Marie Allen – Nya metoder för kriminaltekniska och historiska DNA-analyser
Kriminaltekniska prover som samlats från brottsplatser eller äldre historiska material har ofta varit utsatta för en mycket ogynnsam miljö under lång tid. Det blir därför ofta en stor utmaning att utföra en DNA-analys. Det DNA som kan utvinnas ur provet förekommer ofta i mycket liten mängd och kan vara nedbrutet och skadat. Syftet med vår forskning är att ta fram känsliga och robusta metoder för att analysera dessa utmanande forensiska och historiska provmaterial.
Vi arbetar med metoder där DNA från cellernas mitokondrier analyseras, vilket ger hög känslighet eftersom det finns hundratals kopior av mitokondriellt DNA (mtDNA) i varje cell. Vi arbetar även med markörer som används för att analysera DNA i cellkärnan. Med analyser av kärn-DNA (nukleärt DNA, nDNA) kan DNA-profiler i större utsträckning särskiljas från varandra och ger då ett mycket högt bevisvärde än analyser av mtDNA.
Analyser av gammalt och skadat DNA
Med målet att förbättra kriminaltekniska DNA-analyser har vi vidareutvecklat flera metoder som bygger på olika molekylärbiologiska tekniker samt nästa generations sekvenseringsteknik, NGS. Med de nya metoderna kan vi analysera mycket små mängder DNA, liksom skadat och nedbrutet DNA. De nya metoderna kan även användas för genetiska analyser av äldre material för att identifiera historiska personer.
Som en ultimat test för våra metoder har vi undersökt benprover från Heliga Birgitta och hennes dotter Katarina, Nicolaus Copernicus och Carin Göring för att kunna påvisa eller avfärda identitet eller släktskap. Vi har även analyserat ännu äldre benmaterial i ett större samarbetsprojekt, där prover från vikingatida båtgravar funna på ön Salme i Estland har utvärderats för släktskap och utseende. Våra känsliga metoder har även kommit till användning undersöka ursprunget av odlade celler inom cancerforskning
Gruppmedlemmar
Publikationer
Ingår i Genes, 2024
- DOI för Evaluation of Storage Conditions and the Effect on DNA from Forensic Evidence Objects Retrieved from Lake Water
- Ladda ner fulltext (pdf) av Evaluation of Storage Conditions and the Effect on DNA from Forensic Evidence Objects Retrieved from Lake Water
Complete Mitochondrial DNA Genome Variation in the Swedish Population
Ingår i Genes, s. 1989-1989, 2023
- DOI för Complete Mitochondrial DNA Genome Variation in the Swedish Population
- Ladda ner fulltext (pdf) av Complete Mitochondrial DNA Genome Variation in the Swedish Population
Ingår i Forensic Science International, 2023
- DOI för Forensic prediction of sex, age, height, body mass index, hip-to-waist ratio, smoking status and lipid lowering drugs using epigenetic markers and plasma proteins
- Ladda ner fulltext (pdf) av Forensic prediction of sex, age, height, body mass index, hip-to-waist ratio, smoking status and lipid lowering drugs using epigenetic markers and plasma proteins
The DNA-Buster: The evaluation of an alternative DNA recovery approach
Ingår i Forensic Science International, 2023
- DOI för The DNA-Buster: The evaluation of an alternative DNA recovery approach
- Ladda ner fulltext (pdf) av The DNA-Buster: The evaluation of an alternative DNA recovery approach
Evaluation of Different Cleaning Strategies for Removal of Contaminating DNA Molecules
Ingår i Genes, 2022
- DOI för Evaluation of Different Cleaning Strategies for Removal of Contaminating DNA Molecules
- Ladda ner fulltext (pdf) av Evaluation of Different Cleaning Strategies for Removal of Contaminating DNA Molecules
Ingår i International Journal of Molecular Sciences, 2022
- DOI för The Value of Whole-Genome Sequencing for Mitochondrial DNA Population Studies: Strategies and Criteria for Extracting High-Quality Mitogenome Haplotypes
- Ladda ner fulltext (pdf) av The Value of Whole-Genome Sequencing for Mitochondrial DNA Population Studies: Strategies and Criteria for Extracting High-Quality Mitogenome Haplotypes
Ingår i Forensic Science International, 2020
Population genomics of the Viking world
Ingår i Nature, s. 390-+, 2020
Mitochondrial DNA analysis of a Viking age mass grave in Sweden
Ingår i Forensic Science International, s. 268-274, 2019
Evaluation of the precision ID whole MtDNA genome panel for forensic analyses
Ingår i Forensic Science International, s. 21-25, 2018
Results of a collaborative study on DNA identification of aged bone samples
Ingår i Croatian Medical Journal, s. 203-213, 2017
Analysis of Mitochondrial DNA from a Burned, Ninhydrin-Treated Paper Towel
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 828-832, 2016
Comparison of DNA polymerases for improved forensic analysis of challenging samples
Ingår i Forensic Science International, s. 55-59, 2016
Multiplex pyrosequencing of InDel markers for forensic DNA analysis
Ingår i Electrophoresis, s. 3039-3045, 2016
Origin of the U87MG glioma cell line: Good news and bad news
Ingår i Science Translational Medicine, 2016
Ingår i Legal Medicine, s. 539-546, 2015
Forensic Analysis of Mitochondrial and Autosomal Markers Using Pyrosequencing®.
