Olga Vinnere Pettersson
Projektledare vid Institutionen för immunologi, genetik och patologi; Faciliteter; Uppsala genomcenter
- Telefon:
- 018-471 44 93
- Mobiltelefon:
- 070-425 01 34
- E-post:
- olga.pettersson@igp.uu.se
- Besöksadress:
- BMC, Husargatan 3
75122 Uppsala - Postadress:
- Box 815
75108 Uppsala
- ORCID:
- 0000-0002-5597-1870
Kort presentation
Jag är vetenskaplig ledare för SciLifeLabs strategiska område planetärbiologi, ett tvärdiscipinärt initiativ som syftar till att kombinera olika typer av data, genomiska, molekylära såväl som ekologiska, för att lyfta svensk biodiversitetsforskning till den internationella frontlinjen.
Jag har 20 års erfarenhet inom de novo-sekvensering och icke-modellsytemsgenomik, varav 13 år som NGS-expert vid Uppsala Genome Center.
Nyckelord
- Genomik
- NGS
- icke-modellarter
- biodiversitet
Biografi
Jag är forskare med bakgrund i biologi och mykologi, med doktorsexamen från Uppsala universitet inom taxonomi av växtassocierade svampar. Efter arbete inom svampgenomik vid SLU har jag sedan 2012 varit vid SciLifeLabs genomikplattform, med expertis i långtidsläsningssekvensering och NGS. Jag har deltagit i internationella projekt som Vertebrate Genome Project, Earth Biogenome Project och European Reference Genome Atlas, där jag är vice ordförande. För närvarande leder jag UUs och SciLifeLabs arbete i EU-projektet Biodiversity Genomics Europe och utvecklar ett paneuropeiskt nätverk för biodiversitetssekvensering. Som vetenskaplig ledare för SciLifeLabs stretigiska område planetärbiologi arbetar jag för att integrera teknologier och främja öppen vetenskap kring biologisk mångfald.
Publikationer
Urval av publikationer
Ingår i GigaScience, 2025
- DOI för Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation
Ingår i GigaScience, 2022
- DOI för Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing
- Ladda ner fulltext (pdf) av Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing
Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022
- DOI för Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
- Ladda ner fulltext (pdf) av Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
Ingår i F1000Research, 2018
- DOI för Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
Ingår i Journal of Bacteriology, s. 7426-7439, 2006
Senaste publikationer
Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
Ingår i Molecular Ecology, 2025
- DOI för Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
Ingår i GigaScience, 2025
- DOI för Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation
A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
Ingår i G3, 2025
- DOI för A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
- Ladda ner fulltext (pdf) av A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
Ingår i Molecular Ecology, 2024
- DOI för Orthopteran Neo-Sex Chromosomes Reveal Dynamics of Recombination Suppression and Evolution of Supergenes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Orthopteran Neo-Sex Chromosomes Reveal Dynamics of Recombination Suppression and Evolution of Supergenes
Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
Ingår i Molecular biology and evolution, 2024
- DOI för Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
Alla publikationer
Artiklar i tidskrift
Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
Ingår i Molecular Ecology, 2025
- DOI för Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genetic Adaptation to Brackish Water and Spawning Season in European Cisco
A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
Ingår i G3, 2025
- DOI för A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
- Ladda ner fulltext (pdf) av A chromosome-level genome assembly of the European green toad (Bufotes viridis)
Ingår i Molecular Ecology, 2024
- DOI för Orthopteran Neo-Sex Chromosomes Reveal Dynamics of Recombination Suppression and Evolution of Supergenes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Orthopteran Neo-Sex Chromosomes Reveal Dynamics of Recombination Suppression and Evolution of Supergenes
Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
Ingår i Molecular biology and evolution, 2024
- DOI för Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genetic Causes and Genomic Consequences of Breakdown of Distyly in Linum trigynum
Ecological genomics in the Northern krill uncovers loci for local adaptation across ocean basins
Ingår i Nature Communications, 2024
- DOI för Ecological genomics in the Northern krill uncovers loci for local adaptation across ocean basins
