Utrustning

Mass spektrometri

Masspektrometri (MS) mäter och sorterar joner baserat på deras förhållande mellan massa och laddning. I vårt labb använder vi denna teknik för global och riktad proteomik med hjälp av en Q exactive HF Orbitrap respektive en Sciex 6500 Q-trap. Masspektrometri kan också användas för att kvantifiera små molekyler, t.ex. läkemedelsmetaboliter, transportörssubstrat med mera. Vi gör detta rutinmässigt på våra Waters Xevo TQ MS och Waters Xevo TQ-S micro.

Robotar för vätskehantering

De robotsystem för vätskehantering som finns tillgängliga i vårt labb är en Hamilton STAR och en Tecan EVO200. Dessa robotar används främst för undersökningar av in vitro-egenskaper för absorption, distribution, metabolism och eliminering (ADME) av ledande läkemedelsmolekyler och läkemedelskandidater inom UDOPP-plattformen, men är också tillgängliga för akademiska forskningsprojekt. Dessa robotsystem möjliggör vätskehantering med medelhög till hög genomströmning och ökar precisionen och noggrannheten i analyserna.

Spark multimode plate reader

För att hantera primära celler, vävnader och cellinjer är vårt laboratorium väl utrustat med följande instrument:

• LAF-bänkar, CO2-kubatorer, tankar med flytande N2 och frysar med extremt låg temperatur;

• Cellavbildning med faskontrastmikroskopi;

• Snabb bestämning av cellantal och viabilitet genom: NucleoCounter® (baserad på fluorescerande DNA-färgning), Cellometer® Vision (baserad på bildcytometri i kombination med ljusfälts- och fluorescensdetektorer) och Countess® automatiserad cellräknare;

• TEER-mätningar (Trans epithelial electrical resistance).

Vårt renrum är särskilt utformat och byggt för cellodling och cellhantering. I drift uppfyller det kraven i klass B för ett renrum. Luften inuti recirkuleras ständigt genom HEPA-filter (High Efficiency Particulate Air) för att avlägsna partiklar från renrummet. Dessutom gör våra implementerade regler och policyer tillsammans med instrument av hög standard det möjligt för oss att upprätthålla cellodling i antibiotikafritt medium. För att upprätthålla högkvalitativ forskning och minimal påverkan av föroreningar övervakar vi regelbundet våra cellinjer för att säkerställa deras funktion och äkthet.

Ussingkammare

I Ussingkammare monteras ett prov av mänsklig tarm mellan två sammankopplade kammare som möjliggör studier av permeabilitet och transport över tarmbarriärerna. I dessa kammare studerar vi permeabiliteten hos småmolekylära läkemedel, metaboliter, peptider, biologiska läkemedel och olika formuleringar över slemhinnan i den mänskliga tarmen. Genom att använda mänsklig tarmvävnad möjliggörs en in vivo-liknande bedömning av interaktioner med olika aspekter av tarmbarriären, såsom slem, metaboliserande enzymer och tight junctions, vilket inte är möjligt i andra in vitro-system. Dessutom kan vävnadens toxiska och inflammatoriska reaktioner på läkemedel och formuleringar övervakas. Genom samarbeten med gastroenterologer på Akademiska sjukhuset i Uppsala har vi tillgång till prover av mänsklig tarm från tolvfingertarmen, jejunum och tjocktarmen, vilket möjliggör regionala studier av tarmens permeabilitet. Förändringar i tarmens barriärfunktion vid hälsa och sjukdom hos olika patientpopulationer undersöks.