Biomedicinsk forskningsmetodik
Kursplan, Avancerad nivå, 3MR101
- Kod
- 3MR101
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Medicinsk vetenskap A1F
- Betygsskala
- Väl godkänd (VG), Godkänd (G), Underkänd (U)
- Fastställd av
- Programkommittén för masterprogrammen vid medicinska fakulteten, 22 augusti 2018
- Ansvarig institution
- Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
Allmänt
Kursen ges som del av masterprogram inom medicinska fakulteten.
Behörighetskrav
Antagen till Masterprogrammet i Medicinsk Forskning.
Kunskaper i engelska motsvarande vad som krävs för grundläggande behörighet till utbildning på grundnivå.
Mål
Kursens syfte är att ge kunskap om aktuella biomedicinska metoder och deras praktiska användning under planering, utförande, analys och felsökning inom forskning.
Efter genomgången kurs ska studenten kunna:
- Beskriva strategier för identifiering av gener av intresse för experimenten
- Utforma DNA/RNA-baserade molekyläbiologiska experiment, t.ex. PCR (design av primers, val av polymeras, PCR-optimering, etc ) och efterföljande analysmetoder (gel-elektrofores, Sanger-sekvenering, etc)
- Välja strategi för analys av uttryck av den studerade genen, avseende bl.a. var uttrycket sker och uttrycksnivå
- Känna till metoder för basala och avancerade mutagenes-metoder och deras begränsningar
- Identifiera, isolera och karakterisera proteiner av intresse från olika källor med hjälp av biokemiska metoder (t.ex. masspektrometri, uttryck av rekombinanta proteiner, NMR)
- Identifiera och analysera posttranslationella modifieringar (bl.a glykosylering, fosforylering, ubiquitinering)
- Beskriva funktionella assays på molekylär och cellulär nivå
- Förstå hur proteinstrukturer kan karakteriseras, samt använda dem för att genomföra enklare modelleringsuppgifter (t.ex. identifiera lämpliga mutations-ställen, möjliga bindningställen för mediciner, eller funktionella protein-domäner för rekombinant uttryck)
- Förstå möjligheter och begränsningar med olika biologiska modellsystem (cell linjer, jäst, nematod, bananfluga, zebrafisk, mus, högra vertebrater)
Innehåll
Kursen beskriver ett brett spektrum av molekylärbiologiska tekniker som används i dagens biomedicinska forskning med syfte att ge studenten en god förståelse om möjligheterna och svagheter av dessa tekniker. Det breda spektrum av metoder från att hantera DNA sekvenser, proteinkarakterisering och analys på cellulär nivå ska ge studenten förutsättning att förstå och använda dessa metoder i sin kommande forskning, och också att kritiskt bedöma andra forskares data.
Undervisning
Undervisningen sker i form av föreläsningar som kompletteras med studentaktiverande undervisning i form av obligatoriska moment (seminarier, journalklubbar, och laborationer). De longitudinella projekt (startade vid tidigare kurser inom programmet) kommer att användas som modellprojekt och fortsätts under kursens gång.
Examination
Examination inkluderar en skriftlig tentamen som betygsätts enligt skalan underkänd (U), godkänd (G) eller väl godkänd (VG). Övriga kompletterande moment examineras genom muntliga och/eller skriftliga rapporter och betygsätts enbart med underkänd (U) eller godkänd (G). För att bli godkänd på kursen krävs att studenten närvarar och är aktiv vid alla obligatoriska moment. Betyg från tentamen och övriga moment kommer vägas in vid slutlig betygsättning för kursen som helhet. Möjlighet att komplettera icke godkända obligatoriska moment ges tidigast vid nästkommande kurstillfälle och i mån av plats. Studenter som underkänts vid första tentamen har rätt till fem om-tentamen.
Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare.
Litteraturlista
Litteraturlista saknas.