Ingår i Methods in Molecular Biology, s. 379-396, 2015
Ingår i Acta Paediatrica, s. 910-915, 2015
Collecting and Preserving Biological Samples from Challenging Environments for DNA Analysis
Ingår i Biopreservation and Biobanking, s. 17-22, 2014
Evaluation of the Impact of Different Visualization Techniques on DNA in Fingerprints
Ingår i Journal of Forensic Identification, s. 189-204, 2013
Mitochondrial DNA analysis of Swedish population samples
Ingår i International journal of legal medicine, s. 1097-1099, 2013
Ingår i Journal of Interventional Cardiac Electrophysiology, s. 11-18, 2012
An Analysis of the Alleged Skeletal Remains of Carin Göring
Ingår i PLOS ONE, 2012
- DOI för An Analysis of the Alleged Skeletal Remains of Carin Göring
- Ladda ner fulltext (pdf) av An Analysis of the Alleged Skeletal Remains of Carin Göring
Ingår i PLOS ONE, 2012
- DOI för Automated Genotyping of Biobank Samples by Multiplex Amplification of Insertion/Deletion Polymorphisms
- Ladda ner fulltext (pdf) av Automated Genotyping of Biobank Samples by Multiplex Amplification of Insertion/Deletion Polymorphisms
Ingår i Läkartidningen, s. 39-39, 2012
Ingår i Open Forensic Science Journal, s. 13-22, 2012
Analysis of the putative remains of a European patron saint--St. Birgitta
Ingår i PLoS ONE, 2010
Forensic analysis of autosomal STR markers using Pyrosequencing
Ingår i Forensic Science International, s. 122-129, 2010
Ingår i BioTechniques, s. 671-678, 2009
Genetic identification of putative remains of the famous astronomer Nicolaus Copernicus
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 12279-12282, 2009
Y chromosomal STR analysis using Pyrosequencing technology
Ingår i Forensic Science International, s. 119-124, 2009
Ingår i Forensic Science International, s. 1-8, 2008
Ingår i BMC Cancer, s. 214, 2008
SNP typing using Molecular Inversion Probes
Ingår i Forensic Science International, s. 473-475, 2008
Ingår i Forensic Science International, s. 35-43, 2007
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 937-938, 2006
Nuclear and mitochondrial DNA quantification of various forensic materials
Ingår i Forensic Science International, s. 56-64, 2006
Quantification of mtDNA mixtures in forensic evidence material using pyrosequencing
Ingår i International journal of legal medicine, s. 383-390, 2006
Sensitive forensic analysis using the Pyrosequencing technology
Ingår i Progress in Forensic Genetics, s. 625-627, 2006
STR sequence variants revealed by Pyrosequencing technology
Ingår i Excerpta Medica, s. 669-671, 2006
A DNA microarray system for forensic SNP analysis
Ingår i Forensic Science International, s. 111-121, 2005
Forensic analysis of the mitochondrial coding region and association to disease.
Ingår i International journal of legal medicine, s. 314-315, 2005
Forensic casework analysis using the HVI/HVII mtDNA linear array assay.
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 548-554, 2005
Mitochondrial D-loop and coding sequence analysis using pyrosequencing
Ingår i Methods in Molecular Biology, s. 179-196, 2005
Universal tag arrays in forensic SNP analysis.
Ingår i Methods in Molecular Biology, s. 141-154, 2005
Analysis of the mitochondrial genome in sudden infant death syndrome.
Ingår i Acta Paediatr, s. 386, 2003
Rapid quantification and sex determination of forensic evidence materials
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 1280-1287, 2003
Mitochondrial sequence analysis for forensic identification using pyrosequencing technology.
Ingår i Biotechniques, s. 124, 2002
Mitochondrial sequence analysis for forensic identification using Pyrosequencing technology
Ingår i BioTechniques, s. 124-6, 128, 130-3, 2002
Real-Time DNA Quantification of Nuclear and Mitochondrial DNA in Forensic Analysis
Ingår i BioTechniques, s. 402-411, 2002
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 1210-1231, 2000
Ingår i Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, s. 1722-1728, 1999
Ingår i Hereditas, s. 161-167, 1998
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 453-464, 1998
Ingår i Tissue Antigens, s. 32-37, 1996
Allele-specific HLA-DRB1 amplification of forensic evidence samples with mixed genotypes
Ingår i BioTechniques, s. 454-463, 1995
Analysis of HLA-Class II DQA1, DQB1, DRB1 and DPB1 in Italian Multiple Sclerosis Patients
Ingår i European journal of immunogenetics, s. 171-178, 1995
A comprehensive polymerase chain reaction-oligonucleotide typing system for the HLA class I A locus
Ingår i Human Immunology, s. 25-32, 1994
Ingår i Human Immunology, s. 41-8, 1994
PCR-based DNA typing of saliva on stamps and envelopes
Ingår i BioTechniques, s. 546-552, 1994
Frequency of four cystic fibrosis mutations in a Swedish population
Ingår i Acta Paediatrica, s. 609, 1993
Genetic typing of HLA class II genes in Swedish populations: application to forensic analysis
Ingår i Journal of Forensic Sciences, s. 554-70, 1993
Sequencing of in vitro amplified DNA
Ingår i Methods in Enzymology, s. 3-16, 1993
Ingår i PCR methods and applications, s. 91-8, 1991
Screening for the major cystic fibrosis mutation in non-Caucasian populations
Ingår i American Journal of Human Genetics, s. 903-4, 1991