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ecological genomics in the Northern krill uncovers loci for local adaptation across ocean basins
Ingår i Frontiers in Genetics, 2023
- DOI för The draft genome of the microscopic Nemertoderma westbladi sheds light on the evolution of Acoelomorpha genomes
- Ladda ner fulltext (pdf) av The draft genome of the microscopic Nemertoderma westbladi sheds light on the evolution of Acoelomorpha genomes
Ingår i GigaScience, 2022
- DOI för Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing
- Ladda ner fulltext (pdf) av Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing
Genomic analyses of the Linum distyly supergene reveal convergent evolution at the molecular level
Ingår i Current Biology, s. 4360-4371000000, 2022
- DOI för Genomic analyses of the Linum distyly supergene reveal convergent evolution at the molecular level
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genomic analyses of the Linum distyly supergene reveal convergent evolution at the molecular level
Ingår i Insects, 2022
- DOI för The Carniolan Honeybee from Slovenia-A Complete and Annotated Mitochondrial Genome with Comparisons to Closely Related Apis mellifera Subspecies
- Ladda ner fulltext (pdf) av The Carniolan Honeybee from Slovenia-A Complete and Annotated Mitochondrial Genome with Comparisons to Closely Related Apis mellifera Subspecies
Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022
- DOI för Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
- Ladda ner fulltext (pdf) av Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
Metagenomic analysis of bacteria in stallion semen
Ingår i Animal Reproduction Science, 2020
A hybrid de novo genome assembly of the honeybee, Apis mellifera, with chromosome-length scaffolds
Ingår i BMC Genomics, 2019
- DOI för A hybrid de novo genome assembly of the honeybee, Apis mellifera, with chromosome-length scaffolds
- Ladda ner fulltext (pdf) av A hybrid de novo genome assembly of the honeybee, Apis mellifera, with chromosome-length scaffolds
Ingår i Environmental Microbiology, s. 2485-2498, 2019
- DOI för Confident phylogenetic identification of uncultured prokaryotes through long read amplicon sequencing of the 16S-ITS-23S rRNA operon
- Ladda ner fulltext (pdf) av Confident phylogenetic identification of uncultured prokaryotes through long read amplicon sequencing of the 16S-ITS-23S rRNA operon
Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
Ingår i F1000Research, 2018
- DOI för Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
- Ladda ner fulltext (pdf) av Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
Ingår i Genome Research, s. 697-708, 2017
Phylogenetic analysis of Monascus and new species from honey, pollen and nests of stingless bees
Ingår i Studies in mycology, s. 29-51, 2017
- DOI för Phylogenetic analysis of Monascus and new species from honey, pollen and nests of stingless bees
- Ladda ner fulltext (pdf) av Phylogenetic analysis of Monascus and new species from honey, pollen and nests of stingless bees
Ingår i GigaScience, 2015
- DOI för De novo assembly of Dekkera bruxellensis: a multi technology approach using short and long-read sequencing and optical mapping
- Ladda ner fulltext (pdf) av De novo assembly of Dekkera bruxellensis: a multi technology approach using short and long-read sequencing and optical mapping
Ingår i Environmental Microbiology, s. 496-513, 2015
- DOI för Genome and physiology of the ascomycete filamentous fungus Xeromyces bisporus, the most xerophilic organism isolated to date
- Ladda ner fulltext (pdf) av Genome and physiology of the ascomycete filamentous fungus Xeromyces bisporus, the most xerophilic organism isolated to date
Ingår i PLOS ONE, 2013
- DOI för Transcriptome of the Alternative Ethanol Production Strain Dekkera bruxellensis CBS 11270 in Sugar Limited, Low Oxygen Cultivation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Transcriptome of the Alternative Ethanol Production Strain Dekkera bruxellensis CBS 11270 in Sugar Limited, Low Oxygen Cultivation
Ingår i Journal of Bacteriology, s. 7426-7439, 2006
Ingår i Journal of Bacteriology, s. 6155-6165, 2005
Artiklar, forskningsöversikt
Ingår i GigaScience, 2025
- DOI för Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation
- Ladda ner fulltext (pdf) av Best-practice guidance for Earth BioGenome Project sample collection and processing: progress and challenges in biodiverse reference genome creation