Xingqi Chen – Studier av cellers öden genom att undersöka enskilda celler

Vår forskning fokuserar på att förstå vad som bestämmer en cells öde under utvecklingen och vid sjukdomar som cancer. Målet är att få en bättre förståelse av tumörtillväxt, vilket kan bidra till utvecklingen av nya behandlingar.

De senaste framstegen inom single-cell-teknologier – såsom single-cell ATAC-seq och single-cell RNA-seq – har gjort det möjligt att utforska skillnader mellan celler på epigenetisk, mRNA- och proteinnivå i enstaka celler. Men en cells tillstånd bestäms av det komplexa samspelet mellan arvsmassan, epigenetisk reglering, mRNA och proteiner. Det innebär att om man bara analyserar ett molekylärt lager så får man en ofullständig bild av cellens identitet.

För att uppnå en heltäckande förståelse av cellulär heterogenitet intergrerar vi i forskning flera lager av molekylär information – inklusive cellkärnans arkitektur, epigenetik, transkriptomik och proteomik – från samma enskilda cell. På så sätt vill vi rekonstruera ett detaljerat nätverk som reglerar cellens funktion och öde.

Mekanismer bakom cellers öden

Det övergripande målet med vår forskning är att kartlägga de mekanismer som styr cellödesbeslut under utvecklingen och vid sjukdomar hos människa. Vi utvecklar banbrytande singel-cell-teknologier för att systematiskt karakterisera cellulär heterogenitet och identifiera de centrala regulatoriska faktorer som kontrollerar specifika cellöden.

En central fråga i vårt arbete är varför celler i människokroppen, trots att de delar en identisk dna-sekvens, har så olika funktion. Till exempel: vad är det som avgör varför vissa celler omvandlas till cancerceller medan andra förblir normala? Och vilka molekylära mekanismer gör det möjligt för stamceller att differentiera till distinkta celltyper?

Epigenetisk reglering

Vårt mål är att identifiera de epigenetiska mekanismer som reglerar cellers öde i samband med sjukdomar som cancer. Vi har två huvudsakliga forskningsinriktningar:

  1. Att kartlägga tumörmikromiljön i flera primära cancerformer med hjälp av avancerade single-cell-teknologier.
  2. Att utveckla nya single-cell-plattformar för att möjliggöra djupare, mer exakta och multidimensionella cellulära analyser.

Den kunskap som genereras genom vår forskning kommer att ge en djupare förståelse av cancertillväxt på singelcellsnivå och kan bidra till utvecklingen av nya diagnostiska verktyg och behandlingsstrategier. Vårt långsiktiga mål är att identifiera molekylära mål för precisionsinriktad cancerbehandling.

Mer information på webbsidan: www.chenlabuppsala.com

Senast uppdaterad:

FÖLJ UPPSALA UNIVERSITET PÅ

Uppsala universitet på facebook
Uppsala universitet på Instagram
Uppsala universitet på Youtube
Uppsala universitet på Linkedin