken.
- identifiera relevanta populationsgenetiska problemställningar och formulera strategier för att lösa problemen.
- utnyttja tidigare kvantitativa kunskaper (matematik, statistik, programmering) för att lösa genetiska problem.
Innehåll
Kursen börjar med en introduktion där baskunskaper repeteras (nedärvning och mendelsk genetik), därefter följer kursens två huvudblock:
- Populationsgenetikens principer: allelfrekvenser, allelefrekvensspektrum, kopplingsojämvikt, genetisk diversitet och mått på diversitet, Wright-Fisher-modellen, koalescensteori, inavel, populationsstruktur och selektion.
- Populationsgenetisk analys: koalescensteori och simuleringar, skattning av parametrar (mutationstakt, rekombinationstakt) och neutralitetstest. Exempel på komplexa modeller.
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier och övningar (räkneövningar, analysuppgifter och datorövningar).
Examination
Teori 4 hp; seminarier och övningar 1 hp. För godkänd kurs krävs deltagande i minst 80% av seminarierna och att samtliga analysuppgifter har redovisats skriftligen och är godkända. Teoridelen examineras genom ett skriftligt prov.