Inverkan av värdens egenskaper på tarmens mikrobiom

Projektbeskrivning

Allt fler bevis har visat att tarm­mikrobiomet är inblandat i utvecklingen av gastro­intestinala, kardio­vaskulära och neurologiska sjukdomar. Genom att undersöka hur värdens egenskaper och exponering påverkar tarmflorans samman­sättning kan man klargöra mekanismen som kopplar tarmfloran till hälsa och hjälpa oss att identifiera vad som känne­tecknar en frisk eller en dysbiotisk tarmflora. I det här projektet använder vi förfinade exponerings­mätningar, t.ex. mätningar som härrör från sensorer eller nationella registerdata, i kombination med data från deep shotgun-metagenomik av avförings­prover i stora befolknings­baserade studier för att undersöka sambanden med samman­sättningen av tarm­mikro­biomet. Vi tillämpar också mendelsk randomiserings­analys för att komplettera våra observations­samband med bevis för en kausal effekt.

För att undersöka sambandet mellan sömnapné och fysisk aktivitet och tarm­mikro­biomet använde vi parametrar för obstruktiv sömn­apné som mätts med respiratorisk polygraf och fysisk aktivitet som mätts med accelerometer hos SCAPIS-deltagare. Nästa steg i vår studie om fysisk aktivitet är att utföra en mendelsk randomiserings­analys, vilket möjlig­gjordes tack vare de pågående genom­omfattande associations­­studierna av tarm­mikro­biomet som genom­fördes i vår grupp.

En välkänd faktor som påverkar mikrobiomet är antibiotika­användning. Det är dock oklart hur länge antibiotika påverkar tarm­mikro­biomet. Vi strävar efter att ge viktiga insikter i denna fråga genom att använda data från det svenska förskrivnings­registret, som fångar upp all utskriven antibiotika i Sverige sedan juli 2005. Vi kommer att använda register­data tillsammans med tarm­mikro­biomdata från deltagare från SCAPIS, SIMPLER och MOS för att undersöka sambandet mellan tidigare antibiotika­användning och tarm­mikrobiom.