Allmänt

Kursen ges inom masterprogrammet i precisionsmedicin (MPM2M).

Behörighetskrav

180 hp inom biologi, (bio-)medicin, bioteknologi, farmaceutisk biovetenskap, medicinsk vetenskap eller annan utbildning som ger relevant kunskap inom cellbiologi, genetik, biokemi och molekylärbiologi. Dessutom krävs kunskaper motsvarande Molekylära tekniker och dataanalys inom precisionsmedicin I (3MG038, 7,5 hp), Introduktion till maskininlärning och artificiell intelligens inom livsvetenskaperna (3FF041, 7,5 hp), samt Biostatistik (2ST134, 7,5 hp) och Introduktion till programmering i R (2ST133, 7,5hp).

Mål

Kunskap och förståelse

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• beskriva grundläggande koncept, metoder och teknologier som används för storskalig kartläggning och avancerad dataanalys av genom, transkriptom, epigenom, metabolom, proteom och mikrobiom
• förklara hur olika typer av molekylära data kan användas för att identifiera sjukdomsorsaker, utveckla individanpassade läkemedel, diagnostisera patienter och för riskskattning
• beskriva molekylär diagnostik som används inom hälso- och sjukvård idag
• diskutera vilken molekylär diagnostik som kommer att bli viktig inom hälso- och sjukvården i framtiden baserat på forskning i området
• förklara fördelar och utmaningar med multi-omics strategier som integrerar olika typer av molekylära data

Färdigheter och förmågor

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• använda grundläggande datorbaserade program för analys av storskaliga molekyära data
• avgöra vilken typ av molekylär data och analysmetod/pipeline som är lämplig att använda givet en viss frågeställning
• analysera, bearbeta och formulera vetenskapliga frågeställningar inom ämnesområdet
• använda aktuella dataansalysmetoder inom området och visa på förståelse och tolkning av resultaten i lämpliga data

Värderingsförmåga och förhållningssätt

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• diskutera aktuell forskning på området samt hur den nya kunskapen kan komma att tillämpas kliniskt
• bedöma om analyser av molekylära data är tillförlitligt när det kommer till diagnostik av patienter
• tillämpa ett etiskt och vetenskapligt förhållningssätt

Innehåll

Kursen syftar till att ge bred kunskap om de molekylära teknologier och analysmetoder som används för att kartlägga kroppens molekyler, med fokus på dess användning inom precisionsmedicin. Kursen ger kunskap om hur molekylära och epidemiologiska/biostatistiska metoder kan användas för att förstå biologiska processer som ligger bakom uppkomsten av sjukdomar, samt för att identifiera molekylära biomarkörer som kan används inom precisionsmedicin.  Kursen syftar till att ge bred kunskap inom precisionsmedicin med fokus på teknologier och metoder för att diagnostisera patienter, skräddarsy behandling och följa upp patienter efter behandling, men även på att identifiera personer med hög sjukdomsrisk för preventiv behandling samt molekyler som kan bli kandidater för nya behandlingar.

Förutom teoretiska moment innehåller kursen datorbaserade laborationer. Övningarna ger erfarenhet av praktiskt användande av metoder och algoritmer inom området på olika typer av data inom epidemiologi och precisionsmedicin; även inkluderande grundläggande algoritmer och metoder inom statistisk modellering, maskininlärning och artificiell intelligens. Kursen ger inblick i när och hur olika metoder används och vilka resultat som man kan förvänta sig. Kursen ger en översikt över aktuell användning av molekylära metoder inom precisionsmedicin idag, samt dess användning inom forskning och för framtida kliniska applikationer.  

Seminarier tillsammans med forskare kommer även att ge studenterna möjlighet att diskutera aktuella problemställningar och möjligheter inom precisionsmedicin.

Undervisning

Undervisningen ges på engelska i form av föreläsningar och obligatoriska seminarier, datorövningar samt andra teoretiska och praktiska moment samt presentationer.

Examination

Examinations­former

Skriftlig tentamen, laborationer, inlämningsuppgifter, presentationer och seminarier.

Undantag från examina­tions­form

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t ex vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare.

Krav för godkänt

För godkänd kurs krävs godkänt resultat i skriftliga examinationer, laborationer, inlämningsuppgifter, presentationer och seminarier inom samtliga delämnen, samt godkänt deltagande i de obligatoriska momenten.