Stairs labb
Vi är intresserade av att förstå hur mikrobiella eukaryoter – även kända som "protister" – har utvecklats för att trivas i syrefattiga miljöer. Syrefattiga miljöer är viktiga ekosystem som är värd för olika mikrobiella samhällen. Interaktionerna mellan dessa mikrober kan ha stora miljöpåverkan på globala geokemiska kol-, kväve- och svavelcykler. Dessutom kan interaktionerna mellan dessa mikrober i djurs anaeroba matsmältningskanaler ha stora hälso- och veterinära konsekvenser. Att leva utan syre kan vara utmanande. För att överleva i sådana miljöer arbetar vissa organismer tillsammans med hjälp av metabolisk syntrofi – en typ av mutualistisk symbios där det finns en metabolisk arbetsfördelning mellan individer i ett samhälle. Vi vet att metabolisk syntrofi är vanlig bland anaeroba prokaryoter, men mindre är känt om syntrofins roll i mikrobiella eukaryoters överlevnad i dessa miljöer. Med hjälp av en kombination av genomiska och cellulära biologiska tekniker strävar vi efter att upptäcka och karakterisera protist:mikrob-interaktioner från olika anaeroba miljöer, såsom anoxiska akvatiska sediment. Vi studerar också de strategier som protister och ryggradslösa djur använder för att överföra elektroner utan syre.
Populärvetenskaplig presentation
Under de senaste 60 åren har syrehalterna i världshaven minskat med två procent, vilket har lett till skapandet av mer syrefattiga miljöer. Vi försöker förstå hur mikroorganismer samarbetar för att överleva i dessa miljöer och vilken roll de spelar i att producera skadliga växthusgaser som metan. Syrefattiga miljöer är domänen för mikroberna, inklusive prokaryota (t.ex. bakterier och arkéer) och encelliga eukaryoter (eller "protister"). För att leva i dessa miljöer samarbetar dessa organismer ofta där de utbyter näringsämnen för att överleva. Tillsammans skapar de också en rad gaser, såsom lustgas och metan, vilket är en kraftfull växthusgas. Dessa gaser sprids ut i atmosfären och påverkar klimatet och den globala kretsloppet av kväve och kol. För närvarande vet forskare mycket om prokaryota celler i syrefattiga miljöer. Kunskapen om hur eukaryota celler fungerar är mycket begränsad. Vi försöker fylla denna kunskapslucka: Vilka andra encelliga organismer lever i dessa miljöer? Interagerar de med varandra? Hur hittar de varandra? Vilka molekyler flödar mellan organismer? Och hur påverkas de av klimatets förändrade temperatur, syrehalter och pH-värde? En mer omfattande förståelse av hur syrefattiga miljöer fungerar är viktig för att kunna förutsäga hur de kan påverka haven och klimatet i framtiden.
Forskning
- Genomanalys av breviate protister.
- Mikrobiell ekologi hos protistmikrokosmos.
- Alternativ quinonebiosyntes och användning i svampdjur och protister.